สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของสมองผิดปกติเกิดจากปัญหาที่เกิดขึ้นในระหว่างการพัฒนาสมองของทารกในครรภ์หรือวัยเด็ก ในบางกรณีปัญหาเหล่านี้มีสาเหตุทางพันธุกรรม ในกรณีอื่น ๆ ปัญหาเกี่ยวกับการพัฒนาสมองเป็นผลมาจากปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อมรวมถึงการสัมผัสกับสารพิษหรือความเครียดจากสิ่งแวดล้อม การบาดเจ็บทางร่างกายอาจส่งผลให้เกิดการพัฒนาของสมองที่ผิดปกติ สมองผิดปกติบางอย่างจะค่อยๆปรากฏขึ้นตลอดชีวิต
สมองของมนุษย์เป็นโครงสร้างที่ซับซ้อนเป็นพิเศษ ความซับซ้อนที่แท้จริงของสมองมนุษย์หมายความว่ามีหลายวิธีที่การพัฒนาของมันจะผิดไป ปัญหาทางพันธุกรรมที่รุนแรงที่สุดมักเป็นอันตรายถึงชีวิต ปัญหาที่ร้ายแรงน้อยกว่าในการพัฒนาสมองของทารกในครรภ์มักจะสร้างโครงสร้างของสมองที่ผิดปกติ
สมองพิการเป็นภาวะที่พบได้บ่อยครั้งหนึ่งซึ่งเกิดจากการพัฒนาของสมองที่ผิดปกติ มันเป็นผลมาจากปัญหาทางพันธุกรรม โดยทั่วไปแล้วสิ่งนี้จะเชื่อมโยงกับปัญหาการพัฒนาในมดลูก เงื่อนไขนี้สามารถปรากฏในหลาย ๆ รูปแบบ แต่โดยทั่วไปแล้วส่งผลกระทบต่อความสามารถของสมองและระบบประสาทเพื่อควบคุมกล้ามเนื้อของร่างกายได้อย่างมีประสิทธิภาพ การบาดเจ็บของสมองอาจทำให้สมองพิการปรากฏขึ้นภายหลังในชีวิต
โรคลมชักเช่นสมองพิการมักเป็นผลมาจากความผิดปกติของโครงสร้างในสมอง มันอาจเกิดจากพันธุกรรมหรือปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม โรคลมชักผลิตอุบาทว์ของกิจกรรมของระบบประสาทที่ผิดปกติในสมองซึ่งอาจทำให้เกิดอาการชักหรืออาการอื่น ๆ
สารจำนวนมากที่พบในสิ่งแวดล้อมสามารถขัดขวางการพัฒนาของสมองหรือทำให้สมองเสียหายได้ ตะกั่วซึ่งส่วนใหญ่มักอยู่ในรูปแบบของสีตะกั่วนั้นเป็นหนึ่งในตัวอย่างที่รู้จักกันดีของปัญหานี้ ตะกั่วทำให้เกิดความเสียหายต่อเนื้อเยื่อสมองหลายส่วนและการได้รับสัมผัสในวัยเด็กที่มีนัยสำคัญจะ จำกัด การพัฒนาของสมอง
การบาดเจ็บทางร่างกายที่ศีรษะอาจทำให้สมองผิดปกติได้ การบาดเจ็บที่ศีรษะเพียงครั้งเดียวเช่นการถูกกระทบกระแทกไม่น่าจะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงอย่างถาวรต่อโครงสร้างของสมอง การบาดเจ็บของสมองที่รุนแรงมากขึ้นหรือซ้ำหลายครั้งอาจทำให้เกิดการบวมการตายของเนื้อเยื่อและการช้ำของเนื้อเยื่อสมอง เงื่อนไขนี้อาจก่อให้เกิดอาการจำนวนเท่าใดก็ได้เนื่องจากสมองส่วนใดส่วนหนึ่งอาจได้รับผลกระทบ
เนื้องอกในสมองและ aneurism สามารถทำให้สมองผิดปกติ เนื้องอกมักจะแทนที่หรือทำลายเนื้อเยื่อสมองที่มีสุขภาพดีในขณะที่มันเติบโต หลอดเลือดโป่งพองในสมองสามารถกดทับเนื้อเยื่อข้างเคียงทำให้เกิดอาการทางระบบประสาท
ความผิดปกติของสมองเสื่อมจากการสลายตัวของโครงสร้างและการทำงานของสมองปกติ ความผิดปกติเหล่านี้มักจะมีหลายสาเหตุ โดยทั่วไปแล้วพันธุศาสตร์มีบทบาทอย่างมากเช่นเดียวกับวิถีชีวิตและโภชนาการ
โรคอัลไซเมอร์เป็นหนึ่งในโรคเสื่อมที่พบมากที่สุดที่สามารถผลิตสมองผิดปกติ มันเกิดจากการสะสมของความเสียหายต่อสมองอย่างค่อยเป็นค่อยไปในรูปแบบของเนื้อเยื่อที่เป็นอุปสรรคต่อการทำงานของสมองปกติ tangles ของเนื้อเยื่อสนับสนุนที่ไม่ทำงานและการเชื่อมต่อระหว่างเซลล์ประสาทที่หายไป ผลลัพธ์สุดท้ายของเงื่อนไขนี้คือสมองที่ทำงานช้าลงและผิดปกติมากขึ้นกับการสูญเสียความทรงจำและการสูญเสียการควบคุมอารมณ์เป็นอาการที่พบบ่อย โรคนี้พบได้บ่อยในผู้สูงอายุ
หลายเส้นโลหิตตีบเป็นเรื่องธรรมดาน้อยกว่ามาก แต่มีผลกระทบในวงกว้างที่คล้ายกันในสมอง โรคนี้ซึ่งเชื่อกันโดยทั่วไปว่าเป็นภาวะภูมิคุ้มกันอัตโนมัติทำให้เกิดการสลายของการเคลือบป้องกันรอบเส้นใยประสาท การสูญเสียของสารเคลือบผิวนี้ทำให้เส้นประสาทสามารถส่งข้อมูลได้น้อยลง โรคมักจะดำเนินไปแล้วกลับกำเริบ แต่หลักสูตรโดยรวมของโรคก่อให้เกิดการเสื่อมของสมอง
