อาการเจ็บคอเรื้อรังมักเกิดจากการระคายเคืองต่อเนื่องและมักเกิดขึ้นกับผู้สูบบุหรี่หรือผู้ที่อาศัยอยู่ในพื้นที่ที่มีมลพิษสูง ผู้ที่ใช้เสียงเป็นประจำเป็นระยะเวลานานเช่นนักร้องอาจพัฒนาอาการเจ็บคอเรื้อรังหากเสียงไม่ได้พักผ่อนอย่างเหมาะสมระหว่างการแสดง การติดเชื้อไวรัสเอชไอวี (Human Immunodeficiency Virus หรือ HIV) อาจทำให้เกิดอาการเจ็บคอในระยะยาวซึ่งมักเกิดจากการติดเชื้อครั้งที่สอง สาเหตุเพิ่มเติมอาจรวมถึงโรคภูมิแพ้และกรดไหลย้อน
ซึ่งแตกต่างจากสาเหตุไวรัสหรือแบคทีเรียของเจ็บคอ, ระคายเคืองเช่นควันบุหรี่หรือมลพิษสามารถทำให้เกิดการระคายเคืองในลำคอที่ยังคงอยู่สำหรับสัปดาห์เดือนหรือแม้กระทั่งปีถ้าระคายเคืองอยู่อย่างต่อเนื่อง ผู้สูบบุหรี่อาจมีอาการเจ็บคอเรื้อรังเนื่องจากควันและสารเคมีถูกสูดดมเข้าไปในลำคอและโพรงจมูกอย่างต่อเนื่อง มลพิษในอากาศเป็นสาเหตุที่พบบ่อยและเป็นปัญหาที่พบบ่อยในพื้นที่ที่มีหมอกควันปริมาณมาก
การร้องเพลงหรือตะโกนยังสามารถนำไปสู่อาการเจ็บคอเรื้อรังและโดยทั่วไปแล้วจะยืนยาวในผู้ที่ใช้เสียงเป็นประจำ สิ่งนี้อาจเกิดขึ้นกับนักร้องที่ไม่ได้อบอุ่นร่างกายหรือพยายามแสดงมากเกินไปในช่วงเวลาสั้น ๆ การระคายเคืองในลำคอที่เกิดจากความเครียดสามารถแก้ไขได้โดยการงดการร้องเพลงตะโกนหรือพูดมากเกินไป บางครั้งสเปรย์ที่คอหรือน้ำผึ้งที่เติมลงในชาอุ่นอาจเป็นประโยชน์เช่นกัน
การติดเชื้อเอชไอวีมักจะนำไปสู่อาการเจ็บคอเรื้อรังโดยทั่วไปจากดงหรือติดเชื้อไวรัสอื่น เนื่องจากผู้ที่ติดเชื้อเอชไอวีได้ทำให้ระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอลงในกรณีที่มีความก้าวหน้ามากขึ้นอาจเป็นการยากที่จะกำจัดการติดเชื้อที่ทำให้เกิดอาการเจ็บคอ การรักษาด้วยยาบรรเทาอาการปวดตามเคาน์เตอร์รวมถึงการใช้ยาเสริมภูมิคุ้มกันหรือวิตามินอาจช่วยได้
การแพ้ยังสามารถทำให้เกิดอาการเจ็บคอเรื้อรังด้วยเหตุผลหลายประการ สำหรับหนึ่งพวกเขาสามารถนำไปสู่ทางเดินหายใจแห้งและระคายเคืองเมื่อสารก่อภูมิแพ้สูดดมผ่านทางปาก ซึ่งคล้ายกับวิธีการที่มลพิษหรือควันบุหรี่ทำให้ระคายเคืองคอ ประการที่สองหยดหลังจมูกสามารถทำให้รุนแรงขึ้นต่อมทอนซิลและนำไปสู่การบวมและปวดอย่างรุนแรง ยารักษาโรคภูมิแพ้อาจช่วยบรรเทาอาการได้
กรดไหลย้อนอาจทำให้เกิดอาการเจ็บคอเรื้อรังเนื่องจากกรดในกระเพาะถูกผลักเข้าไปในลำคอ ในกรณีที่รุนแรงอาจทำให้หลอดอาหารเกิดความเสียหายและแผลไหม้และปวดอย่างต่อเนื่อง อาจต้องใช้ยาและการผ่าตัดบางครั้งเพื่อบรรเทากรดในกระเพาะอาหารและหยุดความเจ็บปวด
