Vad är total RNA?

Ribonukleinsyra (RNA) är en polymer som är involverad i proteinsyntes, genreplikation och deoxyribonukleinsyra (DNA) replikation. En polymer är en molekyl tillverkad av linjära kedjor, så RNA är en linjär kedja tillverkad av ribonukleotider. Varje ribonukleotidmolekyl består av en kvävebas med en fosfatgrupp och ribos. Totalt RNA avser RNA som extraherades eller isolerades från celler eller vävnad för genetisk kartläggning. Denna typ av komplett RNA kan isoleras från enstaka cellorganismer, djurvävnad, växtvävnad, jäst och svamp

Totalt RNA extraheras från celler och vävnad under en process som kallas RNA-isolering. Cellstörning är det första och viktigaste steget i denna process, och cellerna kan avbrytas med mekaniska medel, såsom homogenisering, eller genom tillsats av enzymer. Enzymer bryter kemiskt ned beläggningen eller kapseln i en cell så att det totala RNA kan isoleras. Under isoleringen av totalt RNA avlägsnas lipider, proteiner och DNA från RNA så att det lämnas i sin renaste form.

Det finns ett antal skillnader mellan RNA och DNA, även om de två nukleotiderna kopplas samman för att bilda kedjor. RNA är en enkelkedjepolymer, medan DNA är dubbelsträngat. Dessutom innehåller DNA deoxiribos medan RNA endast innehåller ribos.

Även om den mest grundläggande strukturen för RNA är en kedja kan RNA ha sekundära och tertiära strukturer. Sekundära strukturer är ofta spiralformade och inkluderar hårnålar, öglor och knutliknande former. Tertiära strukturer är de mest komplexa och uppstår när avlägsna nukleotider interagerar med varandra. Forskare använder dessa strukturer för att förstå och bestämma funktionerna hos olika RNA-molekyler.

När en RNA-molekyl har syntetiserats under transkription måste den genomgå bearbetning innan den är redo att utföra sin avsedda funktion. Bearbetning innebär att segment eller delar av specifika nukleotider förändras. RNA-molekyler med olika funktioner har olika namn. Till exempel heter messenger RNA (mRNA) eftersom det är ansvarigt för att överföra den genetiska koden från DNA till ribosomerna som användes under proteinsyntes.

Proteinsyntes, som vetenskapligt kallas translation, kräver ytterligare två typer av RNA förutom mRNA. Översättning RNA, eller tRNA-molekyler, anpassar nukleotider i mRNA till aminosyror under translation. RNA-molekylen som ansvarar för att koppla ribosomer till växande proteinkedjor kallas rRNA. De tre huvudtyperna av RNA måste vara närvarande för flera RNA-funktioner. Dessutom spelar de flesta av de mindre vanliga typerna av RNA en roll i översättningen genom att utföra väsentliga funktioner i kärnan och cytoplasma.