ผลข้างเคียงของกลูโคซามีนซัลเฟตมักจะไม่รุนแรงแม้ว่าอาการที่น่ารำคาญใด ๆ ที่เกิดขึ้นหลังจากทานยานี้ควรรายงานให้แพทย์ทราบเพื่อทำการประเมินต่อไป ผลข้างเคียงที่รายงานบ่อยที่สุดบางอย่าง ได้แก่ คลื่นไส้ท้องเสียหรือท้องผูก ผลข้างเคียงเพิ่มเติมของกลูโคซามีนซัลเฟตอาจรวมถึงอาการปวดศีรษะเวียนศีรษะหรือปฏิกิริยาทางผิวหนัง ผู้ที่แพ้หอยหรือเป็นโรคเบาหวานควรใช้ยานี้ภายใต้การดูแลโดยตรงของแพทย์ หากมีคำถามหรือข้อสงสัยเกี่ยวกับผลข้างเคียงที่อาจเกิดขึ้นจากกลูโคซามีนซัลเฟตในแต่ละบุคคลควรปรึกษาแพทย์หรือผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์
การรบกวนระบบทางเดินอาหารเป็นผลข้างเคียงที่พบบ่อยที่สุดของกลูโคซามีนซัลเฟต อาการประเภทนี้อาจรวมถึงอาการคลื่นไส้อาเจียนหรือท้องเสีย ผู้ป่วยบางรายอาจมีอาการท้องผูกหรือสลับกันระหว่างอุบาทว์ของอาการท้องผูกและท้องเสีย อิจฉาริษยาเบื่ออาหารหรือปวดท้องอาจเกิดขึ้นได้ ผลข้างเคียงบางส่วนเหล่านี้อาจลดลงโดยการใช้ยากับอาหารหรือนม
อาจมีอาการนอนไม่หลับปวดศีรษะหรือเวียนศีรษะเมื่อรับประทานกลูโคซามีนซัลเฟต ยานี้อาจเพิ่มความเสี่ยงของการมีเลือดออกโดยเฉพาะอย่างยิ่งในผู้ที่มีเลือดออกผิดปกติ ยาหรืออาหารเสริมสมุนไพรบางชนิดอาจเพิ่มความเสี่ยงเหล่านี้ดังนั้นควรปรึกษาแพทย์ก่อนใช้ ปฏิกิริยาทางผิวหนังเช่นผื่นคันหรือแสบร้อนอาจเกิดขึ้นได้ในบางคนที่ใช้กลูโคซามีนซัลเฟต ในขณะที่ปฏิกิริยาทางผิวหนังเหล่านี้มักจะไม่รุนแรงการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญใด ๆ บนผิวหนังควรรายงานให้แพทย์ทราบเพื่อกำจัดการแพ้ที่อาจเกิดขึ้น
ผู้ที่แพ้หอยควรใช้ยานี้ภายใต้การดูแลโดยตรงของแพทย์ กลูโคซามีนซัลเฟตทำจากเปลือกของกุ้งก้ามกรามหรือกุ้ง คนส่วนใหญ่ที่มีอาการแพ้หอยเพียงปฏิกิริยากับเนื้อสัตว์ของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้แม้ว่าจะมีรายงานบางอย่างของปฏิกิริยาที่คล้ายกันเมื่อใช้ยานี้
ผลข้างเคียงบางประการของกลูโคซามีนซัลเฟตอาจรวมถึงการเปลี่ยนแปลงระดับน้ำตาลในเลือดหรืออาการของโรคหอบหืดเช่นไอหายใจดังเสียงฮืด ๆ หรือหายใจลำบาก ผู้ป่วยเบาหวานควรปรึกษาแพทย์ก่อนใช้ยานี้เนื่องจากอาจมีการแนะนำให้ตรวจเลือดบ่อยขึ้น ผู้ที่เป็นโรคหอบหืดหรือโรคทางเดินหายใจอื่น ๆ อาจไม่แนะนำให้ใช้กลูโคซามีนซัลเฟต
ในบางกรณีอาจเกิดอาการแพ้อย่างรุนแรงและเป็นอันตรายถึงชีวิตที่เรียกว่าภาวะภูมิแพ้โดยทั่วไปอาจเกิดขึ้นเมื่อทานกลูโคซามีนซัลเฟต อาการที่เกิดจากอาการแพ้อาจรวมถึงการบวมใบหน้าหายใจลำบากและเจ็บหน้าอก อาการเหล่านี้ควรได้รับการปฏิบัติอย่างเร่งด่วนเนื่องจากอาจเสียชีวิตภายในไม่กี่นาทีโดยไม่ต้องพบแพทย์ทันที
