สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของอาการเจ็บคอและปวดคอคือการติดเชื้อไวรัสของระบบทางเดินหายใจส่วนบนเช่นหวัดไข้หวัดใหญ่หรือโมโนนีโอซิส ไวรัสเหล่านี้มักจะรักษาด้วยการนอนพักและของเหลวจำนวนมาก อีกสาเหตุที่พบบ่อยคือคอ strep การติดเชื้อแบคทีเรียในลำคอ
โรคหวัดอาจเกิดจากไวรัสหลายชนิดที่พบบ่อยที่สุดคือ rhinovirus บางครั้งความเย็นอาจทำให้เกิดอาการปวดคอและลำคอ อาการหวัดอื่น ๆ ได้แก่ อาการน้ำมูกไหลหรือคัดจมูกคัดจมูกและลำคอกล้ามเนื้อเจ็บและเหนื่อยล้า ไม่มีทางรักษาสำหรับโรคไข้หวัด การนอนพักและของเหลวสามารถช่วยให้คนเราฟื้นตัวได้เร็วขึ้นและยาแก้ปวดและยาแก้ไอที่มีขายตามร้านขายยาอาจช่วยบรรเทาอาการได้
เช่นไข้หวัดไข้หวัดใหญ่เกิดจากการติดเชื้อไวรัส อาการของโรคไข้หวัดใหญ่ ได้แก่ อาการเจ็บคอและปวดคอรวมถึงความแออัดกล้ามเนื้อเจ็บไข้และอ่อนเพลีย อาการเหล่านี้คล้ายกับอาการหวัดมากอย่างไรก็ตามในกรณีของไข้หวัดพวกเขามีแนวโน้มที่จะรุนแรงและเริ่มมีอาการในทันที
แม้ว่าไข้หวัดใหญ่มักจะพัฒนาตัวมันเองด้วยการนอนพักบนเตียงเด็กเล็กผู้สูงอายุและผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอมีความเสี่ยงต่อโรคแทรกซ้อน อาจจำเป็นต้องพบแพทย์หากมีอาการไข้หวัดรุนแรงมากหรือไม่ดีขึ้นหลังจากผ่านไป 1-2 สัปดาห์โดยเฉพาะผู้ที่มีความเสี่ยงสูง แพทย์อาจสั่งยาต้านไวรัสเพื่อช่วยให้ร่างกายต่อสู้กับการติดเชื้อ
Mononucleosis เรียกอีกอย่างว่า "โรคจูบ" เป็นอีกสาเหตุที่เป็นไปได้ของอาการเจ็บคอและปวดคอ มันเกิดจากไวรัสที่ส่งผ่านน้ำลาย อาการของ mononucleosis นั้นคล้ายกับอาการของไข้หวัดใหญ่หรือหวัด อาการอื่น ๆ ได้แก่ ต่อมทอนซิลและความอ่อนแอบวม โดยทั่วไปแล้วการนอนพักและของเหลวเป็นวิธีที่ดีที่สุดในการรักษาภาวะมีเชื้อร่วมแม้ในบางกรณีจะมีการติดเชื้อทุติยภูมิ หากอาการไม่ดีขึ้นในหนึ่งหรือสองสัปดาห์อาจจำเป็นต้องพบแพทย์
หลายคนที่มีคอ strep ยังมีอาการเจ็บคอและปวดคอ อาการหลักของคอ strep คืออาการปวดคอ, กลืนลำบาก, ต่อมทอนซิลแดงและบวม, ไข้, ปวดหัว, และความเหนื่อยล้า Strep คอหอยรับการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะเช่นเพนิซิลลิน การติดเชื้อ strep หากไม่ได้รับการรักษาสามารถแพร่กระจายไปทั่วร่างกายอย่างไรก็ตามการรักษานั้นง่ายและมีประสิทธิภาพและดังนั้นภาวะแทรกซ้อนดังกล่าวจึงหายาก
