ผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบินทำการตรวจร่างกายกับผู้ควบคุมการจราจรทางอากาศที่อาจเกิดขึ้นหรือในปัจจุบันและนักบินเพื่อช่วยในการพิจารณาว่าเหมาะสมที่จะปฏิบัติหน้าที่ตามที่พวกเขาต้องการหรือไม่ ร่างกายรวมถึงการได้รับประวัติทางการแพทย์อย่างละเอียดและพิจารณาว่าผู้ป่วยมีปัญหาสุขภาพใด ๆ ที่อาจเป็นอุปสรรคต่อการปฏิบัติงานของเขาหรือเธอหรือทำให้ผู้อื่นตกอยู่ในความเสี่ยง จากนั้นผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบินจะส่งข้อมูลนี้พร้อมกับคำแนะนำไปยังคณะกรรมการใบรับรองการแพทย์ บุคคลอาจปฏิบัติหน้าที่เหล่านี้เป็นส่วนหนึ่งของการปฏิบัติงานปกติของเขาหรือเธอทำงานให้กับสายการบินสนามบินหรือโครงการฝึกอบรมนักบินร่วมกับการปฏิบัติทางคลินิกปกติของเขาหรือเธอ
ส่วนแรกของงานผู้ตรวจสอบทางการแพทย์คือการได้รับประวัติทางการแพทย์เต็มรูปแบบจากผู้ป่วย ซึ่งรวมถึงการขอประวัติจากแพทย์ปฐมภูมิของผู้ป่วยและสอบถามผู้ป่วยในระหว่างการตรวจ โดยทั่วไปแล้วข้อมูลที่จำเป็นจะต้องมีประวัติครอบครัวของปัญหาสุขภาพทางพันธุกรรมปัญหาหัวใจและปัญหาทางการแพทย์อื่น ๆ ที่อาจส่งผ่านไปยังผู้ป่วย ผู้ตรวจการแพทย์การบินจะต้องได้รับข้อมูลจากผู้ป่วยเกี่ยวกับปัญหาสุขภาพที่ผ่านมาของเขาหรือเธอสถานะปัจจุบันของสุขภาพของเขาหรือเธอและข้อมูลเกี่ยวกับยาในปัจจุบัน
การตรวจร่างกายของผู้ป่วยก็เป็นส่วนหนึ่งของการเป็นผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบิน ในส่วนของงานนี้แพทย์จะทดสอบการเคลื่อนไหวของผู้ป่วยฟังหัวใจของเขาหรือเธอและตรวจสอบปฏิกิริยาตอบสนอง การทดสอบการมองเห็นอย่างละเอียดซึ่งทำหน้าที่ตรวจสอบการมองเห็นของผู้ป่วยและการมองเห็นต่อพ่วง
เมื่อรวบรวมข้อมูลที่จำเป็นทั้งหมดแล้วผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบินจะจัดระเบียบข้อมูลตามแนวทางของหน่วยงานที่ออกและส่งข้อมูลดังกล่าวในนามของผู้ป่วยต่อหน่วยงาน จากการฝึกอบรมผู้ตรวจสอบทางการแพทย์ด้านการบินโดยทั่วไปแล้วแพทย์จะรวมข้อมูลว่าผู้ป่วยมีคุณสมบัติตรงตามข้อกำหนดทั้งหมดสำหรับใบรับรองแพทย์หรือไม่ ในหลายกรณีผู้ตรวจสอบจะให้สำเนารายงานผู้ป่วยด้วย
ในประเทศส่วนใหญ่ผู้ทำการทดสอบทางการแพทย์ด้านการบินจำเป็นต้องรักษาเวชปฏิบัติทางคลินิกในขณะที่ทำการทดสอบสำหรับนักบินและผู้ควบคุมการจราจรทางอากาศ ผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบินส่วนใหญ่มีการปฏิบัติงานประจำหรือทำงานเพื่อฝึกหัดและให้บริการกับคนในท้องถิ่นที่ต้องการขอใบรับรองแพทย์ ในบางกรณีผู้ตรวจการแพทย์ด้านการบินจะได้รับสัญญากับสายการบินหรือโรงเรียนฝึกอบรมนักบินและให้การตรวจทางการแพทย์โดยเฉพาะสำหรับผู้ที่ทำงานให้กับสายการบินหรือโรงเรียนหรือสำหรับนักบินที่มีศักยภาพ
