การจัดการคุณภาพโดยรวมเป็น บริษัท ระบบประกันคุณภาพที่สามารถนำไปใช้ในการปฏิบัติงานได้ แม้ว่าระบบจะนำข้อดีมากมายมาสู่ธุรกิจ แต่ข้อเสียของการจัดการคุณภาพโดยรวมก็มีอยู่เช่นกัน ข้อเสียเหล่านี้อาจรวมถึงค่าใช้จ่ายในการปฏิบัติงานสูงประโยชน์ที่มองไม่เห็นก่อนกำหนดและความต้านทานต่อการเปลี่ยนแปลงจากพนักงาน บริษัท ต้องชั่งน้ำหนักผลประโยชน์เทียบกับข้อเสียเพื่อประเมินว่าการจัดการคุณภาพโดยรวมจะทำงานในธุรกิจหรือไม่ ความเข้าใจอย่างถ่องแท้เกี่ยวกับความหายนะที่อาจเกิดขึ้นสามารถช่วย บริษัท ประเมินกระบวนการบูรณาการในกรณีที่จำเป็น
เช่นการเปลี่ยนแปลงหรือการเปลี่ยนแปลงครั้งสำคัญในธุรกิจการจัดการคุณภาพโดยรวมมักเป็นโครงการที่มีราคาแพง เจ้าของและผู้บริหารจะต้องคำนวณต้นทุนที่เกี่ยวข้องกับโปรแกรมการประกันคุณภาพอย่างรอบคอบ การวิเคราะห์ประโยชน์ที่ได้รับจากการใช้งานก็เป็นสิ่งจำเป็นเช่นกัน ในหลายกรณีการจัดการคุณภาพโดยรวมไม่ใช่กิจกรรมทางธุรกิจที่สร้างรายได้ ผลประโยชน์ส่วนใหญ่ไม่ใช่ทางการเงิน ดังนั้น บริษัท ไม่สามารถคาดหวังที่จะจ่ายค่าใช้จ่ายโดยตรงของโปรแกรมนี้ผ่านการขายที่สูงขึ้นซึ่งอาจเป็นข้อเสียเปรียบที่สำคัญที่สุดของการจัดการคุณภาพโดยรวม
เช่นเดียวกับการวิเคราะห์ต้นทุน - ผลประโยชน์จากการจัดการคุณภาพโดยรวมอาจไม่ใช่สิ่งที่ธุรกิจประสบในทันที การจัดการคุณภาพโดยรวมจะต้องเริ่มต้นได้ดีก่อนที่ บริษัท จะเห็นการเปลี่ยนแปลงใด ๆ ในความพึงพอใจของลูกค้าหรือการเปลี่ยนแปลงอื่น ๆ ปัญหาสำคัญที่นี่คือ บริษัท ที่ใช้จ่ายเงินในโครงการที่อาจหรือไม่อาจทำให้เกิดผลประโยชน์ที่เป็นรูปธรรม เจ้าของและผู้บริหารอาจเบื่อโครงการที่ไม่ส่งผลให้เกิดประโยชน์ทันที ค่าใช้จ่ายในการดำเนินการที่เพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่องสามารถลดผลประโยชน์ใด ๆ ที่อาจเกิดขึ้นจากการจัดการคุณภาพโดยรวม
การต่อต้านการเปลี่ยนแปลงเป็นอีกหนึ่ง บริษัท ที่สำคัญที่ต้องเอาชนะด้วยการจัดการคุณภาพโดยรวม ผู้จัดการและพนักงานอาจไม่เปิดกว้างต่อการเปลี่ยนแปลงในการดำเนินธุรกิจมาตรฐาน เจ้าของและผู้บริหารจะต้องสามารถแสดงให้เห็นว่าทำไมการจัดการคุณภาพโดยรวมจะสร้างสภาพแวดล้อมการทำงานที่ดีขึ้นกว่า แต่ก่อน นอกจากนี้ผลประโยชน์ที่อาจเกิดขึ้นต้องเป็นสิ่งที่แต่ละแผนกจะสามารถเข้าถึงได้เป็นเป้าหมาย การใช้งานช้าหรือการขาดผลประโยชน์ทันทีอาจเพิ่มความต้านทานการเปลี่ยนแปลง
บริษัท อาจประสบกับข้อเสียต่าง ๆ ของการจัดการคุณภาพโดยรวมเมื่อเปรียบเทียบกับที่ระบุไว้ในที่นี้ ทีมงานด้านการดำเนินงานและการจัดการมักเป็นสองปัจจัยที่กำหนดความสำเร็จของการจัดการคุณภาพโดยรวม ตัวอย่างเช่น บริษัท ที่มีแรงงานไร้ฝีมือเป็นส่วนใหญ่อาจประสบความสำเร็จในการดำเนินการจัดการคุณภาพโดยรวมให้ประสบความสำเร็จ ข้อเสียอีกประการหนึ่งคือการไม่สามารถเก็บเกี่ยวผลตอบแทนใด ๆ จากการเปลี่ยนแปลงการดำเนินธุรกิจ ผลลัพธ์คือค่าใช้จ่ายที่เพิ่มขึ้นและเงื่อนไขการปฏิบัติงานที่เข้มงวดมากขึ้นสำหรับพนักงาน
