ในขณะที่อาการของตัวเองอาจฟังดูน่ากลัวหนองในลำคอเป็นสัญญาณของการติดเชื้อบางประเภท แพทย์มักจะสังเกตเห็นในระหว่างการตรวจร่างกายของคอหนองในช่องว่างภายในศีรษะและคอหรือลำคอมักจะรู้สึกในรูปแบบของต่อมน้ำเหลืองบวม โดยทั่วไปจะเรียกว่าฝีฝีหนองจะประกอบด้วยของเหลวที่มีแบคทีเรียเซลล์ที่ตายแล้วและสิ่งอื่น ๆ ที่อยู่ภายใน หนองในคอที่พบมากที่สุดสองชนิดคือฝีในช่องท้องและฝีในช่องคอหอย
ฝีในช่องท้องคือการสะสมของหนองรอบ ๆ บริเวณต่อมทอนซิลซึ่งเป็นอวัยวะต่อมน้ำเหลืองตั้งอยู่ที่ด้านหลังของลำคอ บางครั้งเรียกว่า quinsy ฝีชนิดนี้พบได้บ่อยในเด็กโตและวัยรุ่น ฝี retropharyngeal คือการสะสมของหนองหลังคอหอย บ่อยครั้งที่อาการของการติดเชื้อทางเดินหายใจส่วนบนฝีชนิดนี้พบได้บ่อยในเด็กเล็กหรือผู้ที่มีอวัยวะน้ำเหลืองมีขนาดใหญ่เป็นพิเศษ
หนองในลำคอถือเป็นภาวะแทรกซ้อนหรืออาการรองของปัญหาหลัก ต่อมทอนซิลอักเสบ, คออักเสบ, เยื่อหุ้มสมองอักเสบหรือการติดเชื้อชนิดอื่นอาจส่งผลให้หนองโดยเฉพาะอย่างยิ่งถ้าปล่อยทิ้งไว้โดยไม่ได้รับการรักษาหรือรักษาด้วยยาปฏิชีวนะที่แบคทีเรียไม่ตอบสนอง
การวินิจฉัยฝีในบริเวณคอมักเริ่มต้นด้วยการตรวจร่างกายและประวัติทางการแพทย์เมื่อเร็ว ๆ นี้ ต่อมน้ำเหลืองบวมสามารถรู้สึกได้และการตรวจด้วยสายตาของลำคอมักจะพบฝีใด ๆ อาการที่น่าจะเกิดขึ้นก่อนและระหว่างการติดเชื้อ ได้แก่ ไข้หนาวสั่นเจ็บคอกลืนลำบากบวมใบหน้าปวดหรืออ่อนโยนหรือกรามบริเวณขากรรไกรและลำคอ การทดสอบเพิ่มเติมเช่นวัฒนธรรมลำคอเลือดหรือการตรวจชิ้นเนื้ออาจได้รับคำสั่งจากแพทย์ผู้รักษา
หากพบว่ามีการติดเชื้อตั้งแต่เนิ่น ๆ และไม่พบหนองในลำคอการใช้ยาปฏิชีวนะอาจพิสูจน์ได้ว่าเป็นการรักษาที่เพียงพอ ฝีที่มีขนาดใหญ่หรือไม่ตอบสนองมักจะต้องการการกรีดและการระบายน้ำนอกเหนือจากการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะ หากต่อมทอนซิลหรือโรคเนื้องอกในจมูกแสดงอาการเรื้อรังของการติดเชื้อหรือการขยายใหญ่อาจจำเป็นต้องมีการผ่าตัดเอาอวัยวะที่ละเมิดออก
ตามกฎทั่วไปการติดเชื้อส่วนใหญ่ของคอไม่รุนแรงอย่างไรก็ตามอาการเจ็บคอยาวนานกว่าสามวันหรือมีไข้หนาวสั่นไม่สามารถกลืนหรือปวดอื่น ๆ ควรได้รับการตรวจจากแพทย์ อย่าใช้ยาแก้ปวดสำหรับอาการเจ็บคอเป็นเวลานานกว่าสามวันเว้นแต่จะได้รับคำแนะนำจากแพทย์ ยิ่งมีการติดเชื้อเกิดขึ้นเร็วเท่าไหร่อาการทุติยภูมิก็จะรุนแรงน้อยลงและเร็วขึ้นและง่ายขึ้นในการรักษา
