แม้ว่าจะไม่มีวิธีที่จะป้องกันความผิดพลาดในการหลีกเลี่ยงอาหารเป็นพิษจากหอยได้อย่างสมบูรณ์ แต่มีขั้นตอนในการทำให้การบริโภคปลอดภัย อาหารเป็นพิษจากหอยส่วนใหญ่มักเกิดขึ้นเมื่อบริโภคหอยจากน้ำที่อาจปนเปื้อนโดยกระแสน้ำสีแดงหรือที่เพิ่งปนเปื้อน อุตสาหกรรมหอยในเชิงพาณิชย์มีการควบคุมและตรวจสอบการปฏิบัติงานเป็นประจำทำให้หอยที่เตรียมในเชิงพาณิชย์ส่วนใหญ่ปลอดภัยในการกิน อาหารเป็นพิษจากหอยส่วนใหญ่เกิดขึ้นเมื่อมือสมัครเล่นรวบรวมและกินหอยที่ปนเปื้อน นอกจากนี้ยังเสี่ยงที่จะกินหอยดิบหรือสุก ๆ
เช่นเดียวกับอาหารอื่น ๆ หอยสามารถปนเปื้อนแบคทีเรียและจุลินทรีย์ที่เป็นอันตรายผ่านการจับที่ไม่เหมาะสม ควรหาหอยจากแหล่งที่เชื่อถือได้เสมอ อย่ากินหอยใด ๆ หากไม่แน่ใจในแหล่งที่มา อาหารทะเลใด ๆ ควรเตรียมด้วยมือที่ล้างแล้วและอุปกรณ์ทำความสะอาดและในพื้นที่ทำงานที่สะอาด การปรุงหอยอย่างละเอียดจะฆ่าจุลินทรีย์ที่เป็นอันตรายจำนวนมาก
บางครั้งหอยอาจมีสารพิษที่มีความร้อนและไม่สามารถลบออกได้จากการประกอบอาหาร ทางที่ดีควรหลีกเลี่ยงการรับประทานหอยในช่วงหน้าร้อน ในช่วงที่น้ำขึ้นสีแดงประชากรแพลงก์ตอนพืชจำนวนมากจนร่างกายของพวกเขาทำให้น้ำปรากฏเป็นสีแดง สารพิษจากธรรมชาติมีการผลิตที่สามารถบริโภคโดยหอย ในฐานะที่เป็นหอยเป็นเครื่องป้อนตัวกรองร่างกายของพวกเขาสามารถสะสมสารพิษและทำให้เกิดความเจ็บป่วยต่อมนุษย์หรือสัตว์ที่กินพวกเขา
อาหารเป็นพิษจากหอยอาจเกิดขึ้นเมื่อหอยมีการปนเปื้อนไวรัสตับอักเสบเอหรือไวรัสวอล์ค นอกจากนี้ยังมีหอยที่ได้รับการยอมรับสี่ชนิดที่เป็นพิษจากการสะสมสารพิษตามธรรมชาติ ความจำเสื่อมและพิษต่อระบบประสาทของหอยอาจทำให้เกิดความเจ็บป่วย แต่ไม่มีผู้เสียชีวิตที่รู้จัก การระบาดในปี 1987 ของการเป็นพิษของหอยความจำเสื่อมในภาคตะวันออกของแคนาดามีอัตราการตาย 3 เปอร์เซ็นต์ พิษหอยอัมพาตเป็นอันตรายถึงชีวิตมากที่สุดโดยมีอัตราการเสียชีวิต 1- ถึง 12 เปอร์เซ็นต์
ประชากรบางกลุ่มมีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นจากการเป็นพิษอาหารจากหอย เหล่านี้รวมถึงเด็กและผู้สูงอายุโดยเฉพาะอย่างยิ่งหากพวกเขามีระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุก กรณีส่วนใหญ่ของพิษหอยจะแก้ไขได้ด้วยตนเอง แต่ควรไปพบแพทย์หากสงสัยว่าอาหารเป็นพิษจากหอย อาการจากพิษบางชนิดอาจปรากฏขึ้นภายในไม่กี่นาทีของการบริโภคหอยและรวมถึงการรู้สึกเสียวซ่าหรือการเผาไหม้ของริมฝีปากและลิ้น, คลื่นไส้และปวดท้อง พิษจากหอยชนิดอื่นเช่นไวรัสตับอักเสบเออาจใช้เวลาหลายสัปดาห์กว่าจะปรากฏอาการ
แม้ว่าอุบัติการณ์ของกระแสน้ำสีแดงยังคงเพิ่มขึ้นเป็นสิ่งสำคัญที่ต้องจำไว้ว่าการบริโภคหอยส่วนใหญ่มีความปลอดภัยอย่างสมบูรณ์แบบ ในฐานะที่เป็นหอยที่ได้รับในเชิงพาณิชย์อยู่ภายใต้กฎระเบียบที่เข้มงวดเกี่ยวกับการปฏิบัติประชาชนยังคงเพลิดเพลินกับหอยโดยไม่ต้องกังวลมากเกินไป โดยทั่วไปประโยชน์ทางโภชนาการของการบริโภคหอยมีแนวโน้มที่จะมีค่าเกินความเสี่ยงของการเป็นพิษโดยเฉพาะอย่างยิ่งหากได้รับหอยในเชิงพาณิชย์และปรุงสุกอย่างทั่วถึง
