การผ่าตัดเป็นแพทย์เฉพาะทางดังนั้นศัลยแพทย์มักให้ความสำคัญกับด้านแคบ ๆ ความชำนาญในการผ่าตัดมักจะแบ่งตามประเภทของผู้ป่วยโรคหรือพื้นที่ร่างกายที่ศัลยแพทย์เป็นผู้เชี่ยวชาญ ศัลยแพทย์หัวใจบางครั้งเรียกว่าศัลยแพทย์หัวใจดำเนินการขั้นตอนเช่นการผ่าตัดหัวใจแบบเปิดหรือการผ่าตัดปลูกถ่ายหัวใจ เด็กที่ต้องการผ่าตัดโดยทั่วไปจะเห็นศัลยแพทย์เด็ก เมื่อผู้ป่วยต้องผ่าตัดเพื่อซ่อมแซมกระดูกหักเขาอาจได้รับการแนะนำให้ศัลยแพทย์กระดูกและข้อที่ซ่อมแซมการบาดเจ็บของระบบกล้ามเนื้อและกระดูก
เมื่อผู้ป่วยต้องการการผ่าตัดต่อมทอนซิลเพื่อกำจัดต่อมทอนซิลที่ติดเชื้อมักจะดำเนินการโดย otorhinolaryngologist (ENT) ศัลยแพทย์ประเภทนี้รักษาโรคและการบาดเจ็บของหูจมูกหรือลำคอ ENT อาจดำเนินการตามขั้นตอนเพื่อลบติ่งซึ่งมีการเติบโตเล็ก ๆ ภายในโพรงจมูก ศัลยแพทย์ประเภทนี้อาจทำการศัลยกรรมเสริมความงามที่จมูกและหู
ศัลยแพทย์เครื่องสำอางบางครั้งเรียกกันว่าศัลยแพทย์พลาสติกหรือศัลยแพทย์ตกแต่ง ศัลยแพทย์ความงามมีความเชี่ยวชาญในขั้นตอนการสร้างส่วนต่าง ๆ ของร่างกายโดยทั่วไปเพื่อปรับปรุงลักษณะทางกายภาพของบุคคล ศัลยแพทย์ตกแต่งอาจดำเนินการขั้นตอนเกี่ยวกับจมูก, ขากรรไกร, เปลือกตาหรือหน้าอก การเสริมเต้านมเป็นขั้นตอนดำเนินการโดยศัลยแพทย์ตกแต่งเพื่อสร้างเต้านมฟูลเลอร์และยกขึ้นซึ่งมักใช้กับการปลูกถ่ายเต้านม
ทารกคลอดก่อนกำหนดที่ต้องการการผ่าตัดที่ละเอียดอ่อนมักได้รับการรักษาโดยศัลยแพทย์ทารกแรกเกิด ศัลยแพทย์ประเภทนี้จะดำเนินการเกี่ยวกับทารกในช่วงสองสามเดือนแรกของชีวิต หลังจากทารกอายุสามหรือสี่เดือนอย่างไรก็ตามเขาจะได้รับการดูแลโดยกุมารแพทย์
ผู้ป่วยที่มีอาการบาดเจ็บที่ศีรษะหรือผู้ที่ต้องผ่าตัดสมองมักจะได้รับการรักษาโดยประสาทศัลยแพทย์ ศัลยแพทย์เหล่านี้ซ่อมแซมอาการบาดเจ็บที่กะโหลกศีรษะและสมองรวมถึงรักษาอาการตกเลือดในสมอง ระบบประสาทยังทำงานกับผู้ป่วยที่มีเนื้องอกในสมอง ประสาทส่วนใหญ่ยังทำการผ่าตัดไขสันหลัง
ผู้หญิงที่ต้องการถอนมดลูกซึ่งเป็นที่รู้จักในนามมดลูกจะได้รับการรักษาโดยศัลยแพทย์ทางนรีเวช ศัลยแพทย์ประเภทนี้ยังทำการผ่าซีซาร์เพื่อส่งทารกเมื่อคลอดในช่องคลอดไม่เป็นไปได้ ศัลยแพทย์ทางนรีเวชดำเนินการขั้นตอนอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับระบบสืบพันธุ์ของผู้หญิง
โรคตารวมถึงต้อกระจกม่านตาและต้อหินมักต้องได้รับการผ่าตัดโดยจักษุแพทย์ผู้เชี่ยวชาญ ศัลยแพทย์ประเภทนี้ทำการผ่าตัดโดยเฉพาะเพื่อแก้ไขปัญหาสายตาหรือการมองเห็นที่ถูกต้อง การแก้ไขสายตาด้วยเลเซอร์เป็นขั้นตอนอื่นที่จักษุแพทย์ดำเนินการ
