Vad är DNA-utfällning?
Deoxyribonukleinsyra (DNA) -utfällning är ett viktigt steg i isolering och rening av genetiskt material i vetenskapen. I allmänhet innehåller ett prov av biologisk vävnad DNA eller RNA tillsammans med resten av organismkroppen. För att testa DNA måste en forskare separera DNA från alla andra ämnen. DNA-fällning avser specifikt ett steg som involverar separering av upplöst DNA från vätskan det löses i. Vanliga metoder för DNA-utfällning inkluderar tillsats av etanol, ispropanol eller glykogen till vätskan, vilket gör att DNA stelnar i klumpar och faller till botten av vätskeprovet.
De första stegen i rening av DNA från ett prov kan vara lika enkla som att krossa löv i en skål för att bryta ner en del av strukturen. Sedan kan moset brytas ned med kemikalier eller enzymer som lämnar DNA: et intakt. Vanligtvis använder genetiker en centrifug för att dela upp olika komponenter i ett prov. Detta är en maskin som snurrar ett prov så att den tyngsta komponenten sjunker till botten och den lättaste stiger upp till toppen.
Genom att ta bort olika oönskade komponenter sitter genetiker vanligtvis kvar med en klar vätska som innehåller det genetiska materialet. Han eller hon måste sedan ta ut DNA som är löst i den vätskan och kasta vätskan och de andra ämnena i vätskan. DNA-utfällning är det sätt som detta uppnås. Oftast måste forskaren lägga till en kemikalie i vätskan för att utföra DNA-utfällning.
Etanol eller isopropanol, som båda är alkoholformer och faller in i lösningsmedelsgruppen av kemikalier, är de vanligaste kemikalierna som används för DNA-utfällning. Glykogen är ett annat ämne som kan fälla ut DNA, men det är mindre vanligt att använda, bortsett från utfällning av låga koncentrationer av genetiskt material. När dessa kemikalier blandas med upplöst DNA tillåter deras kemi dem att ändra hur DNA passar in i dess miljö. Medan tidigare blandades DNA enkelt med vätskan, efter den kemiska tillsatsen, slutar det att bindas med vätskan och istället formas till ett fast ämne.
Denna fasta substans är normalt vitaktig och klumpar sig samman. Eftersom en del av det fasta ämnet fortfarande finns i små partiklar placerar forskaren vanligtvis provet i en centrifug för att snurra alla fasta ämnen i en pellet i botten av provröret. Detta är den renade formen av DNA som ursprungligen fanns i provet, vilket är användbart för testning. I allmänhet avlägsnas vätskan som pelleten suspenderas i från röret, och pelleten kan också torkas för att tillåta kemikalierna att avdunsta för att göra pelleten så ren som möjligt.