DNA ของตัวอสุจินั้นมีสารพันธุกรรมครึ่งหนึ่งสำหรับทารกถ้าตัวอสุจินั้นสามารถปฏิสนธิกับไข่ได้ DNA ที่เสียหายอาจเป็นสาเหตุของภาวะมีบุตรยากและปัญหาของทารกในครรภ์ อาจมีสาเหตุด้านสิ่งแวดล้อมของความเสียหายต่อ DNA สเปิร์มเช่นยาเคมีบำบัดหรือการใช้บุหรี่ การติดเชื้อความไม่สมดุลของฮอร์โมนและอายุที่เพิ่มขึ้นอาจส่งผลเสียต่อคุณภาพดีเอ็นเอของอสุจิ
ผู้ชายที่มีสุขภาพดีอุดมสมบูรณ์สามารถผลิตสเปิร์มในปริมาณเล็กน้อยด้วยความเสียหายทางพันธุกรรมพร้อมกับสเปิร์มปกติ เมื่อสเปิร์มส่วนใหญ่หรือทั้งหมดมีปัญหาทางพันธุกรรมปัญหาความอุดมสมบูรณ์ก็จะเกิดขึ้น สเปิร์มเหล่านี้อาจไม่สามารถปฏิสนธิไข่อย่างถูกต้องเลย บางครั้งสเปิร์มที่ปฏิสนธิกับไข่สามารถสร้างตัวอ่อนที่เสียหายได้ การตั้งครรภ์อาจแท้งบุตรหรือหากผู้หญิงอุ้มเด็กทารกไปสู่ระยะทารกอาจมีปัญหาทางการแพทย์ที่เกิดจากปัญหาดีเอ็นเอของอสุจิ
ปัญหาความอุดมสมบูรณ์ของเพศชายอาจเกิดขึ้นจากความเสียหายของ DNA สเปิร์มจากสาเหตุด้านสิ่งแวดล้อม ยกตัวอย่างเช่นผู้ชายสูบบุหรี่เขามีแนวโน้มที่จะพัฒนาปัญหาทางพันธุกรรมในสเปิร์มของเขามากกว่าถ้าเขาเป็นคนที่ไม่สูบบุหรี่ มลพิษในอากาศอาจส่งผลให้เกิดความเสียหายต่อ DNA ของอสุจิเช่นเดียวกับสารกำจัดศัตรูพืชบางชนิด
ยาที่เป็นเป้าหมายของเซลล์มะเร็งทำให้ผู้ชายมีความเสี่ยงสูงต่อความเสียหายทางพันธุกรรม สเปิร์มมีความไวต่อยาเคมีบำบัดมากกว่าเซลล์อื่น ๆ ในร่างกายเนื่องจากมีการแพร่กระจายชนิดเดียวกับเซลล์มะเร็ง การฉายรังสีเป็นการรักษาทางการแพทย์อีกวิธีหนึ่งที่สามารถกลายพันธุ์ DNA ในเซลล์สเปิร์ม ความเสียหายของอสุจิจากการรักษาเหล่านี้สามารถอยู่ได้นานหากเซลล์ในอัณฑะที่ผลิตสเปิร์มได้รับการกลายพันธุ์
อายุก็มีผลต่อคุณภาพของอสุจิด้วยเช่นกัน โดยปกติแล้วผู้ชายที่มีสุขภาพดีอัณฑะจะทำลายสเปิร์มที่แสดงความเสียหายของดีเอ็นเอ กระบวนการควบคุมคุณภาพมักจะมีประสิทธิภาพน้อยลงเมื่อคนแก่ขึ้น ถ้าผู้ชายมีระดับฮอร์โมนผิดปกติเช่นฮอร์โมนเทสโทสเทอโรนก็สามารถลดคุณภาพของอสุจิ DNA ได้
การติดเชื้อยังสามารถผลิตสเปิร์มที่มีความเสียหายของดีเอ็นเอ บางครั้งการติดเชื้อจะทำให้ระบบสืบพันธุ์ขยายตัวและทำให้อสุจิมีปฏิกิริยากับออกซิเจนมากขึ้น (ROS) ซึ่งเป็นโมเลกุลที่มีปฏิกิริยาโต้ตอบสูงซึ่งอาจส่งผลเสียต่อ DNA ROS เหล่านี้มีจำนวนมากในผู้ชายที่มีการขยายหลอดเลือดดำในถุงอัณฑะซึ่งเป็นเงื่อนไขที่เรียกว่า varicocele
สเปิร์มต้องการสภาพแวดล้อมที่เย็นสบายเมื่อเทียบกับส่วนอื่น ๆ ของร่างกาย นี่คือสาเหตุที่ลูกอัณฑะอยู่นอกร่างกาย เมื่อชายคนหนึ่งทนทุกข์ทรมานจากความเจ็บป่วยที่ก่อให้เกิดไข้สูงตัวอสุจิของเขาอาจเสียหายได้ นอกจากนี้เขายังสามารถส่งผลเสียต่อคุณภาพของตัวอสุจิถ้าเขาอาบน้ำร้อนขับรถมากหรือทำสิ่งอื่นใดที่ทำให้ลูกอัณฑะของเขาร้อนขึ้นเช่นถือแล็ปท็อปบนตักของเขา
