Vad är genommärkning?

Genomantikering taggar delar av ett genom med information om den genetiska informationen den innehåller. Detta är en del av processen vid genomprojekt, där målet inte bara är att sekvensera DNA från en målorganism, utan att förstå vad den gör och hur den fungerar. Forskare kan göra kommentarer i sina laboratorier och kan dela data med andra forskare för att samla resurser och information. Onlinedatabaser som är öppna för allmänheten är tillgängliga, och vissa tillåter också allmänheten att lämna in sina egna anteckningar.

Det första steget i genomanteckningen är sekvensering, där forskare bestämmer ordningen på aminosyror i en organisms DNA. Det tar lång tid att sekvensera ett helt genom, och det är vanligt att forskare börjar kommentera innan genomet har avkodats. Med ett avsnitt av sekvenserat DNA i handen kan en forskare börja kommentera. Forskare kan notera var gener verkar starta och sluta och uppmärksamma särskilda DNA-strängar som innehåller information om genomets funktion.

Datorer kan utföra någon genomanteckning på egen hand. De kan söka efter kända mönster, till exempel strängar av aminosyror som förekommer i början och slutet av gener. I automatiserad annotering kan datorn lägga till anteckningar till olika delar av en DNA-sträng för att ge information om det. Det är också möjligt att jämföra segment från olika organismer för att leta efter varians som kan ge viktig information om arten som helhet.

Manuell genomanteckning innebär fysisk granskning av DNA. Många forskare använder datorer för att visa informationen och tagga den, så att de kan ange den i databaser när de fungerar. I vissa fall kan en manuell granskning vara nödvändig efter automatiserad annotering, för att se till att datorn har informationen korrekt. Detta kan vara en omsorgsfull process och fel uppstår, vilket är en anledning till att forskare vill samla databaser. Om en kommentar inte matchar andra på samma sektion av DNA, kan människor utvärdera informationen för att avgöra vad som hände och fixa felet.

Det är inte alltid möjligt att bestämma vad en gen gör under genomanteckningsförfarandet. Forskare kan flagga gener och skilja dem från andra komponenter i genomet, såsom icke-kodande DNA som upprepningar. Denna information kan användas i forskning när människor utvecklar teorier om olika segment av genomet. De kan lägga till kommentarerna för att notera funktionen av en gen.

ANDRA SPRÅK

Hjälpte den här artikeln dig? Tack för feedbacken Tack för feedbacken

Hur kan vi hjälpa? Hur kan vi hjälpa?