โดยปกติแล้วผู้หญิงจะพบการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญในระดับของฮอร์โมนในระหว่างมีประจำเดือน ในเวลานี้ผู้หญิงมักจะมีระดับฮอร์โมนเอสโตรเจนลดลงซึ่งเป็นฮอร์โมนเพศหลักสำหรับเพศหญิงและฮอร์โมนโปรเจสเตอโรนซึ่งเป็นฮอร์โมนที่มีความสำคัญต่อการมีประจำเดือนและการตั้งครรภ์ ในระหว่างมีประจำเดือนจะมีการสร้างฮอร์โมนปล่อย gonadotropin ซึ่งจะกระตุ้นการหลั่งฮอร์โมนกระตุ้นรูขุมขน การเปิดตัวของฮอร์โมนนี้ทำหน้าที่ในรังไข่ของผู้หญิงเพื่อเริ่มกระบวนการผลิตไข่ที่อาจปฏิสนธิหลังจากการตกไข่
ฮอร์โมนเอสโตรเจนและโปรเจสเตอโรนมีอยู่ในระดับที่แตกต่างกันในระหว่างรอบประจำเดือนของผู้หญิง พวกเขามักจะอยู่ในระดับต่ำสุดเมื่อผู้หญิงมีประจำเดือนอย่างไรก็ตาม นี่คือสาเหตุที่สโตรเจนและฮอร์โมนมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของเยื่อบุมดลูกที่หลั่งในระหว่างมีประจำเดือน การลดลงของระดับของฮอร์โมนเหล่านี้ช่วยอำนวยความสะดวกในการเริ่มมีประจำเดือน
ฮอร์โมนอื่นที่ทำงานในระหว่างมีประจำเดือนก็คือฮอร์โมนปล่อยโกนาโดโทรปิน ฮอร์โมนนี้ผลิตขึ้นจากการกระตุ้นของต่อมใต้สมองซึ่งตั้งอยู่ในส่วนของสมองของคนที่ไม่เพียงควบคุมพฤติกรรมของเธอ แต่ยังรวมถึงอารมณ์ของเธอด้วย ต่อมนี้ยังผลิตและเผยแพร่ฮอร์โมนต่าง ๆ ที่มีผลต่อต่อมใต้สมองซึ่งตั้งอยู่ที่ด้านล่างของสมองมนุษย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งต่อมใต้สมองหลั่งฮอร์โมน gonadotropin ที่ปล่อยออกมาในช่วงมีประจำเดือนซึ่งทำให้ต่อมใต้สมองหลั่งฮอร์โมนในระหว่างมีประจำเดือน
ต่อมใต้สมองปล่อยฮอร์โมนกระตุ้นรูขุมขนในระหว่างมีประจำเดือน ฮอร์โมนนี้เริ่มต้นในระยะที่ไข่ของผู้หญิงรูขุมขนโต ในที่สุดฮอร์โมนนี้ยังช่วยกระตุ้นการเพิ่มขึ้นของระดับฮอร์โมนหญิงที่นำไปสู่การหลั่งฮอร์โมน luteinizing ในภายหลังในรอบของผู้หญิง การหลั่งฮอร์โมน luteinizing นี้มักจะเกิดขึ้นหลายวันหลังจากการมีประจำเดือนสิ้นสุดลงและกระตุ้นการระเบิดของไข่จากรูขุมขน เหตุการณ์นี้เรียกว่าการตกไข่
บ่อยครั้งที่การเปลี่ยนแปลงของฮอร์โมนในระหว่างมีประจำเดือนเป็นช่วงเวลาแห่งการเปลี่ยนแปลงทางอารมณ์เช่นกัน ในฐานะที่เป็นระดับฮอร์โมนหญิงและฮอร์โมนลดลงนำไปสู่การมีประจำเดือนผู้หญิงหลายคนประสบอาการ premenstrual ซึ่งถูกทำเครื่องหมายด้วยอารมณ์แปรปรวนอ่อนเพลียเมื่อยล้าการเปลี่ยนแปลงในความอยากอาหารและความใคร่และท้องอืด อย่างไรก็ตามเมื่อประจำเดือนมาถึงผู้หญิงหลายคนรู้สึกดีขึ้นกว่าช่วงก่อนมีประจำเดือน บ่อยครั้งที่ผู้หญิงรู้สึกสงบในช่วงนี้และมีความผันผวนทางอารมณ์น้อยลง ความรู้สึกสงบนี้อาจเป็นผลมาจากระดับฮอร์โมนเอสโตรเจนและฮอร์โมนโปรเจสเตอโรน
