คำว่า "ระยะเวลาแฝง" สามารถอ้างถึงสองสิ่งที่แตกต่างกันในโลกการแพทย์ ในแง่แรกระยะเวลาแฝงคือระยะเวลาที่บางคนติดเชื้อ แต่ไม่มีอาการที่สังเกตได้ ระยะนี้เรียกอีกอย่างหนึ่งว่าระยะฟักตัวซึ่งสะท้อนความคิดที่ว่าโรคนี้กำลังฟักตัวในร่างกาย นักจิตวิเคราะห์ยังใช้คำว่า "ระยะเวลาแฝง" หากพวกเขาสมัครใช้วิธีการของฟรอยด์โดยใช้คำนี้เพื่ออ้างถึงขั้นตอนเฉพาะในการพัฒนาเด็ก
ในแง่แรกระยะเวลาแฝงของโรคเป็นหัวข้อที่น่าสนใจอย่างมากในหมู่นักระบาดวิทยาและนักวิจัยทางการแพทย์ เมื่อใครบางคนติดเชื้อโรคเขาหรือเธอสามารถผ่านโรคต่อไปได้แม้ว่าจะไม่มีอาการใด ๆ และระยะเวลาแฝงมักจะเป็นหน้าต่างแห่งโอกาสสำหรับโรคที่จะแพร่กระจายตัวเองไปทั่วโดยไม่ต้องรับรู้จากโฮสต์ ระยะเวลาแฝงมีแนวโน้มที่จะนานกว่าผู้ใหญ่ในเด็กหรือคนที่มีระบบภูมิคุ้มกันที่ถูกบุกรุกสะท้อนให้เห็นถึงการต่อสู้ของร่างกายกับผู้บุกรุกซึ่งช้าลงลักษณะของอาการ
ระยะเวลาแฝงอาจมีความยาวผันแปรได้ การติดเชื้อบางอย่างนำเสนอตัวเองภายในไม่กี่ชั่วโมงหรือวัน ตัวอย่างเช่นคนที่บริโภคสารพิษที่ก่อให้เกิดโรคมักจะพบกับระยะเวลาแฝงที่สั้นมากระหว่างการรับสารพิษและการปรากฏตัวของอาการ ในอีกกรณีหนึ่งโรคอาจจะหยุดนิ่งเป็นเวลาหลายเดือนในหลายปีที่ผ่านมาหลังจากมีการหดตัวเป็นเวลาหลายปี โรค Creutzfeldt-Jakob (CJD) เป็นตัวอย่างของโรคที่มีระยะเวลาแฝงนานมากถึง 30 ปีในบางกรณี
ในช่วงระยะฟักตัวโฮสต์สามารถแพร่เชื้อได้โดยไม่เจตนาเพราะพวกเขาไม่ทราบว่าพวกเขาถือเชื้ออยู่ ในโรคที่มีระยะเวลาแฝงที่ยืดเยื้อนี่อาจหมายความว่าโฮสต์แพร่เชื้อไปยังคนอื่น ๆ จำนวนมากที่ไม่สามารถติดตามการติดต่อกับโฮสต์เพื่อกำหนดว่าพวกเขามีโรคอยู่ที่ไหน นี่เป็นปัญหาที่พบบ่อยในผู้ติดเชื้อเอชไอวีในปี 1980 เมื่อผู้ติดเชื้อแพร่เชื้อไปยังผู้ติดต่อทางเพศสัมพันธ์และผู้รับผลิตภัณฑ์เลือดโดยไม่รู้ตัวว่าป่วย
ในความหมายของฟรอยด์ช่วงเวลาแฝงอยู่ระหว่างอายุห้าหรือหกและวัยรุ่นตอนต้น มันเป็นครั้งที่สี่ของห้าขั้นตอนของการพัฒนาโดดเด่นด้วยการเกิดขึ้นของความต้องการทางเพศซึ่งจะระเหยหรือปราบปราม ตามทฤษฎีจิตวิเคราะห์คนในช่วงเวลาแฝงของพวกเขามีแนวโน้มที่จะแสวงหา บริษัท ของคนเพศเดียวกันและพวกเขาอาจพัฒนาจำนวนอารมณ์เกี่ยวกับกิจกรรมทางเพศเพื่อตอบสนองจิตใต้สำนึกและวัฒนธรรมและสังคม


