การจัดการธาตุอาหารคือการใช้ธาตุอาหารหรือที่เรียกว่าปุ๋ยเมื่อพืชต้องการมากที่สุดในขณะที่ลดผลกระทบต่อทั้งในท้องถิ่นและพื้นที่โดยรอบ การใช้ปุ๋ยในปริมาณที่เหมาะสมกับพืชในเวลาที่เหมาะสมสามารถเพิ่มผลผลิตได้สูงสุด พืชที่ใส่ปุ๋ยอย่างไม่เหมาะสมอาจนำไปสู่การปนเปื้อนของน้ำใต้ดินหรือการปนเปื้อนของน้ำในแหล่งน้ำใกล้เคียงเช่นทะเลสาบหรือมหาสมุทร เกษตรกรบางคนไม่ฝึกการจัดการธาตุอาหารเนื่องจากต้นทุนที่เกี่ยวข้อง
โพแทสเซียมไนโตรเจนและฟอสฟอรัสเป็นสารอาหารที่สำคัญต่อพืช พืชต้องการสารอาหารเหล่านี้มากที่สุดในช่วงฤดูปลูกซึ่งโดยปกติจะเป็นช่วงฤดูใบไม้ผลิ แต่จะแตกต่างกันไปตามพืช เวลามีความสำคัญอย่างยิ่งเมื่อพูดถึงการใช้ไนโตรเจนและฟอสฟอรัส แอปพลิเคชันที่กำหนดเวลาไว้อย่างเหมาะสมนั้นไม่ได้ทำไว้เสมอเนื่องจากผู้ให้บริการอุปกรณ์และอุปกรณ์มีให้บริการอย่างกว้างขวางมากขึ้นในเวลาอื่น
ในการจัดการธาตุอาหารจะคำนึงถึงปริมาณของสารอาหารด้วย ปริมาณที่มีประสิทธิภาพและเป็นประโยชน์มากที่สุดแตกต่างจากการเพาะปลูกไปยังการเพาะปลูก เพื่อกำหนดจำนวนนี้การทดสอบดินมักจะดำเนินการโดยห้องปฏิบัติการทดสอบในท้องถิ่น การทดสอบดินบอกเกษตรกรว่ามีธาตุอาหารอะไรบ้างในดินและสิ่งนี้มีผลต่อพืชที่ปลูกในพื้นที่นั้นอย่างไร เกษตรกรหลายคนข้ามขั้นตอนการจัดการสารอาหารนี้ไปกับการใช้ปริมาณมาตรฐานที่แนะนำโดยที่ปรึกษาด้านพืชหรือตัวแทนจำหน่ายปุ๋ย
เมื่อโภชนาการของพืชไม่ได้รับการจัดการอย่างเหมาะสมทั้งคนและสัตว์จะได้รับผลกระทบในทางลบ ธาตุอาหารบางชนิดไม่เกาะกับดินและไหลบ่าในช่วงที่มีพายุฝน สารอาหารบางชนิดที่มากเกินไปอาจทำให้สาหร่ายเติบโตอย่างรวดเร็วซึ่งในที่สุดจะใช้ออกซิเจนมากพอที่จะทำให้สัตว์ที่อาศัยอยู่ในน้ำหายใจไม่ออก สำหรับมนุษย์การปนเปื้อนน้ำใต้ดินเป็นอันตรายต่อสุขภาพอย่างรุนแรงสำหรับทารกแรกเกิด
ในบางเขตอำนาจศาลจำเป็นต้องมีแผนการจัดการสารอาหารตามกฎหมาย ตัวอย่างเช่นภูมิภาค Mississippi ของสหรัฐอเมริกาต้องการการวางแผนการจัดการสารอาหารภายใต้สถานการณ์บางอย่าง แผนเหล่านี้จะต้องเป็นไปตามมาตรฐานการปฏิบัติของบริการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติมิสซิสซิปปีและสามารถพัฒนาได้ด้วยความช่วยเหลือจากตัวแทนท้องถิ่นหรือผู้ให้บริการวางแผนการอนุรักษ์ที่ได้รับการอนุมัติล่วงหน้า
การจัดการสารอาหารยังสามารถเกิดขึ้นในการให้อาหารสัตว์ (AFO) บางประเทศกำหนดให้ใครก็ตามที่เลี้ยงสัตว์ปศุสัตว์จำนวนหนึ่งเพื่อจัดการของเสียอย่างถูกต้องและป้องกันการปนเปื้อนของน้ำผิวดินบริเวณใกล้เคียง การจัดการปุ๋ยอย่างถูกต้องยังสามารถเพิ่มสารอาหารให้เป็นปุ๋ยพืช การจัดการธาตุอาหารที่เกี่ยวข้องกับการรวบรวมปุ๋ยมากกว่าการใช้มันเรียกว่าการจัดการปุ๋ยมากกว่าปกติ
