Vad är en molekylviktsmarkör?
En molekylviktsmarkör är en molekyl som används för att ge en uppskattning av storleken på molekyler som utsatts för gelelektrofores. Detta är en teknik där DNA, RNA eller proteiner separeras efter storlek med användning av en elektrisk ström på en gel. Denna term bör inte förväxlas med molekylära markörer inom genetik - områden där en organismens DNA skiljer sig från resten av befolkningen och kan identifieras med en DNA -sond.
proteinmolekylviktsmarkörer används ofta när proteiner separeras genom gelelektrofores. Molekylviktsmarkören är en grupp proteiner med känd molekylvikt, som vanligtvis tillhandahålls av bioteknikföretag inom ett särskilt storleksområde. Man väljer storleksintervallet baserat på proverna som studeras. Molekylviktsmarkörerna laddas ihop och separeras under körningen. Genom att mäta det avstånd som körs av markörerna och proteinet av intresse kan man bestämma storleken på det experimentella proteinet.
olika tyPES av markörer kan visualiseras på olika sätt. Vissa av molekylmarkörerna är omärkta och är färgade i gelén med resten av proteinerna. De är inte synliga förrän hela gelén är färgad. Andra typer av proteinmolekylära markörer är förfärgade med färger, och varje typ av protein är en annan färg. Separationen är synlig när gelén körs.
En fördel med en förfärgad molekylviktsmarkör är för Western Blots. Detta är en teknik där proteinerna överförs till ett membran och sedan färgas med antikroppar för att detektera ett visst protein. Att ha färgade markörer hjälper till att avgöra om överföringen av proteinerna är klar innan man fortsätter med resten av proceduren.
molekylviktsmarkörer används ofta för att analysera DNA på geler. Ofta är DNA -molekylära markörer tillverkade av bakterievirus lambda . Restriktion enzyME: er tillverkas av bakterier för att smälta DNA från invaderande organismer, och restriktionsenzymet hindiii används ofta för att försämra lambda -DNA. Det producerar en serie av olika storlekar, reproducerbara fragment kända som en DNA-stege . Genom att jämföra avståndet som drivs av standarderna i en logaritmisk skala kan man bestämma storleken på DNA -fragmenten som analyseras.
Denna DNA -molekylviktsmarkör kan användas för att analysera storleken på DNA som producerats under isoleringen av gener och i gentekniska experiment. Det kan också användas under polymeraskedjereaktionen (PCR), där små mängder DNA eller RNA förstärks för att producera stora mängder produkt. PCR -tekniker är vanligtvis förknippade med faderskapstest och kriminalteknisk vetenskap, men de är också mycket vanliga i medicinsk och grundläggande biologisk forskning. Speciella molekylviktsmarkörer finns tillgängliga för mindre produkter genererade från vissa typer av PCR eller små RNA -molekyler.