การควบคุมโรคมาลาเรียเกี่ยวข้องกับมาตรการป้องกันและตอบโต้ที่ใช้กับห่วงโซ่มาลาเรียสามส่วนที่สำคัญคือโฮสต์มนุษย์ปรสิตที่ก่อให้เกิดโรคและผู้ให้บริการของปรสิต แม้ว่าจะมียาหลายชนิดที่สามารถรักษามาลาเรียได้ แต่ก็ยังสามารถเป็นโรคที่อันตรายถึงชีวิตได้ ปรสิตกลายเป็นดื้อต่อยาหลายชนิดตลอดหลายปีที่ผ่านมาและยังคงมีความก้าวหน้าในการรักษาและป้องกันยาเสพติด เนื้อหาที่สำคัญที่สุดของการควบคุมมาลาเรียคือการใช้มุ้งกันอย่างแพร่หลายเพื่อป้องกันไม่ให้โฮสต์ถูกกัดโดยผู้ให้บริการของโรค
มนุษย์ตกเป็นเหยื่อของโรคมาลาเรียเมื่อเขาหรือเธอสัมผัสกับปรสิตพลาสโมเดียมผ่านการกัดจากยุงตัวเมีย เนื่องจากปรสิตสามารถวางอยู่เฉยๆในโฮสต์เป็นเวลาหลายสัปดาห์หรือหลายปีผู้ป่วยอาจไม่รู้ด้วยซ้ำว่าพวกเขาได้รับผลกระทบจนกว่าผลข้างเคียงจะชัดเจน โดยทั่วไปมักใช้ยาป้องกันโรคสำหรับผู้มาเยือนระยะสั้นในพื้นที่ที่มีการติดเชื้อมาลาเรีย โดยทั่วไปแล้วยาควบคุมมาลาเรียชนิดนี้มักจะเริ่มต้นนานกว่าหนึ่งสัปดาห์ก่อนที่ผู้เยี่ยมชมจะคาดหวังว่าจะมาถึงและนำมาใช้ตลอดช่วงเวลาที่อยู่ในการเข้าพักรวมถึงหนึ่งสัปดาห์หรือมากกว่าหลังจากที่ผู้เยี่ยมชมออกไป การรักษานี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในการป้องกันปรสิตไม่ให้ถูกส่งไปยังบริเวณที่ไม่มีอยู่ในปัจจุบัน
ปรสิตที่รับผิดชอบมาลาเรียเรียกว่าพลาสโมเดียมและถูกกำจัดให้หมดไปในพื้นที่ต่าง ๆ เช่นอเมริกาเหนือและยุโรปซึ่งมีการใช้กลวิธีควบคุมมาลาเรียอย่างมีประสิทธิภาพมาระยะหนึ่งแล้ว เพื่อให้พลาสโมเดียมเจริญเติบโตต้องมีความหนาแน่นของประชากรสูงรวมกับยุงจำนวนมาก พลาสโมเดียมแสดงให้เห็นถึงความสามารถในการกลายเป็นภูมิคุ้มกันต่อยาบางชนิดตลอดทั้งปีดังนั้นการดื้อต่อยาจึงแปรปรวนและต้องได้รับการตรวจสอบอย่างระมัดระวัง
การควบคุมมาลาเรียที่พื้นฐานที่สุดมาในรูปแบบของมุ้งกันยุงเพื่อคลุมเตียงและพื้นที่นั่งเล่น แม้ว่าจะมีราคาไม่แพงและมีประสิทธิภาพ แต่การใช้ก็ยังไม่แพร่หลายพอที่จะกำจัดปรสิตในบางพื้นที่ของโลก ส่วนหนึ่งเป็นเพราะความพร้อมของมุ้งและเงินช่วยเหลือจากต่างประเทศบางส่วนที่ได้รับมอบหมายให้อยู่ในพื้นที่เสี่ยงต่อโรคมาลาเรียมีไว้เพื่อการซื้อและจำหน่ายมุ้งเท่านั้น ปัญหาบางอย่างเกิดจากการศึกษา: หมู่บ้านห่างไกลจะต้องได้รับการศึกษาตามความคิดที่ว่ายุงแพร่กระจายมาลาเรียและมุ้งมีความสำคัญต่อการกำจัดโรค
