การติดเชื้อในทารกแรกเกิดที่พบบ่อยที่สุดจะแพร่กระจายจากแม่สู่ลูกของเธอในมดลูกหรือเป็นทารกที่เกิด การติดเชื้อในทารกแรกเกิดบางอย่างเช่นเยื่อหุ้มสมองอักเสบและแบคทีเรียติดเชื้อพัฒนาหลังคลอดทั้งจากการเลี้ยงลูกด้วยนมหรือจากการสัมผัสกับไวรัสหรือแบคทีเรียในการตั้งค่าที่โรงพยาบาล แบคทีเรียจำนวนหนึ่งเช่น Listeria monocytogenes และกลุ่ม B streptococcus นำไปสู่การติดเชื้อในทารกแรกเกิด ไวรัสบางชนิดเช่นเริมและไวรัสตับอักเสบก็เป็นสาเหตุของการติดเชื้อในทารกแรกเกิดเช่นกัน
เยื่อหุ้มสมองอักเสบเป็นชนิดของการติดเชื้อในทารกแรกเกิดที่มักจะเกิดจากแบคทีเรียหลายชนิด ทารกที่เกิดมาพร้อมกับระบบภูมิคุ้มกันที่อ่อนแอมีแนวโน้มที่จะรับอาการเยื่อหุ้มสมองอักเสบไม่ว่าจะในระหว่างคลอดหรือจากการสัมผัสหลังจากนั้น มันอาจเป็นเรื่องยากที่จะวินิจฉัยโรคเยื่อหุ้มสมองอักเสบในขั้นต้นเนื่องจากอาการไม่เฉพาะเจาะจงและรวมถึงความไม่สะดวกไม่ยอมกินและง่วงนอน หากไม่ได้รับการรักษาอาการไขสันหลังอักเสบจะทำให้จุดอ่อนบนหัวของทารกบวม
การติดเชื้อสามารถวินิจฉัยได้โดยการแตะที่กระดูกสันหลังโดยแพทย์จะสอดเข็มเข้าไปในกระดูกสันหลังของทารกเพื่อเอาของเหลวออก หากแบคทีเรียหรือเชื้อราทำให้เยื่อหุ้มสมองอักเสบก็สามารถรักษาได้ด้วยยาปฏิชีวนะ การติดเชื้อไวรัสจะได้รับการรักษาด้วยยาต้านไวรัส โดยปกติแล้วทารกจะต้องใช้เวลาอยู่ในหอผู้ป่วยหนักขณะที่เขาพักฟื้น
Streptococcus กลุ่ม B เป็นแบคทีเรียชนิดหนึ่งที่ตำหนิการติดเชื้อเยื่อหุ้มสมองอักเสบในทารกแรกเกิด นอกจากนี้ยังสามารถนำไปสู่การติดเชื้ออื่น ๆ ของทารกแรกเกิดเช่นปอดบวมและการติดเชื้อ ทารกที่เป็นโรคปอดบวมอาจมีปัญหาในการหายใจและมีไข้ ยาปฏิชีวนะมักจะล้างการติดเชื้อใด ๆ ที่เกิดจากกลุ่ม B streptococcus
แบคทีเรียคือการติดเชื้อไม่เพียง แต่เกิดจากเชื้อแบคทีเรียเท่านั้น แต่ยังเกิดจากไวรัสเชื้อราและปรสิตอีกด้วย อาการของการติดเชื้อคล้ายกับเยื่อหุ้มสมองอักเสบทำให้โรคยากที่จะวินิจฉัย แพทย์อาจทำการตีกระดูกสันหลังหรือนำตัวอย่างเลือดไปตรวจดูว่าทารกมีภาวะติดเชื้อหรือไม่ การรักษารวมถึงการสังเกตในโรงพยาบาลพร้อมกับยาปฏิชีวนะหรือยาต้านไวรัส
การติดเชื้อในทารกแรกเกิดที่พบโดยทั่วไปยังรวมถึงโรคเริมที่ 2 ซึ่งแม่สามารถส่งต่อไปยังทารกในระหว่างการคลอด เด็กทารกที่เป็นโรคเริมมักจะแสดงอาการในช่วงสัปดาห์แรกหรือสัปดาห์ที่สองของชีวิต เริมสามารถแปลเป็นภาษาท้องถิ่นบนผิวหนังของทารกหรือเยื่อเมือกหรือทั่วร่างกายของเธอ หากปล่อยทิ้งไว้โดยไม่ได้รับการรักษาการติดเชื้อเริมที่มีการแปลสามารถแพร่กระจายไปทั่วร่างกาย
เริมทารกแรกเกิดสามารถรักษาได้ด้วย acyclovir ซึ่งเป็นยาต้านไวรัสที่มีให้ในรูปแบบของยาหรือครีมทา ทารกบางคนอาจต้องการการสนับสนุนเพิ่มเติมเช่นของเหลวในหลอดเลือดดำและเครื่องช่วยหายใจ การส่งเริมทารกแรกเกิดจากแม่สู่ลูกอาจป้องกันได้โดยการผ่าตัดคลอดทางหน้าท้องระหว่างการคลอด
