ระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกไม่สามารถทำงานได้อย่างที่ควรจะเป็นเพราะส่วนประกอบนั้นอ่อนแอหรือขาดหายไป ผู้ป่วยอาจพัฒนาภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องตามที่เป็นที่รู้จักซึ่งเป็นผลมาจากการรักษาทางการแพทย์โรคพื้นฐานหรือเงื่อนไขที่มีมา แต่กำเนิด ตราบใดที่ระบบภูมิคุ้มกันไม่สามารถใช้งานได้อย่างสมบูรณ์ผู้ป่วยก็มีความเสี่ยงที่จะติดเชื้อเพิ่มขึ้นและไม่สามารถต่อสู้กับพวกมันได้ การรักษาพร้อมที่จะแก้ไขข้อกังวลเหล่านี้ไม่ว่าจะเป็นภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องชั่วคราวหรือถาวร
ผู้ป่วยบางรายมีภูมิคุ้มกันบกพร่อง แต่กำเนิดซึ่งหมายความว่าระบบภูมิคุ้มกันของพวกเขาทำงานไม่ถูกต้องเพราะร่างกายไม่สามารถสร้างเซลล์บางเซลล์หรือควบคุมการทำงานของระบบภูมิคุ้มกัน ในกรณีอื่น ๆ ระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกเป็นเงื่อนไขที่ได้มาซึ่งเกิดจากการสัมผัสกับสารพิษการติดเชื้อเช่นไวรัสเอชไอวี (HIV) หรือยาบางชนิด ยาบางชนิดอาจระงับการทำงานของระบบภูมิคุ้มกันในฐานะที่เป็นผลข้างเคียงที่เห็นด้วยยารักษามะเร็งและสเตียรอยด์ ประโยชน์ของการรักษามีมากกว่าความเสี่ยง แต่ผู้ป่วยจำเป็นต้องได้รับการตรวจสอบตลอดการรักษา
การรักษาทางการแพทย์บางอย่างอาจเรียกร้องให้มีการเหนี่ยวนำโดยเจตนาของระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุก ตัวอย่างเช่นผู้ป่วยที่เตรียมการปลูกถ่ายจำเป็นต้องระงับระบบภูมิคุ้มกันของพวกเขาเพื่อที่พวกเขาจะไม่ปฏิเสธการปลูกถ่าย พวกเขายังต้องใช้ยาภูมิคุ้มกันเพื่อชีวิตเพื่อป้องกันการโจมตีของการปฏิเสธ ภาวะชั่วคราวของการประนีประนอมอย่างรุนแรงอาจเกิดขึ้นก่อนการปลูกถ่ายไขกระดูกซึ่งไขกระดูกผู้บริจาคจะเข้ามาแทนที่การทำงานของภูมิคุ้มกันในที่สุด
สิ่งมีชีวิตที่ติดเชื้อมีแนวโน้มที่จะจับไว้ในผู้ป่วยที่มีระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกรวมถึงสิ่งมีชีวิตที่หายากซึ่งมักจะไม่ทำให้เกิดโรคในบุคคลที่มีสุขภาพดี ร่างกายขาดการป้องกันเพื่อระบุและทำลายเชื้อแบคทีเรียไวรัสและสาเหตุอื่น ๆ ของการเกิดโรค นอกจากนี้เมื่อมีการติดเชื้อเกิดขึ้นร่างกายจะสามารถยับยั้งได้น้อยลง ซึ่งหมายความว่าหวัดหรือไข้หวัดใหญ่“ ธรรมดา” อาจรุนแรงเนื่องจากร่างกายของผู้ป่วยไม่ได้ปรับตัวเหมือนกับคนที่มีสุขภาพ
ผู้ป่วยอาจต้องแยกตัวเมื่อระบบภูมิคุ้มกันของพวกเขาต่ำโดยเฉพาะ สิ่งนี้อาจเกิดขึ้นในโรงพยาบาลหรือสภาพแวดล้อมในบ้านที่ปลอดภัย คนอื่น ๆ อาจได้รับการแนะนำให้ระวังเกี่ยวกับแหล่งที่มาของการได้รับสัมผัสเช่นเด็กเล็กที่อาจมีเชื้อไวรัสจากห้องเรียนหรืออาหารที่รู้จักกันว่ามีเชื้อติดเชื้อ ยาอาจปรับปรุงระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกในบางกรณี แต่พวกเขาอาจต้องมีความสมดุลกับปัญหาสุขภาพอื่น ๆ ที่สามารถสร้างข้อห้ามซึ่งการใช้ยาจะไม่ปลอดภัย
