ซอฟต์แวร์ตรวจสอบภายในเป็นโปรแกรมคอมพิวเตอร์หรือแอปพลิเคชันที่ บริษัท สามารถใช้เพื่อตรวจสอบข้อมูลทางการเงิน โดยทั่วไปแล้ว บริษัท บัญชีเป็นผู้ใช้หลักของโปรแกรมนี้แม้ว่าผู้บริหารระดับสูงของ บริษัท อาจเข้าถึงได้เช่นกัน แอปพลิเคชันซอฟต์แวร์ตรวจสอบภายในจำนวนมากอนุญาตให้ผู้ใช้ติดตามการตรวจสอบรวบรวมข้อมูลที่จำเป็นในการดำเนินการวิจัยภาคสนามตรวจสอบหลักฐานการตรวจสอบด้วยคอมพิวเตอร์ใช้การควบคุมและตรวจสอบนโยบายการตรวจสอบกับมาตรฐานการบัญชีแห่งชาติ องค์กรขนาดใหญ่มักจะจ้างนักบัญชีหลายคนที่รับผิดชอบในการตรวจสอบข้อมูลทางการเงินและข้อมูลของ บริษัท
บริษัท สามารถดำเนินการตรวจสอบภายในได้บ่อยเท่าที่ต้องการ บริษัท ที่เปิดเผยต่อสาธารณชนอาจมีข้อกำหนดที่ทำให้การตรวจสอบภายในรายไตรมาสจากผู้ตรวจสอบภายในหรือภายนอก การใช้ซอฟต์แวร์ตรวจสอบภายในช่วยให้ บริษัท สามารถสร้างบันทึกดิจิตอลสำหรับการตรวจสอบแต่ละครั้ง บริษัท สามารถแสดงรายการบุคคลที่สามารถเข้าถึงข้อมูลพร้อมกับผู้รับผิดชอบในการทำงานหรือกิจกรรมบางอย่าง ผู้ตรวจสอบภายในอาจต้องอัพโหลดเอกสารภาคสนามหรือรายการอื่น ๆ ที่ผ่านการทดสอบในโปรแกรมซอฟต์แวร์เพื่อให้ผู้บริหารระดับสูงสามารถตรวจสอบเอกสารการตรวจสอบได้
ซอฟต์แวร์ตรวจสอบภายในบางประเภทยังอนุญาตให้มีการรวบรวมข้อมูลทางอิเล็กทรอนิกส์ เมื่อใช้ควบคู่กับโปรแกรมซอฟต์แวร์อื่น ๆ ใน บริษัท เช่นการบัญชีการเงินหรือการจัดการทั่วไปผู้ตรวจสอบสามารถสร้างรายงานที่แสดงข้อมูลทางการเงินที่ผู้สอบบัญชีจะตรวจสอบ การใช้ระบบซอฟต์แวร์การตรวจสอบแบบรวมสามารถประหยัดเวลาได้มากเนื่องจากผู้ตรวจสอบสามารถใช้เวลาในการตรวจสอบข้อมูลมากกว่าการรวบรวมข้อมูลที่จำเป็น ในระหว่างกระบวนการรวบรวมข้อมูลผู้ตรวจสอบบัญชีสามารถตรวจสอบหลักฐานการตรวจสอบด้วยระบบคอมพิวเตอร์ รายงานนี้จะรายงานผู้ใช้ทั้งหมดที่เข้าถึงข้อมูลและทำการเปลี่ยนแปลงระบบบัญชีซึ่งเป็นส่วนที่จำเป็นของกระบวนการตรวจสอบ
เมื่อใช้ซอฟต์แวร์ตรวจสอบภายใน บริษัท สามารถตั้งค่าการควบคุมภายในที่จำกัดความสามารถของผู้ใช้ในการเข้าถึงหรือเปลี่ยนแปลงข้อมูล บริษัท ส่วนใหญ่จำเป็นต้องแยกงานบัญชีออกจากกันในกลุ่มพนักงานที่แตกต่างกัน ระบบซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ช่วยให้ผู้จัดการบัญชีและหัวหน้างานสามารถ จำกัด จำนวนโมดูลหรือกิจกรรมที่แต่ละคนสามารถทำได้ในระบบซอฟต์แวร์ของ บริษัท ผู้สอบบัญชีมักจะทดสอบการควบคุมด้วยคอมพิวเตอร์เหล่านี้เพื่อให้แน่ใจว่า บริษัท มีการแบ่งแยกหน้าที่การบัญชีอย่างถูกต้อง
บริษัท อาจจะสามารถนำแนวทางการบัญชีหรือการตรวจสอบไปใช้กับซอฟต์แวร์การตรวจสอบภายใน สิ่งนี้ช่วยให้สามารถเปรียบเทียบแนวทางการบัญชีของ บริษัท กับมาตรฐานการบัญชีของประเทศได้ทันที การเก็บรักษาสำเนาอิเล็กทรอนิกส์ของการตรวจสอบภายในก่อนหน้านี้ยังช่วยให้ บริษัท สามารถตรวจสอบว่ามันจะดีขึ้นหรือแย่ลงในแง่หรือกระบวนการบัญชี ผู้ตรวจสอบภายนอกที่ต้องการตรวจสอบข้อมูลนี้สามารถเข้าถึงซอฟต์แวร์เพื่อจุดประสงค์ในการตรวจสอบที่เป็นทางการมากขึ้น
