การอักเสบของต่อมทอนซิลอาจเกิดจากหลายปัจจัย การติดเชื้อแบคทีเรียหรือไวรัสมักทำให้เกิดต่อมทอนซิลอักเสบซึ่งอาจต้องได้รับการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะหรือไวรัส มีปัจจัยอื่น ๆ ที่อาจทำให้ต่อมทอนซิลบวมเช่นกันรวมถึงการแพ้ตามฤดูกาลและไซนัสอักเสบ การระคายเคืองจากอาหารบางประเภทอาจทำให้ต่อมทอนซิลบวมและอักเสบรวมถึงการสัมผัสกับสารที่ระคายเคืองเช่นควันบุหรี่ เนื้องอกในลำคออาจทำให้ต่อมทอนซิลอักเสบมากขึ้น
ต่อมทอนซิลอักเสบซึ่งเป็นอาการที่ทำให้เกิดอาการบวมบวมและการอักเสบของต่อมทอนซิลมักเกิดขึ้นในเด็กวัยเรียน บุคคลบางคนจำเป็นต้องมีการผ่าตัดต่อมทอนซิลเพื่อป้องกันการกำเริบของต่อมทอนซิลอักเสบ โรคหวัดและไข้หวัดใหญ่เป็นสาเหตุของทอนซิลอักเสบซึ่งอาจหายได้โดยไม่ต้องได้รับการรักษา เมื่อต่อมทอนซิลติดเชื้อจากแบคทีเรียอย่างไรก็ตามการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะอาจจำเป็น การติดเชื้อไวรัสและแบคทีเรียชนิดต่าง ๆ ที่ทำให้เกิดการอักเสบต่อมทอนซิลรวมถึง mononucleosis และ strep คอหอย
โรคภูมิแพ้ตามฤดูกาลยังสามารถทำให้เกิดการอักเสบต่อมทอนซิลในบางคน การแพ้ ragweed เรณูหรือฝุ่นละอองมักทำให้เกิดอาการคัดจมูกและไซนัสและบางครั้งอาการคันคอและต่อมทอนซิลอักเสบ นอกจากนี้ไซนัสอักเสบอาจทำให้ต่อมทอนซิลอักเสบ ในกรณีเช่นนี้แพทย์อาจสั่งยาแก้แพ้เพื่อลดไซนัสและต่อมทอนซิลอักเสบ
แม้ว่าจะไม่ธรรมดามีอาหารบางอย่างที่อาจทำให้เกิดอาการเจ็บคอและต่อมทอนซิลอักเสบ เมล็ดและเยื่อกระดาษจากอาหารอาจติดอยู่ในซอกของเนื้อเยื่อต่อมทอนซิล หากเศษอาหารยังค้างอยู่ในเนื้อเยื่อต่อมทอนซิลอาจเกิดการอักเสบ วิธีที่ดีที่สุดในการป้องกันปัญหานี้คือการบ้วนปากด้วยน้ำเกลืออุ่น ๆ ซึ่งอาจช่วยขับไล่อนุภาคอาหารขนาดเล็กเช่นเมล็ด หรือมิฉะนั้นการใช้น้ำยาบ้วนปากฆ่าเชื้ออาจป้องกันไม่ให้อนุภาคอาหารติดอยู่ที่ต่อมทอนซิล
สาเหตุที่พบบ่อยอีกอย่างหนึ่งของการอักเสบที่คอและต่อมทอนซิลคือการสัมผัสกับมลภาวะหรือการสูดดมสารเคมี คนงานในโรงงานเคมีมักสูดดมสารที่ก่อให้เกิดอาการเจ็บคอและต่อมทอนซิลอักเสบและเมื่อเวลาผ่านไปสิ่งนี้อาจนำไปสู่ภาวะแทรกซ้อนสุขภาพอื่น ๆ ในทำนองเดียวกันบุคคลที่สัมผัสกับสิ่งระคายเคืองเช่นควันบุหรี่อาจประสบกับการอักเสบของต่อมทอนซิล
หนึ่งในสาเหตุที่ร้ายแรงที่สุดของต่อมทอนซิลอักเสบคือเนื้องอกในลำคอ ในระยะแรกมะเร็งในลำคออาจทำให้เกิดอาการปวดอย่างรุนแรงไอลำบากในการกลืนและต่อมทอนซิลอักเสบ แม้ว่ามะเร็งกล่องเสียงจะพบได้บ่อย แต่มะเร็งของต่อมทอนซิลก็อาจทำให้เกิดอาการบวมอักเสบและปวดอย่างรุนแรง การตัดชิ้นเนื้อของเนื้อเยื่อลำคออาจเป็นตัวกำหนดว่าเป็นมะเร็งหรือไม่และการรักษาอาจรวมถึงการรักษาด้วยรังสีหรือการผ่าตัด
