Vad är molekylär grafik?
Termen grafik hänvisar till ritningar eller bilder som skapas enligt matematikregler. Molekylär hänvisar till molekyler och deras komponenter. Därför är en betydelse av molekylgrafik (MG) studien av molekyler genom visualisering av själva molekylerna och deras komponentdelar. Molekylär grafik hänvisar också till de tredimensionella avbildningarna av molekyler som är gjorda för att undersöka dem och förstå deras svar under reaktioner och interaktioner
Molekylär grafik har vissa fördelar jämfört med fysiska modeller. Fysiska modeller kan orsaka problem eftersom strukturen är dold, det finns ett falskt intryck av flexibilitet, överlagring är nästan omöjligt, eller de är helt enkelt för klumpiga att arbeta med. Alla dessa problem kan övervinnas med datorgrafik.
En viktig användning av molekylgrafik är i studien av proteiner och nukleinsyror. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) protein databank (PDB), där experimentellt bestämd information om strukturerna i nukleinsyror, proteiner och komplexa enheter lagras för allmän tillgång. Från den 27 april 2010 fanns det 64 932 strukturer i databasen. RCSB populariserar sin funktion med en inbjudan till besökare att bygga 3D-virusmodeller vid Rutgers University på Rutgers Day. RCSB sponsrar också proteinmodelleringsprövningar vid regionala vetenskapsolympiader i USA. Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) är den internationella organisationen till vilka grupper som RCSB; PDBe, den europeiska motsvarigheten; och PDBj, den japanska motsvarigheten; tillhöra.
Ett annat område där molekylgrafik är oerhört viktigt är utformningen av läkemedel. Molekylär grafikassisterad läkemedelsdesign - även känd som datorassisterad läkemedelsdesign (CADD), datorassisterad molekylär design (CAMD) eller strukturbaserad läkemedelsdesign (SBDD) - är ett av de viktigaste forskningsintressen för fakulteten som är involverade i Virginia Commonwealth University Medicinal Chemistry specialisering i doktorandprogram för farmaceutiska vetenskaper, till exempel.
Specialiserad programvara för att skapa molekylär grafik, kallad molekylär designprogramvara , finns i ett antal kommersiella paket. Det finns vissa versioner som också ägnas åt molekylgrafikbaserad läkemedelsdesign. I läkemedelsdesign är funktionen för dockning - förmågan att ansluta en visad molekyl till en receptor - ett av de viktigaste attributen som skilde läkemedelsdesignprogramvaran från annan molekylär designprogramvara.