สาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของการเป็นแผลที่ปากในเด็กนั้นผิดพลาด แผลในช่องปากที่เกิดจากการใช้แปรงสีฟันการกัดแก้มหรือการกระทำอื่น ๆ เช่นนี้เรียกว่าแผลที่กระทบกระเทือนจิตใจ แผลในปากที่เกิดขึ้นอีกในเด็กอาจเป็นผลมาจากการติดเชื้อไวรัสหรือแบคทีเรีย แผลเหล่านี้เกิดจากสิ่งมีชีวิตหลายชนิดรวมถึงไวรัสคอกซากีและไวรัสเริม ในกรณีที่แผลในปากของเด็กเกิดจากการติดเชื้อในช่องปากขอแนะนำให้ทำการรักษาทันทีเพื่อป้องกันภาวะแทรกซ้อนที่อาจเกิดขึ้น
เด็ก ๆ มักจะประสบกับแผลที่เจ็บปวดเพียงเพราะพวกเขาไม่คุ้นเคยกับการดูแลปากอย่างเหมาะสม เป็นเรื่องปกติที่เด็กเล็กจะบาดเจ็บเหงือกหรือแก้มเนื่องจากการแปรงฟันแรงเกินไป ในทำนองเดียวกันเด็ก ๆ อาจกัดลิ้นแก้มและริมฝีปากของพวกเขาโดยบังเอิญเมื่อเคี้ยวหรือพูดคุยหรือแม้กระทั่งในระหว่างเล่นที่ขรุขระ ความเสียหายบางครั้งสามารถพัฒนาเป็นแผลเปิดที่ทำให้รู้สึกไม่สบาย โชคดีที่แผลในปากที่กระทบกระเทือนจิตใจในเด็กลดความถี่ลงเมื่อเด็กอายุมากขึ้นและควบคุมมอเตอร์ได้ดีขึ้นรอบ ๆ ปาก
ในทางกลับกันแผลในปากของเด็กมักเป็นผลมาจากการติดเชื้อในช่องปาก ยกตัวอย่างเช่นคราบแบคทีเรียที่สะสมอาจทำให้เกิดโรคเหงือกอักเสบและทำให้เกิดแผลในเหงือก การติดเชื้อไวรัส Coxsackie สามารถทำให้เกิดรอยโรคสีแดงเล็ก ๆ ในปากมือและพื้นที่ติดเชื้ออื่น ๆ ; เงื่อนไขนี้เป็นที่รู้จักกันทั่วไปว่าเป็นโรคมือเท้าปาก ในกรณีที่หายากแผลในปากในเด็กเป็นผลมาจากการติดเชื้อโดยไวรัสเริม การขาดวิตามินและภาวะที่ทำให้ระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอลงทำให้เด็กเสี่ยงต่อการติดเชื้อ
แผลในปากที่เกิดจากการติดเชื้อมักได้รับการรักษาโดยการใช้ยาร่วมกับมาตรการป้องกัน แม้ว่าโดยทั่วไปยารักษาแผลในปากจะเพียงพอในการกำจัดอาการ แต่รอยโรคสามารถกลับมาได้หากเด็กไม่ได้รับการสอนวิธีหลีกเลี่ยงการติดเชื้อ เคล็ดลับความสะอาดทั่วไปเช่นหลีกเลี่ยงการเอามือเข้าไปในปากหลังจากสัมผัสวัตถุสกปรกเป็นสิ่งสำคัญเช่นเดียวกับการรักษาที่แท้จริง นอกจากนี้ยังเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องรักษาทันทีหากสาเหตุของแผลที่ปากในเด็กเป็นเงื่อนไขที่รุนแรงมากขึ้นเช่นการติดเชื้อเริมหรือระบบภูมิคุ้มกันอ่อนแอลงอย่างรุนแรง หากไม่มีการตรวจสอบการติดเชื้อเหล่านี้สามารถแพร่กระจายไปทางปากและนำไปสู่ภาวะแทรกซ้อนทางการแพทย์ที่มีผลกระทบตลอดชีวิตสำหรับเด็ก
