การฉีดวัคซีนป้องกันโรคหัดนั้นได้รับการยกย่องจากชุมชนทางการแพทย์ว่าเป็นวัคซีนที่ปลอดภัย มีผลข้างเคียงหลายอย่างจากการฉีดวัคซีนโรคหัด แต่ส่วนใหญ่ไม่รุนแรงและสั้นในระยะเวลา ผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดคือไข้สูงและมีผื่นเล็กน้อย ผลข้างเคียงที่รุนแรงกว่าของการฉีดวัคซีนป้องกันโรคหัดคือจำนวนเกล็ดเลือดต่ำและปฏิกิริยาการแพ้ การฉีดวัคซีนโรคหัดถือว่าไม่ปลอดภัยอย่างแท้จริงสำหรับผู้ที่กำลังตั้งครรภ์แพ้ส่วนประกอบของวัคซีนหรือทรมานจากโรคภูมิคุ้มกันบกพร่อง
วัคซีนโรคหัดได้รับการฉีดวัคซีนครั้งแรกเมื่อปีพ. ศ. 2506 ในปี 1973 วัคซีนโรคหัดโรคคางทูมและโรคหัดเยอรมันเริ่มแพร่หลาย วัคซีน MMR ซึ่งทำจากการใช้สายพันธุ์ที่อ่อนแอ แต่สายพันธุ์ที่มีชีวิตของทั้งสามโรคถูกนำมาใช้ในหลายประเทศแทนที่จะใช้วัคซีนป้องกันโรคเป็นรายบุคคล แต่วัคซีนแบบยิงเดี่ยวยังคงใช้ในบางประเทศ วัคซีนเหล่านี้มักให้กับเด็กอายุ 12-15 เดือนแม้ว่าผู้ใหญ่บางคนก็จะได้รับการฉีดวัคซีนด้วยเช่นกัน
เวอร์ชั่นของโรคหัดถูกฉีดเข้าไปในผู้รับวัคซีนดังนั้นจึงมีปัญหาด้านความปลอดภัย ผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดของการฉีดวัคซีนโรคหัดคือมีไข้และมีผื่นเล็กน้อย ไข้เกิดขึ้นในผู้ที่ได้รับวัคซีน 5-15 เปอร์เซ็นต์และผู้รับ 5 เปอร์เซ็นต์จะมีผื่นขึ้นเล็กน้อย ทั้งผื่นและไข้มีแนวโน้มที่จะปรากฏเจ็ดถึง 12 วันหลังจากการฉีดวัคซีนโรคหัดและมีระยะเวลาค่อนข้างสั้น ผื่นจะไม่ถือว่าเป็นโรคติดต่อดังนั้นผู้ประสบภัยจึงไม่ต้องหยุดเรียนหรือไปทำงาน
ผลข้างเคียงที่พบได้น้อย ได้แก่ อาการแพ้และการนับเกล็ดเลือดต่ำ ภาวะเกล็ดเลือดต่ำหรือนับเกล็ดเลือดต่ำมักมีอายุสั้นและมีประสบการณ์ประมาณหนึ่งในผู้รับ 35,000 คน อาการแพ้เป็นผลมาจากปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ต่อส่วนผสมอย่างน้อยหนึ่งชนิดในวัคซีนโดยสารก่อภูมิแพ้ที่พบบ่อยที่สุดในวัคซีน ได้แก่ เจลาตินและนีโอมัยซิน ผลข้างเคียงที่รุนแรงที่สุดของการให้วัคซีนโรคหัดอาจ ได้แก่ อาการหูหนวกอาการโคม่าหรือสมองถูกทำลายอย่างถาวร ปฏิกิริยาที่รุนแรงเหล่านี้ได้รับการเห็น แต่เพราะมันเกิดขึ้นน้อยมากเจ้าหน้าที่ทางการแพทย์จึงไม่สามารถสร้างความสัมพันธ์ระหว่างสาเหตุและผลกระทบที่แน่นอนระหว่างการฉีดวัคซีนกับปัญหาที่รุนแรงเหล่านี้
การฉีดวัคซีนป้องกันโรคหัดไม่ปลอดภัยสำหรับสตรีมีครรภ์ผู้ที่แพ้ส่วนประกอบของวัคซีนป้องกันโรคหัดหรือผู้ที่ประสบจากโรคที่ทำลายระบบภูมิคุ้มกันอย่างรุนแรงเช่นโรคขาดภูมิคุ้มกันโรคเอดส์มะเร็งเม็ดเลือดขาวหรือมะเร็งต่อมน้ำเหลือง นอกจากนี้ยังไม่ปลอดภัยสำหรับผู้ที่กำลังรับการรักษาโรคมะเร็งด้วยการฉายรังสียาหรือยา corticosteriod ในปริมาณมาก การฉีดวัคซีนป้องกันโรคหัดไม่ปลอดภัยสำหรับคนดังกล่าวเนื่องจากโรคที่อ่อนแอที่ใช้ในการสร้างวัคซีนสามารถสร้างความเสียหายกลับไม่ได้ให้กับคนที่อยู่ในสภาพที่เปราะบางเป็นผลมาจากเงื่อนไขทางการแพทย์อื่น
