Vad är total RNA-isolering?
Total RNA-isolering (RNA) isolering är en laboratorieteknik som används för att extrahera hela det cellulära RNA från ett vävnadsprov. Detta skiljer sig från andra behandlingsmetoder som selektivt drar ut vissa typer av RNA. En forskare kan till exempel vilja inspektera messenger RNA (mRNA) och kan arbeta med ett prov för att extrahera just detta genetiska material. Det finns ett antal laboratorieprotokoll tillgängliga för total RNA-isolering, med användning av en mängd produkter tillverkade av vetenskapliga leverantörer.
Det kan vara ett antal fördelar med att samla upp allt cellulärt RNA från ett vävnadsprov. Det kan ge mer ren och användbar information. Tekniken kan också göra det möjligt för forskare att kontrollera för nedbrytning som kan orsaka problem med experiment. Om provet är av dålig kvalitet kan forskaren extrahera RNA igen för att få en renare och mer användbar samling av RNA. Detta kan vara viktigt för många typer av forskning, där dåligt RNA i början orsakar problem med experiment nedåt.
Tekniker för total RNA-isolering kan involvera en mängd kemiska medel. Vissa fokuserar på användning av icke-toxiska kemikalier för att minska risken för skador på provet. Sådana kemikalier begränsar också nedströms föroreningar av RNA och är säkrare för labbarbetare. Labs tenderar att välja en specifik kemikalie och protokoll som ska rekommenderas för all personal och inkluderar en detaljerad beskrivning av det totala RNA-isoleringsförfarandet i sina manualer. Detta säkerställer konsistens i RNA-behandling vid anläggningen för att ge mer stabila och användbara resultat.
Processen börjar med framställning av ett vävnadsprov, som kan variera i storlek, för att göra det redo för behandling vilka kemiska reagens som drar ut det totala RNA. Tekniker konsulterar laboratoriehandboken för att avgöra hur man ska hantera provet och behandla det för att isolera RNA. De kan använda verktyg som elektroforesplattor för att kontrollera provets kvalitet och leta efter tecken på nedbrytning som kan indikera ett problem med den totala RNA-isoleringsprocessen.
Forskare kan utföra sin egen totala RNA-isolering eller delegera denna uppgift till en labbassistent, doktorand eller liknande laboratoriearbetare. Det är också möjligt att kontrahera isolering till andra labbanläggningar. Det kan ibland vara nödvändigt för att skydda ett integritets integritet genom att använda en tredje part för att skapa verifierbara och repeterbara resultat. I alla vetenskapliga artiklar baserade på forskning med det isolerade RNA måste forskaren diskutera metoden som används för isolering och vem som utfört arbetet.