Vad är ett exopeptidas?

Inom matsmältningssystemet finns det många olika enzymer som bryter ned matmolekyler. Var och en av dessa enzymer har en annan roll och vissa fungerar endast i ett specifikt organ under specifika förhållanden. De flesta matsmältningen sker i tunntarmen av ett stort antal olika enzymer. Prövningen av proteiner är ett exempel på en komplex process som utförs i olika organ av olika grupper av enzymer. Exopeptidaser är en grupp enzymer som är involverade i fullständig matsmältning av proteiner.

Nedbrytningen av en proteinmolekyl är mycket specifik, eftersom de involverade enzymerna bara bryter bindningarna bredvid vissa aminosyror som finns i peptidkedjan. När en peptidbindning bildas är den alltid mellan aminosyran av en aminosyra och karboxyländen i en annan. När aminosyrasekvensen ges för en speciell peptidkedja, eller protein, läses den vanligtvis från aminosidan, N-terminalen, till den sista aminosyran, som har en fri karboxyl eller C-terminalen. Ursprungligen, även om proteinet bryts ned, produceras mycket få aminosyror.

Proteiner är stora molekyler och deras matsmältning har ett antal steg, som börjar i magen av pepsin, en av tre endopeptidaser. När de delvis smälta proteinerna rör sig från magen till tunntarmen fortsätter de andra två endopeptidaserna, trypsin och chymotrypsin, att bryta ner proteinerna. Dessa tre enzymer delar de långa peptidsträngarna som utgör proteinet i olika längder. Endopeptidaser benämns så att de bryter ned peptidbindningarna som finns i proteinet.

För att slutföra matsmältningsprocessen för att producera enstaka aminosyror från en proteinkedja behövs ett exopeptidas. Varje exopeptidas bryter bindningen mellan den slutliga aminosyran och resten av kedjan. Det finns flera olika exopeptidaser, som var och en har ett mycket specifikt handlingssätt. Där aminosyran är förenad med resten av peptidkedjan och vilka aminosyror som är förenade spelar en roll för att bestämma vilket exopeptidas som kommer att bryta bindningen.

Karboxypeptidas är ett exopeptidas som bryter bindningen mellan den näst sista och den sista aminosyran vid C-terminaländen. Ett annat exopeptidas, aminopeptidas, utför samma verkan men vid N-terminalen. Andra exopeptidaser, kallad dipeptidaser, bryter isär par av aminosyror. Till exempel kommer ett dipeptidas bara att bryta bindningen mellan en glycin kopplad till en leucin. Ett annat dipeptidas kommer endast att verka på en peptidbindning mellan två glycinaminosyror kopplade samman.