การสร้างภูมิคุ้มกันโรคคางทูมนั้นปลอดภัยและมีประสิทธิภาพอย่างมากในการป้องกันการโจมตีของไวรัสคางทูมในเด็กเล็ก นับตั้งแต่มีการให้วัคซีนโรคคางทูมครั้งแรกในปี พ.ศ. 2510 มีการให้ยาหลายร้อยล้านครั้งด้วยประวัติความปลอดภัยที่ยอดเยี่ยม วัคซีนแนะนำโดยกลุ่มแพทย์ชั้นนำหลายแห่งรวมถึงศูนย์ควบคุมและป้องกันโรค (CDC) นอกจากนี้ยังไม่มีหลักฐานทางวิทยาศาสตร์ว่าการฉีดวัคซีนโรคคางทูมหรือการฉีดวัคซีนอื่น ๆ ที่เป็นที่นิยมสำหรับการเจ็บป่วยในวัยเด็กเช่นโรคหัดโรคหัดเยอรมันหรือโรคฝีไก่ทำให้เกิดออทิสติก
การฉีดวัคซีนโรคคางทูมมักจะรวมกับวัคซีนอื่น ๆ และให้เป็นวัคซีนหัด - คางทูม - หัดเยอรมัน (MMR) เข็มแรกของ MMR มักจะบริหารให้กับทารกที่มีอายุ 12-16 เดือน ปริมาณแรกของการสร้างภูมิคุ้มกันโรค MMR นี้ได้รับการค้นพบว่าให้ภูมิคุ้มกัน 97% สำหรับคางทูม, 95-98 เปอร์เซ็นต์ภูมิคุ้มกันโรคหัดและ 95 เปอร์เซ็นต์ภูมิคุ้มกันโรคหัดเยอรมัน ปริมาณที่สองมักจะบริหารในเด็กวัยเรียนระหว่าง 4-6 ปี เข็มที่สองนี้มีไว้เพื่อสร้างภูมิคุ้มกันให้กับเด็กที่ไม่ตอบสนองต่อเข็มแรก
โดยทั่วไปผลข้างเคียงของวัคซีน MMR นั้นไม่รุนแรง เด็กหลายคนอาจรู้สึกเจ็บในบริเวณที่ได้รับกระสุนและอาการเจ็บอาจอยู่ได้สองสามชั่วโมง ไข้เป็นผลข้างเคียงที่พบได้ทั่วไปและเกิดขึ้นในผู้รับประมาณ 5-15 เปอร์เซ็นต์ของผู้รับทั้งหมด ผื่นเล็กน้อยอาจส่งผลกระทบต่อผู้ป่วยประมาณ 5 เปอร์เซ็นต์ ผลข้างเคียงเหล่านี้มักจะเกิดขึ้นประมาณเจ็ดถึง 12 วันหลังจากได้รับวัคซีน ปฏิกิริยารุนแรงมากขึ้นรวมถึงปฏิกิริยาการแพ้นั้นหายากมาก
ก่อนที่จะมีการเปิดตัววัคซีนคางทูมในปี 2510 ไวรัสคางทูมเป็นโรคที่พบบ่อยในวัยเด็กที่มีอาการบวมของต่อมน้ำลายหรือต่อมที่ด้านหลังใบหู หลายรายมีอาการไม่รุนแรง แต่การติดเชื้อคางทูมบางอย่างอาจนำไปสู่เยื่อหุ้มสมองอักเสบซึ่งเป็นการอักเสบของเยื่อบุรอบ ๆ สมองและไขสันหลัง ภาวะแทรกซ้อนของเยื่อหุ้มสมองอักเสบอาจทำให้หูหนวกถาวร ความเสี่ยงเหล่านี้มีมากกว่าผลข้างเคียงที่ไม่รุนแรงของการฉีดวัคซีนโรคคางทูมด้วยวัคซีน MMR
สงสัยว่าวัคซีน MMR ทำให้เกิดออทิสติกครั้งแรกเกิดขึ้นในปี 1998 ด้วยการตีพิมพ์บทความโดย Andrew Wakefield โดยอ้างถึงการศึกษาของเด็กชาวอังกฤษ 12 คนที่แสดงอาการออทิซึมหลังจากได้รับการฉีดวัคซีนป้องกันโรค MMR กระดาษถูกทำให้เสียชื่อเสียงอย่างรวดเร็วว่าเป็นเท็จ ตั้งแต่การตีพิมพ์งานวิจัยหลายชิ้นไม่ได้แสดงความเชื่อมโยงระหว่างอัตราการเป็นออทิซึมที่เพิ่มขึ้นและการใช้วัคซีน MMR
