Что такое секвенирование рибосомальной РНК?

Секвенирование рибосомальной рибонуклеиновой кислоты (РНК) представляет собой процесс определения содержания последовательности нуклеиновых кислот, составляющих рибосому. Почти во всех клетках рибосомы представляют собой макромолекулы, которые строят белки для поддержания работы клетки. Они состоят из РНК и множества белков, которые помогают РНК работать более эффективно. Большая часть этого материала в рибосоме непосредственно участвует в построении белка, поэтому определение последовательности рибосомной РНК может дать представление об окончательной структуре молекулы, а также о том, как она работает. Функция и общая структура РНК хорошо сохраняются между различными видами, но исходная последовательность - нет, и изменения в последовательности могут быть использованы для получения информации об эволюции рибосомы.

Независимо от того, используются ли они для бактериальных рибосом или для более сложных организмов, секвенирование рибосомной РНК осуществляется аналогичным образом. Как только РНК отделена от рибосомы, она многократно дублируется, а затем разбивается на мелкие фрагменты, последовательности которых можно легко идентифицировать. Эти небольшие фрагменты последовательности затем повторно собирают для генерации вновь определенной последовательности. Задача усложняется по мере того, как последовательность становится длиннее, но процесс для рибосомальной РНК все еще относительно прост, что сравнительно мало. Нет никаких гарантий, что первая попытка секвенирования рибосомальной РНК будет правильной с первого раза, поэтому обычно выполняется несколько попыток проверить качество данных.

Данные, полученные в результате секвенирования рибосомной РНК, могут быть использованы для различных целей, но одна из наиболее распространенных - для идентификации бактерий. Бактериальная рибосомная РНК, в частности, высоко консервативна между видами, поэтому секвенирование позволяет объединить уникальные характеристики вида в профиль для справки. Этот профиль можно использовать для быстрой и простой идентификации определенного типа бактерий, тест, который может помочь в диагностике и лечении больных. С появлением более совершенной технологии секвенирования этот подход стал более распространенным в диагностике.

Второе влияние, которое рибосомная РНК-секвенирование может оказать на здоровье человека, заключается в оказании помощи в разработке лекарств и лекарственных средств. Последовательности бактериальной рибосомальной РНК имеют много подпоследовательностей, которые являются уникальными для бактерий, поэтому воздействие на эти области антимикробными лекарственными средствами может убивать бактерии, не причиняя вреда людям. Данные по секвенированию рибосомной РНК сами по себе не дают достаточных данных для создания лекарств, но дают ученым регионы, на которых следует сосредоточиться для будущих исследований и разработки лекарств. Могут быть сконструированы лекарственные молекулы, которые присоединяются к последовательностям и блокируют рибосому. Различные современные лекарства используют эту технику для борьбы с болезнями.