Vad är en kilobas?
En kilobas är en numreringsmätning som används inom genetikområdet. Eftersom basen är en byggsten av genetisk information, och varje organism innehåller många baser, är 1 000 baser ett vanligt antal att använda när man diskuterar hur många baser en organisms genetiska bibliotek innehåller. Denna 1 000 basbit kallas mer korrekt som en kilobas.
Varje levande organisme innehåller genetisk information. Denna information stryker exakt ut till organismen vilka proteinprodukter organismen behöver för att leva, växa och föröka sig. All genetisk information kallas tillsammans organismen genom.
Varje genom är uppdelat i diskreta sektioner. Dessa avsnitt, kallade gener, kodar för en viss produkt. Varje gen innehåller en sträng av byggstenar, kallade baser. När organismen läser generna för att producera en viss produkt är det sekvensen av baser inuti genen som den läser.
Endast fyra baser finns i det genetiska materialet DNA. Dessa är cytosin (C), guanin (G), tymin (T) och adenin (A). Det är i vilken ordning baserna är arrangerade i en gen som dikterar vad den genen kodar för. Komplexiteten som är nödvändig för att producera alla produkter som är nödvändiga för människolivet uppstår från genens längd och antalet baser inuti dem.
Gener innehåller vardera ett anmärkningsvärt antal baser. Hela det mänskliga genomet, till exempel, innehåller 3 miljarder baser, vardera parade med en annan bas i en spiral spiralstruktur. Den stora mängden baser som finns i ett genom innebär att genetiker har lättare att hänvisa till gener som är x kilobaser i längd, i motsats till 1 000 gånger x i längd.
Till och med det minsta genomet, såsom Carsonella ruddii- bakteriegenomet, har cirka 160 000 baspar. Detta lilla genom är cirka 160 kilobaser (kb) i längd. Det mänskliga genomet å andra sidan är 3 miljoner kilobaspar långt.
Sekvensering av genom kräver att genomet först bryts upp. Utrustning som utför sekvenseringen kan bara hantera så många baser samtidigt. Genetiker kan dela upp ett genom i många sektioner och hänvisar till dem som innehåller så många kilobaspar, till exempel en längd på 150 kilobaspar. Denna storlek på genetiskt material kan genetiskt manipuleras till en annan organisme för att multiplicera DNA upp till en nivå som är lättläsbar. Även dessa relativt små DNA-bitar är för långa för direkt sekvensering, så genetiker kan då bryta upp ett 150 kb-segment i mycket mindre delar med några hundra baser i längd.