โรคหนองในที่ไม่ได้รับการรักษาอาจส่งผลให้เกิดภาวะแทรกซ้อนทางการแพทย์ที่รุนแรงสำหรับชายและหญิงรวมถึงการเป็นหมัน ยิ่งโรคหนองในของผู้ป่วยสูงขึ้นเท่าใดโอกาสที่ผู้ป่วยจะมีอาการแทรกซ้อนก็จะยิ่งสูงขึ้นเท่านั้น เนื่องจากหนองในไม่ทำให้เกิดอาการเสมอแนะนำให้ผู้ที่มีเพศสัมพันธ์ควรได้รับการตรวจคัดกรองโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ (STIs) เป็นประจำเพื่อระบุการติดเชื้อเช่นหนองใน แต่เนิ่น ๆ เพื่อให้สามารถรักษาก่อนที่จะเกิดปัญหาร้ายแรง ยาปฏิชีวนะมักจะเพียงพอที่จะฆ่าสิ่งมีชีวิตที่ทำให้เกิดการติดเชื้อนี้
หนึ่งในผลที่พบบ่อยที่สุดของโรคหนองในที่ไม่ได้รับการรักษาในผู้หญิงคืออาการที่เรียกว่าโรคกระดูกเชิงกรานอักเสบซึ่งเกิดจากการอักเสบเรื้อรังของโครงสร้างในอุ้งเชิงกราน เงื่อนไขนี้อาจทำให้เกิดการมีประจำเดือนเจ็บปวดแท้งบุตรยากและการตั้งครรภ์นอกมดลูกซึ่งการปลูกถ่ายไข่ที่ปฏิสนธิในท่อนำไข่แทนที่จะเป็นมดลูก ผู้ชายสามารถพบการอักเสบที่คล้ายกันของต่อมลูกหมากท่อปัสสาวะและโครงสร้างอื่น ๆ รอบอวัยวะเพศ
นอกจากนี้ยังเป็นไปได้สำหรับโรคหนองในที่จะเดินทางผ่านร่างกายในกระแสเลือด ผู้ป่วยสามารถสัมผัสกับสภาพที่หายากที่เรียกว่า perihepatitis ซึ่งบริเวณรอบ ๆ ตับจะอักเสบ พวกเขายังสามารถพัฒนาการติดเชื้อ gonococcal แพร่กระจาย (DGI) หรือที่เรียกว่าโรคข้ออักเสบ gonococcal ที่การติดเชื้อแพร่กระจายไปยังโครงสร้างเช่นข้อต่อหัวใจและสมอง เงื่อนไขเหล่านี้อาจทำให้เกิดภาวะแทรกซ้อนที่อาจถึงแก่ชีวิตสำหรับผู้ป่วย
ผู้ป่วยโรคหนองในที่ไม่ได้รับการรักษาก็มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นจากการติดเชื้อไวรัสเอชไอวี (HIV) สิ่งมีชีวิตสามารถติดเชื้อที่ตาทำให้เกิดเยื่อบุตาอักเสบและปัญหาอื่น ๆ ในหญิงตั้งครรภ์เป็นไปได้สำหรับทารกที่จะทำสัญญาโรคหนองในระหว่างการคลอด สิ่งนี้สามารถนำไปสู่การตาบอดและความเสี่ยงของ DGI ในทารก การดูแลป้องกันโรคสามารถให้ในระหว่างแรงงานและการจัดส่งเพื่อลดความเสี่ยงของโรคหนองในผ่านไปยังเด็ก
เมื่อโรคแทรกซ้อนจากโรคหนองในที่ไม่ได้รับการรักษาก็สามารถรักษาได้ยากขึ้น ในขณะที่ยาปฏิชีวนะสามารถฆ่าสิ่งมีชีวิตในร่างกายความเสียหายที่เกิดจากการอักเสบและการติดเชื้อไม่ใช่เรื่องง่ายที่จะซ่อมแซม ผู้ป่วยอาจประสบปัญหาสุขภาพเรื้อรังรวมถึงภาวะมีบุตรยาก การมีพฤติกรรมเชิงรุกเกี่ยวกับสุขภาพทางเพศสามารถลดความเสี่ยงในการเกิดภาวะแทรกซ้อนทางการแพทย์ถาวรจากโรคหนองในที่ไม่ได้รับการรักษาโดยการจับการติดเชื้อก่อนที่จะมีโอกาสแพร่กระจาย การมีเพศสัมพันธ์ที่ปลอดภัยยิ่งขึ้นจะช่วย จำกัด โอกาสของการติดเชื้อที่ติดต่อทางเพศสัมพันธ์ในครั้งแรก นี่เป็นสิ่งสำคัญเนื่องจาก STIs ไม่สามารถรักษาได้อย่างง่ายดายเหมือนโรคหนองใน
