Что такое пептид?

Пептидное связывание представляет собой амидную связь между полипептидом и белковыми молекулами в аминокислотах, также известную как пептидная цепь. Ковалентная связь характерна для пептидного связывания и необходима для нормального пептидного синтеза. Другими словами, пептидные связи связывают аминокислоты в определенном порядке, который создает белковые полимеры и направляет образование уникальных трехмерных (трехмерных структур). Без пептидного связывания важные реакции с участием аминокислот блокируются.

С точки зрения молекулярной химии, связывание двух или более аминокислот образует пептидную молекулу. Пептидная связь образуется там, где молекула карбоновой кислоты реагирует с аминогруппой в следующей молекуле аминокислоты. Полученная молекула представляет собой дипептид - две аминокислоты, связанные друг с другом посредством пептидного связывания. Пептидные связи уникальны для аминогруппы, с которой они связаны.

Процесс пептидного синтеза, или синтеза белка, включает в себя образование пептидной цепи и серию биохимических реакций с различными типами молекул рибонуклеиновой кислоты (РНК) - мессенджер, рибосомная и трансферная РНК - и аминокислоты. Синтез белка происходит, когда рибосома транслирует РНК-мессенджер (мРНК), и после трансляции между двумя аминокислотными молекулами образуется пептидная связь. Каждый раз, когда происходит связывание пептида, новая аминокислота добавляется к так называемой полипептидной цепи. При некоторых обстоятельствах множественные рибосомы могут транслировать одну и ту же цепь мРНК, что приводит к дупликативному связыванию пептидов и, таким образом, к дублированию пептидных цепей.

Когда синтез белка завершен, полипептидная цепь высвобождается в результате ферментативно-катализируемой реакции и образует трехмерную структуру, которая становится биологически активным белком. Эффективность некоторых антибиотиков, используемых для лечения бактериальных инфекций, основана на связывании пептидов во время синтеза белка. Препятствуя образованию белков, необходимых бактериям, антибиотики могут остановить размножение бактерий.

Антибиотики, которые ингибируют пептидную связь, также ингибируют синтез белка. Многие антибиотики не могут специфически воздействовать на нездоровые клетки, поэтому они в конечном итоге воздействуют на здоровые клетки во время процесса, хотя есть некоторые лекарства, которые воздействуют только на бактериальные клетки, воздействуя на рибосомы бактерий. Механизм действия антибиотиков может предотвращать транскрипцию РНК или рост пептидных цепей путем ингибирования образования пептидных связей. Другие механизмы включают неполное кодирование белка и предотвращение транскрипционной РНК (тРНК), все из которых основаны на биохимическом опосредованном связывании пептидов.

Потребность в компаниях по синтезу пептидов возникла в результате спроса со стороны научных и исследовательских групп, занимающихся разработкой новых антибиотиков. Требуемые пептидные услуги включают в себя индивидуальное секвенирование с масс-спектрометрией или разработку каталога пептидов или библиотеки пептидов. Некоторые из этих поставщиков услуг также поставляют модифицированные пептиды и материалы для синтеза.