เรียกอีกอย่างว่าจังหวะ circadian, นาฬิกาภายใน เป็นคำที่ใช้เพื่ออธิบายวงจรประมาณยี่สิบสี่ชั่วโมงที่มีอยู่ในหน่วยงานที่มีชีวิตมากที่สุด พร้อมด้วยมนุษย์พืชสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมอื่น ๆ และสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ มีนาฬิกาภายใน เช่นเดียวกับนาฬิกาที่ใช้บอกเวลารอบวัฏจักร circadian ของแต่ละคนมีค่าคงที่มากหรือน้อยและถูกกำหนดโดยฟังก์ชันทางชีววิทยาภายในและสิ่งเร้าภายนอกที่ส่งผลให้เกิดรูปแบบพฤติกรรมที่ปรับเปลี่ยนนาฬิกาในระดับหนึ่ง
ไม่สามารถประเมินความสำคัญของนาฬิกาภายในได้ เมื่อนาฬิกาสอดคล้องกับรูปแบบวันต่อวันของงานที่จำเป็นในการรักษาชีวิตเกิดขึ้นในตารางปกติมากขึ้นหรือน้อยลง ตัวอย่างเช่นบุคคลนั้นจะง่วงนอนในเวลาเดียวกันในแต่ละคืนและยังมีแนวโน้มที่จะตื่นตามธรรมชาติในเวลาเดียวกันในตอนเช้า ความอยากอาหารอาจเกิดขึ้นในเวลาเดียวกันในแต่ละวัน การรวมกันของการเขียนโปรแกรมภายในและการกระตุ้นภายนอกทำให้นาฬิกาทำงานได้อย่างต่อเนื่องและช่วยให้มั่นใจว่าบุคคลนั้นยังคงมีสุขภาพดี
อย่างไรก็ตามปัจจัยภายนอกยังสามารถทำให้นาฬิกาภายในปรับเปลี่ยนได้ ตัวอย่างเช่นคนที่ทำงานตอนกลางคืนมักจะพบกับความยากลำบากในตอนแรกเมื่อมันได้รับการพักผ่อนเพียงพอ สมมติว่านาฬิกาภายในของแต่ละบุคคลถูกตั้งค่าให้นอนหลับเมื่อมันมืดและสูงขึ้นเมื่อถึงเวลาเช้าจำเป็นต้องมีการปรับระยะเวลาก่อนที่จะเข้านอนในระหว่างวัน การสร้างสภาพแวดล้อมกึ่งมืดซึ่งบางครั้งความพยายามในการนอนหลับบางครั้งสามารถช่วยให้กระบวนการปรับเปลี่ยนนี้เกิดขึ้นได้ การดำเนินการนี้ทำให้การสร้างวงจรการนอนหลับใหม่ทำได้ง่ายขึ้นและทำให้หลับสนิทระหว่างวัน
อีกตัวอย่างของการดัดแปลงนาฬิกาภายในคือการเดินทาง เมื่อบุคคลย้ายจากเขตเวลาหนึ่งไปอีกโซนหนึ่งจังหวะตามธรรมชาติอาจถูกโยนออกจากความสมดุล ผลที่ได้คือสิ่งที่เป็นที่รู้จักกันโดยทั่วไปว่า jet lag สถานการณ์ที่แต่ละคนรู้สึกเหนื่อยล้าและอาจมีอาการนอนไม่หลับจนกว่าร่างกายจะปรับตัวเข้ากับเขตเวลาใหม่
การประเมินสถานะปัจจุบันของนาฬิกาภายในมักจะเกี่ยวข้องกับการตรวจสอบอุณหภูมิของร่างกายเช่นเดียวกับระดับของเมลาโทนินที่ผลิตโดยต่อมไพเนียล การสังเกตการเปลี่ยนแปลงของปัจจัยทั้งสองนี้ในช่วงเวลายี่สิบสี่ชั่วโมงสามารถทำให้ง่ายต่อการระบุรูปแบบปัจจุบันที่สัมพันธ์กับจังหวะตามธรรมชาติของร่างกายและเปรียบเทียบกับกิจวัตรประจำวันของแต่ละบุคคล โดยการทำวิจัยประเภทนี้มันเป็นไปได้ที่จะตัดสินว่าบุคคลนั้นปรับตัวเข้ากับการเปลี่ยนแปลงในเวลาสถานที่และสถานการณ์และยังให้คำใบ้ว่าจะช่วยในการปรับตัวอย่างไร
