Vad är en peptidsekvens?
peptider är biologiska polymerer som bildas genom koppling av aminosyror, vars nyckelelement är kol (C), väte (H), syre (O) och kväve (N). Termen "peptidsekvens" hänvisar till den ordning i vilken aminosyror är kopplade. Peptider är mycket viktiga i levande system och kombineras för att bilda mycket större kedjor som kallas proteiner. Även om det finns många sorter av biologiska peptider, består de flesta av dessa av bara 20 aminosyror. Proteiner utför ett antal biologiska funktioner, inklusive som enzymer och i strukturen av cellväggar i växter och membran i djurceller.
aminosyror kallas så eftersom de har amin (-NH 2 ) och karboxylsyra (-CO 2 H). De flesta av aminosyrorna som finns i biologiska system har den allmänna formeln R-Ch (NH 2 )-Co 2 H, där R är en rad grupper. Den varierande strukturen för R är det som påverkar strukturen och egenskaperna hos peptider och proteiner.
peptidsyntes sker WHEn en aminosyras amingrupp reagerar med karboxylsyran på en annan aminosyra. Resultatet är bildningen av en amidgrupp av struktur -n (h) -Co- där kväve-till-kolbindningen kallas en peptidbindning. Reaktionen kan äga rum ett antal gånger för att bilda en peptidsekvens av olika funktionella grupper, som var och en är isär av en amidgrupp.
peptider och proteiner har olika nivåer av struktur. Primär proteinstruktur är i vilken ordning aminosyrorna finns; Detta är dess peptidsekvens. De funktionella grupperna på proteinet interagerar med varandra för att dra det i en form. De enskilda vändningarna av en peptid kallas dess sekundära struktur. Dess övergripande form, nettoresultatet av alla dessa vändningar, är peptidens tertiära struktur.
De biokemiska egenskaperna hos proteiner eller peptider beror på tertiär struktur. SomMed alla kemikalier kommer proteiner att anta den mest energiskt gynnsamma formen. Denna form beror på attraktiva och avvisande krafter mellan grupperna på de individuella aminosyrorna. Därför beror tertiärstrukturen på primär struktur, vilket innebär att dra av peptidsekvensen för ett visst protein i slutändan kommer att förklara dess egenskaper.
Att utarbeta peptidsekvensen för ett protein har tillämpningar vid utformning av läkemedel. Många biologiska processer beror på proteinernas verkan och läkemedel fungerar ofta genom att antingen kopiera eller blockera verkning av dessa proteiner. Att förstå beteendet hos proteiner kan leda till utformning av effektivare läkemedel. Av denna anledning har forsknings- och utvecklingsavdelningen för ett läkemedelsföretag vanligtvis ett peptidbibliotek eller peptidkatalog som den kommer att använda i sökandet efter nya läkemedel.