ผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดของ MRI คืออาการที่เกี่ยวข้องกับการนอนในที่แคบ ๆ เป็นเวลานานและอาจมีอาการวิงเวียนศีรษะปวดหลังและเหนื่อยล้า ผลข้างเคียงที่รุนแรงมากขึ้นอาจเกิดขึ้นเนื่องจากปฏิกิริยาต่อตัวกลางความคมชัดที่ใช้สำหรับ MRI ในสถานการณ์ที่หายากมากหากชิ้นส่วนโลหะอยู่ในร่างกายเครื่อง MRI อาจบังคับให้วัตถุเคลื่อนที่ภายในร่างกายซึ่งก่อให้เกิดความเสียหายร้ายแรง นี่เป็นผลข้างเคียงที่หายากมากเนื่องจากมีข้อควรระวังที่เข้มงวดเพื่อป้องกันอุบัติเหตุประเภทนี้
โดยทั่วไปแล้วผู้คนจะได้รับผลข้างเคียงจาก MRI ซึ่งดูเหมือนว่าเกิดจากผลของการถ่ายภาพด้วยคลื่นสนามแม่เหล็ก แต่ในความเป็นจริงแล้วเกิดจากการนอนนิ่งเป็นเวลานาน อาการวิงเวียนศีรษะและปวดหลังที่รายงานโดยผู้ป่วยบางรายเกือบจะเกิดจากการนอนนิ่ง ๆ บนพื้นแข็งเป็นเวลาหนึ่งชั่วโมงหรือมากกว่านั้น ความเหนื่อยล้าหลังจาก MRI มักเกิดจากความเครียดที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายภาพซึ่งอาจทำให้เหนื่อยมากกว่าที่เห็นได้ชัดในระหว่างกระบวนการ ผลข้างเคียงของ MRI เช่นอาการปวดหัวมักจะสัมพันธ์กับเสียงดังที่ได้ยินในระหว่างการทำ MRI และเป็นเรื่องธรรมดาสำหรับผู้ที่มีอาการไมเกรน
บางคนประสบผลข้างเคียงที่ไม่รุนแรงของ MRI มักจะคล้ายกับอาการแพ้เมื่อใช้สื่อความคมชัด ผลข้างเคียงของ MRI ที่รุนแรงมากสามารถเกิดขึ้นได้เมื่อผู้ป่วยมีไตวายอย่างรุนแรงและสัมผัสกับสารที่มีความเปรียบต่างที่มีแกโดลิเนียม ผลข้างเคียงนี้เป็นโรคที่เรียกว่า fibrosis nephrogenic ซึ่งรักษาไม่หายและบางครั้งถึงตาย มันไม่น่าเป็นไปได้ที่คน ๆ หนึ่งจะได้รับผลข้างเคียงนี้เนื่องจากไตวายมักจะถูกระบุก่อน MRI ที่เกี่ยวข้องกับแกโดลิเนียม
ธาตุเหล็กในร่างกายจะทำให้เกิดผลข้างเคียงที่เจ็บปวดจาก MRI น้อยมาก วัตถุแม่เหล็กไฟฟ้าสามารถเคลื่อนที่จากตำแหน่งใดก็ได้ใกล้กับเครื่อง MRI หากพวกเขาอยู่ในร่างกายพวกเขาสามารถก่อให้เกิดอันตรายที่สำคัญต่ออวัยวะภายใน คนที่อุดฟันด้วยโลหะอาจรู้สึกเสียวซ่าเล็กน้อย แต่การติดตั้งทางทันตกรรมเล็ก ๆ น้อย ๆ มักไม่เป็นปัญหาสำหรับขั้นตอน
ผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดของ MRI ดูเหมือนจะเป็นความไวสูงต่อปัญหาสุขภาพที่เป็นไปได้ เครื่อง MRI นั้นเป็นเทคโนโลยีที่เครียดและไม่คุ้นเคยบ่อยครั้งและหลายคนเริ่มกังวลเกี่ยวกับความรู้สึกซึ่งโดยปกติแล้วจะไม่ถือว่าเป็นเรื่องน่าเป็นห่วง การรับรู้รู้สึกเสียวซ่าหรือเวียนศีรษะที่ปกติจะไม่มีใครสังเกตเห็นหรือความรู้สึกเจ็บปวดใด ๆ กลายเป็นแหล่งที่มาของความกังวลที่สำคัญ ความเป็นไปได้ที่รับรู้ว่ามีผลข้างเคียงที่สำคัญทำให้เกิดอาการตื่นตระหนกเช่นกัน ผลข้างเคียงเหล่านี้สามารถหลีกเลี่ยงได้โดยการพูดคุยกับแพทย์ที่เชื่อถือได้และตระหนักว่า MRI นั้นเป็นขั้นตอนที่ปลอดภัยมาก
