ในทางการแพทย์วัคซีนคอนจูเกตหรือคอนจูเกตวัคซีนเป็นวัคซีนชนิดหนึ่งที่ถูกสร้างขึ้นโดยการรวมแอนติเจนเข้ากับโมเลกุลโปรตีน โดยทั่วไปแล้ววัคซีน Conjugated จะใช้ฉีดวัคซีนให้กับทารกและเด็กจากการติดเชื้อแบคทีเรียบางชนิด ระบบภูมิคุ้มกันที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะของคนหนุ่มสาวมักจะมีปัญหาในการจดจำแอนติเจนบางตัวดังนั้นวัคซีนทั่วไปอาจไม่ได้ผลสำหรับโรคบางชนิด ส่วนโปรตีนของวัคซีนคอนจูเกตทำหน้าที่เป็นพาหะสำหรับแอนติเจนและทำหน้าที่ขยายการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันให้กับมัน ด้วยวิธีนี้วัคซีนผันอาจประสบความสำเร็จมากขึ้นในการสร้างภูมิคุ้มกันให้กับทารกและเด็กกับแบคทีเรียบางชนิด
ประเภทของแบคทีเรียที่ผันวัคซีนได้รับการออกแบบมาเพื่อฉีดวัคซีนให้กับเด็กมีแนวโน้มที่จะเป็นแบคทีเรียที่มีแคปซูลโพลีแซคคาไรด์ ในแบคทีเรียเหล่านี้ชั้นของน้ำมูกที่สร้างจากโมเลกุลโพลีแซคคาไรด์ปกป้องแอนติเจนบนพื้นผิวของเซลล์แบคทีเรีย สิ่งนี้ทำให้เซลล์ภูมิคุ้มกันของมนุษย์หรือเซลล์เม็ดเลือดขาวยากขึ้นในการจดจำแบคทีเรียและติดการโจมตีทางภูมิคุ้มกัน วัคซีนคอนจูเกตจึงมักจะประกอบด้วยแอนติเจน polysaccharide รวมกับโปรตีนพาหะ การรวมกันของแอนติเจนกับโปรตีนสร้างสารที่จดจำได้ง่ายกว่าเซลล์เม็ดเลือดขาวในเลือดมนุษย์ส่งผลให้การตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันแข็งแรงขึ้น
วัคซีนสำคัญสองตัวในการดูแลเด็กคือวัคซีนโรคปอดบวม (PCV) และวัคซีนโรคเยื่อหุ้มสมองอักเสบ (MCV) PCV มีการใช้เป็นประจำในหลายประเทศเพื่อป้องกันเยื่อหุ้มสมองอักเสบจากเชื้อแบคทีเรียโรคปอดอักเสบและการติดเชื้อที่เกี่ยวข้องในเด็ก วัคซีนนี้ไม่ได้ป้องกันเด็กที่ได้รับวัคซีนจากโรคปอดบวมทั้งหมด มีแบคทีเรียนิวโมคอคคัสมากกว่า 90 ชนิดที่แตกต่างกันและวัคซีนป้องกันโรคปอดบวมที่มีเพียงเจ็ดชนิดเท่านั้น อย่างไรก็ตามแบคทีเรียทั้งเจ็ดชนิดนี้ก่อให้เกิดโรคปอดอักเสบอย่างรุนแรงและวัคซีนสามารถป้องกันการติดเชื้อส่วนใหญ่ได้
วัคซีนคอนจูเคต conjugate meningococcal ถูกออกแบบมาเพื่อปกป้องเด็กจากความเครียดที่แตกต่างกันของเยื่อหุ้มสมองอักเสบซึ่งเกิดจากแบคทีเรียที่เรียกว่า meningococcus มันทำงานในลักษณะเดียวกันกับ PCV และใช้ในการสร้างภูมิคุ้มกันทั้งเด็กเล็กและวัยรุ่นที่มีอายุไม่เกิน 18 ปี โดยทั่วไปแล้ววัคซีนนี้จะให้กับเด็กและผู้ใหญ่ที่เคยสัมผัสเชื้อแบคทีเรียชนิดไข้กาฬนกนางแอ่นเช่นหากมีอุบัติการณ์ของโรคเยื่อหุ้มสมองอักเสบเกิดขึ้นในโรงเรียนหรือวิทยาลัย
