ในการเป็นวิศวกรกระบวนการทางชีวภาพจำเป็นต้องมีการผสมผสานระหว่างการศึกษาและทักษะการทำงาน การขอใบอนุญาตในวิศวกรรมกระบวนการชีวภาพยังต้องมีการทดสอบและจัดทำเอกสาร ประเภทของการศึกษาและประสบการณ์ที่บุคคลผู้ปรารถนาจะเป็นวิศวกรกระบวนการชีวภาพจะขึ้นอยู่กับแผนกวิศวกรรมกระบวนการชีวภาพที่บุคคลนั้นต้องการทำงาน
อาชีพใด ๆ ในวิศวกรรมกระบวนการชีวภาพจะต้องมีอย่างน้อยปริญญาตรีและมีแนวโน้มมากที่สุดในรูปแบบของวิศวกรรม ทั้งภาควิชาวิศวกรรมเคมีและวิศวกรรมเกษตรอาจเสนอหลักสูตรในสาขาวิศวกรรมกระบวนการชีวภาพ องศาในชีวเคมีหรือวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตอื่น ๆ เป็นเส้นทางที่เป็นไปได้เช่นกันหากคุณต้องการเป็นวิศวกรกระบวนการชีวภาพ เส้นทางอาชีพบางอย่างในวิศวกรรมกระบวนการชีวภาพอาจต้องมีการศึกษาระดับปริญญาโทหรือปริญญาเอก
แผนกใดที่บุคคลเลือกที่จะรับปริญญาอาจจะขึ้นอยู่กับสาขาที่เขาหรือเธอต้องการทำงานบางส่วน วิศวกรรมกระบวนการชีวภาพประกอบด้วยการผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพการแปรรูปอาหารกระบวนการหมักที่หลากหลายและการผลิตยา วิศวกรรมการแปรรูปอาหารมักจะรวมอยู่ในแผนกวิศวกรรมเกษตรในขณะที่หลักสูตรในเชื้อเพลิงชีวภาพและกระบวนการหมักจะพบได้ในแผนกวิศวกรรมเกษตรและเคมี หากบุคคลต้องการทำงานในสายงานเภสัชกรรมความรู้พื้นฐานทางชีวเคมีและวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตที่กว้างขวางขึ้นอาจเป็นประโยชน์
ข้อพิจารณาอีกประการหนึ่งในการเลือกหลักสูตรวิทยาลัยคือบุคคลที่ต้องการออกแบบกระบวนการทางชีวภาพด้วยตนเองหรืออุปกรณ์และเครื่องมือที่จำเป็นในการดำเนินการตามกระบวนการเหล่านั้น วิศวกรรมเกษตรหรือวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตอาจให้ความสำคัญกับกระบวนการจริงมากขึ้น ในทางกลับกันแผนกวิศวกรรมเคมีมักจะต้องการหลักสูตรเกี่ยวกับเครื่องมือและการออกแบบโรงงาน
เมื่อบุคคลได้รับปริญญาวิทยาลัยหรือปริญญาที่จำเป็นในการเป็นวิศวกรกระบวนการทางชีวภาพต้องมีชุดการทดสอบและเอกสารประกอบเพื่อเป็นวิศวกรมืออาชีพที่ได้รับใบอนุญาต ขั้นตอนแรกในกระบวนการนี้คือการทำและผ่านการทดสอบความรู้พื้นฐานด้านวิศวกรรม (FE) การสอบนี้ประกอบด้วยหัวข้อทั่วไปและหัวข้อเฉพาะสำหรับสาขาวิชาที่สนใจ
หลังจากผ่านการสอบ FE บุคคลนั้นจะถูกเรียกว่า Engineer ในการฝึกอบรม (EIT) รัฐทั้งหมดในสหรัฐอเมริกา (US) มีข้อกำหนดที่แตกต่างกันสำหรับ EIT ที่ต้องการเป็นวิศวกรมืออาชีพที่ได้รับใบอนุญาต แต่ทุกรัฐกำหนดให้บุคคลต้องทำงานภายใต้การดูแลของวิศวกรมืออาชีพและจัดเตรียมเอกสารให้คณะกรรมการวิศวกรของรัฐ ขั้นตอนสุดท้ายในการได้รับใบอนุญาตคือการทำและผ่านการทดสอบ Professional Engineer (PE) ซึ่งมีคุณสมบัติที่บุคคลที่จะรู้จักในฐานะวิศวกรมืออาชีพ
