Vad är Proteomics?

Studien av det mänskliga genomet är ett spännande och ofta omtalat forskningsområde. Studien av den mänskliga proteomen, alla de olika proteiner som bildar människokroppen, är mindre känd, men lika spännande och viktig. Termen proteomics myntades för att beskriva denna fascinerande och komplexa vetenskap.

Proteomics är studien av alla proteiner som utgör en organisme. Proteomics studerar inte bara själva proteinerna, utan också hur de interagerar, de förändringar de genomgår och de effekter de har inom organismen. Storleken och komplexiteten hos den mänskliga proteomen är en del av det som gör proteomics till en mycket komplex vetenskap.

Precis som genomik börjar med en kartläggning av det mänskliga genomet, försöker proteomik att identifiera och utvärdera funktionen för alla de olika proteinerna i människokroppen. Detta är en skrämmande uppgift, för det finns inte bara ett stort antal proteiner i den mänskliga proteomen, cirka 400 000; men dessa proteiner förekommer också på olika platser i kroppen i olika stadier i en persons liv och kan förändras inom en enda cell. Det finns ett antal olika metoder tillgängliga för proteomikforskare för att studera proteiner. Olika typer av röntgenmaskiner kan ge proteomikforskare detaljer om proteinernas strukturer. Röntgen- och magnetisk resonansavbildning (MRI) gör det också möjligt för proteomikforskare att se var proteinerna förekommer i kroppen och i enskilda celler.

Proteomikforskare förlitar sig också på affinitetskromatograf och gelelektrofores för att studera enskilda proteiner. Båda metoderna ger proteomikforskaren information om de fysiska dimensionerna hos proteinerna. Gelelektrofores separerar olika proteiner baserat på deras storlek genom att använda en elektrisk ström för att förflytta dem genom en gel. De större proteinerna rör sig långsammare, så på en viss tid är de proteiner som har rört sig på det kortaste avståndet större än de som har rört sig längre.

Affinitetskromatografen berättar proteomikforskare vilka kemikalier eller andra proteiner ett specifikt protein interagerar med. Affinitetskromatorafen kan fånga specifika ämnen, vilket gör att proteomikforskaren kan tvätta bort oönskat material. Genom att fånga ett specifikt protein kan forskare separera det andra materialet, inklusive kemikalierna eller andra proteiner som målproteinet interagerar med.

Proteomics är fortfarande ett relativt nytt fält, och som ni ser är det ganska komplicerat. Forskare som forskar på proteomik har möjlighet att upptäcka otydlig information om den mänskliga proteomen. Endast framtiden kommer att berätta vad vetenskapliga och medicinska framsteg proteomics kan ge.