การปรากฏตัวของแบคทีเรียในน้ำอสุจิถือเป็นเรื่องปกติในกรณีส่วนใหญ่เนื่องจากมีการพบวัฒนธรรมตามธรรมชาติในระบบทางเดินปัสสาวะและอวัยวะเพศ ในบางกรณีแบคทีเรียที่มีสุขภาพดีนี้สามารถเติบโตได้จากการควบคุมนำไปสู่การติดเชื้อ การติดเชื้อภายในอวัยวะเพศหรือต่อมลูกหมากอาจทำให้เกิดแบคทีเรียในน้ำอสุจิในระดับสูง การมีเพศสัมพันธ์กับหุ้นส่วนที่ติดเชื้ออาจทำให้เกิดการติดเชื้อที่อวัยวะเพศหรือทางเดินปัสสาวะแม้ว่าจะมีโอกาสน้อยที่จะเกิดขึ้น
ผู้ชายที่มีสุขภาพดีทุกคนมีเชื้อแบคทีเรียบางระดับในน้ำอสุจิ พืชเหล่านี้เกิดขึ้นตามปกติในอาณานิคมในระบบสืบพันธุ์และทางเดินปัสสาวะและมักจะไม่ก่อให้เกิดอันตรายใด ๆ ในผู้ชายที่ไม่ได้เข้าสุหนัตอาจเป็นแบคทีเรียอยู่หลังหนังหุ้มปลายลึงค์ แบคทีเรียที่มากเกินไปสามารถป้องกันได้ผ่านสุขอนามัยที่เหมาะสม ผู้ที่ไม่ได้ล้างหนังหุ้มปลายลึงค์ของพวกเขาอย่างถูกต้องอาจมีอาการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะหรือมีแบคทีเรียมากกว่าปกติในน้ำอสุจิ
การล่าอาณานิคมของแบคทีเรียไม่ถือว่าเป็นการติดเชื้อ การติดเชื้อมักเกี่ยวข้องกับอาการเพิ่มเติมเช่นความถี่ปัสสาวะหรือความเร่งด่วน อาการอื่น ๆ ของการติดเชื้อ ได้แก่ ไข้หนองหรือเลือดที่มาจากอวัยวะเพศชายการไหลผิดปกติหรือความเจ็บปวด บางครั้งก็ไม่ทราบสาเหตุของการติดเชื้อ แบคทีเรียปกติสามารถเติบโตได้เร็วกว่าปกติด้วยเหตุผลหลายประการรวมถึงปัญหาเกี่ยวกับฮอร์โมนความเครียดผิดปกติหรือความเจ็บป่วยอื่น
แบคทีเรียจำนวนมากในน้ำอสุจิอาจเกิดจากการติดเชื้อผ่านทางเพศสัมพันธ์กับคู่ค้าที่ติดเชื้อ ผู้หญิงที่ติดเชื้อแบคทีเรียในช่องคลอดสามารถแพร่กระจายแบคทีเรียที่เป็นอันตรายผ่านการมีเพศสัมพันธ์ สิ่งนี้ไม่ถือว่าเหมือนกับโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ซึ่งส่วนใหญ่เกิดจากไวรัส เมื่อสิ่งนี้เกิดขึ้นผู้ชายมักจะสังเกตเห็นอาการของการติดเชื้อ โดยทั่วไปแพทย์จะเป็นผู้ตรวจจับแบคทีเรียในน้ำอสุจิ
การบวมของต่อมลูกหมากยังสามารถนำไปสู่การติดเชื้อได้เนื่องจากต่อมลูกหมากบวมไม่อนุญาตให้ปัสสาวะเต็ม จากนั้นแบคทีเรียจะได้รับอนุญาตให้เจริญเติบโตภายในกระเพาะปัสสาวะและจากนั้นสามารถย้ายเข้าไปในระบบสืบพันธุ์ เงื่อนไขนี้พบได้ทั่วไปในผู้สูงอายุเนื่องจากมีแนวโน้มที่จะขยายต่อมลูกหมากโต
ในกรณีส่วนใหญ่การรักษาแบคทีเรียจำนวนมากในน้ำอสุจิรวมถึงการใช้ยาปฏิชีวนะ ประเภทของยาที่ใช้จะขึ้นอยู่กับชนิดของแบคทีเรียที่มีอยู่ ในกรณีที่หายากผู้ชายที่ไม่ได้เข้าสุหนัตอาจตัดหนังหุ้มปลายลึงค์ของเขาออกเนื่องจากการติดเชื้อซ้ำหากแบคทีเรียเกิดจากการเจริญของอวัยวะภายในหนังหุ้มปลายองคชาติ นี่เป็นเรื่องผิดปกติในเพศชายที่ฝึกฝนสุขอนามัยที่เหมาะสม ผู้ชายที่มีต่อมลูกหมากโตมักได้รับยาเพื่อลดอาการบวมและยังสามารถรักษาอาการต่อมลูกหมากได้
