Vad är de minsta genomen?

Genom är livskoden - den molekylära planen som bygger upp alla levande organismer. Det mänskliga genomet hittades kodat i DNA i cellens kärna och har cirka 3 miljarder aminosyrabaspar och 20 000-25 000 proteinkodande gener. Detta är relativt typiskt med en metazoan organism. Genomstorlek korrelerar inte direkt komplexiteten hos organismen utan gör abstrakt, speciellt när man jämför genolängder mellan flercelliga och encelliga organismer. Parasiter har de minsta genomerna av alla multicellulära organismer som har genomgått en process som kallas genetisk effektivisering.

Vissa organismer har verkligen små genom, de minsta genom som hittills upptäckts. Från 2011 var det minsta rapporterade genomet som hittades utanför en organell Tremblaya- genomet, som har bara 121 gener, och finns i en bakterie som finns i vattmuggar. Andra extremt små genom inkluderar Candidatus Carsonella rudii, även känd som C. rudii , på bara 159.662 baspar, med cirka 182 gener. Denna bakterie finns i sovsugande insekter som kallas hoppande växtlöss. En endosymbiont, C. rudii lever i specialiserade organ inom insektet som kallas bakteriomer. De har en ömsesidigt gynnsam relation, med insektens kropp som ger bakterierna näringsämnen och skydd, och bakterierna som ger insekten vitaminer och aminosyror.

Det näst minsta icke-virala genomet finns i Nanoarchaeum equitaans , en termofil archaea som finns bland hydrotermiska ventilationsöppningar på Atlanterhavsbotten, runt Mid-Atlantic Ridge. N. equitaans är en mycket ovanlig organisme som saknar vissa metaboliska vägar som finns i praktiskt taget alla andra levande saker och får sin egen filum i domänen Archaea. Genomet är 490 885 baspar långt. Detta är bland de minsta genomerna av någon levande sak. Liksom C. rudii är N. equitaans en obligatorisk symbol för en annan organisme, i detta fall arkeonen Ignicoccus , från vilken den får många viktiga biomolekyler.

Av alla de minsta genomerna som nämnts tidigare var den genombärande organismen en obligatorisk symbion av en annan. Men det minsta genomet från någon frittlevande organisme finns i bakterierna Mycoplasma genitalium , som finns på luftvägarna och könsorganen hos primater, till exempel människor. Denna bakterie isolerades först 1980 från urinrörprover av två manliga färger med inflammation i urinröret. Tänkte vara först bland de minsta genomerna under upptäckten av C. rudii 2002, M. gentalium har endast 582 970 baspar och 482 proteinkodande gener. M. genitalium har använts som en modell för Minimal Genome Project, som syftar till att skapa en bakterie med det minsta genom som krävs för att upprätthålla liv.