การทดสอบน้ำคร่ำสามารถให้ข้อมูลแก่ครอบครัวและผู้ให้บริการด้านสุขภาพเกี่ยวกับความเป็นอยู่ที่ดีของทารกที่กำลังพัฒนา มันสามารถช่วยแพทย์วินิจฉัยความผิดปกติทางพันธุกรรมและประเมินว่าทารกในครรภ์นั้นโตพอที่จะอยู่รอดนอกมดลูกได้หรือไม่ กระบวนการนี้ไม่ได้โดยไม่มีความเสี่ยง ภาวะแทรกซ้อนของการเจาะน้ำคร่ำอาจรวมถึงการติดเชื้อเลือดออกการรั่วไหลของน้ำคร่ำการแท้งบุตรและการบาดเจ็บของทารกในครรภ์ ในบางกรณีขั้นตอนล้มเหลวในการให้ข้อมูลที่ถูกต้องเกี่ยวกับทารกในครรภ์
โปรที่ใหญ่ที่สุดของการทดสอบน้ำคร่ำคือการให้ตัวอย่างของสารพันธุกรรมของทารกในครรภ์ที่กำลังพัฒนา ข้อมูลนี้มีความสำคัญต่อการตรวจวินิจฉัยอาการทางพันธุกรรมที่ชัดเจนยิ่งขึ้น แม้ว่าการตรวจด้วยคลื่นเสียงความถี่สูงและการทดสอบที่ทำกับเลือดมารดาสามารถแนะนำเงื่อนไขต่าง ๆ เช่นดาวน์ซินโดรม แต่การเจาะน้ำคร่ำช่วยให้การวินิจฉัยแม่นยำยิ่งขึ้น
การตรวจถุงน้ำคร่ำเป็นสิ่งสำคัญในการประเมินผู้หญิงที่เสี่ยงต่อการคลอดก่อนกำหนด ตัวอย่างที่ได้จากขั้นตอนสามารถทดสอบเพื่อประเมินว่าปอดของทารกในครรภ์โตเต็มที่ ปอดที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะอาจแนะนำให้ผู้หญิงคนนั้นพยายามตั้งครรภ์ให้นานที่สุดเพื่อให้ลูกมีโอกาสรอดชีวิตหลังคลอดที่ดีที่สุด ในทางตรงกันข้ามการทดสอบที่บ่งชี้ว่าปอดที่โตเต็มที่อาจเปลี่ยนความสมดุลในการส่งทารกคลอดก่อนกำหนด
น่าเสียดายที่มีความเสี่ยงจากการทดสอบน้ำคร่ำเป็นจำนวนมาก ความเสี่ยงบางส่วนเกี่ยวข้องกับความจริงที่ว่าการเจาะน้ำคร่ำเป็นกระบวนการที่รุกราน มีโอกาสติดเชื้อไม่ว่าจะเป็นผิวหนังของแม่หรือของน้ำคร่ำที่อยู่รอบ ๆ ตัวอ่อนในครรภ์ที่กำลังพัฒนา ผู้หญิงมีเลือดออกมากเกินไปอันเป็นผลมาจากขั้นตอน ผู้หญิงบางคนมีประสบการณ์การรั่วไหลของน้ำคร่ำอย่างต่อเนื่องจากเว็บไซต์ของเข็ม
การแท้งบุตรหลังการให้น้ำคร่ำเป็นความตั้งใจจริงของกระบวนการอื่น นักวิจัยที่แตกต่างกันได้ประเมินอัตราการสูญเสียของทารกในครรภ์ที่แตกต่างกันหลังจากการเจาะน้ำคร่ำ โดยทั่วไปความเสี่ยงหลังการแท้งบุตรจะอยู่ที่ 1.1 ถึง 2.2% นี่คือการเพิ่มขึ้นจากอัตรา 0.7 ถึง 1.5% ในผู้หญิงที่เทียบเคียงที่ไม่ได้รับการเจาะน้ำคร่ำ กล่าวอีกนัยหนึ่งความเสี่ยงของการแท้งบุตรที่เกี่ยวข้องกับขั้นตอนมีตั้งแต่หนึ่งใน 300 ถึงหนึ่งใน 500
ความเสี่ยงอื่น ๆ ของการทดสอบน้ำคร่ำสามารถดูได้จากขั้นตอนการลดลง เข็มสามารถทำร้ายทารกในครรภ์ที่กำลังพัฒนาแม้ว่าความเสี่ยงนี้จะเกิดขึ้นได้ยากเนื่องจากเป็นวิธีการทั่วไปที่ใช้อัลตร้าซาวด์เพื่อนำทางเข็ม บางครั้งเซลล์ที่ได้รับในน้ำคร่ำจะไม่ได้เป็นตัวแทนของการแต่งหน้าทางพันธุกรรมของทารกในครรภ์ที่กำลังพัฒนาและการวินิจฉัยทางพันธุกรรมที่ได้จากการวิเคราะห์เซลล์เหล่านี้อาจไม่ถูกต้อง กระบวนการนี้ไม่ประสบความสำเร็จเสมอซึ่งหมายความว่าในบางครั้งอาจมีการสะสมของของไหลไม่เพียงพอสำหรับการวิเคราะห์อย่างเต็มรูปแบบ
