Ubiquitination Assay คืออะไร?

Ubiquitination หมายถึงการจับของ ubiquitin โปรตีนกับโปรตีนอื่น ๆ โดยเอนไซม์สามชนิดที่แตกต่างกัน การทดสอบการ ubiquitination เป็นการทดสอบที่กำหนดว่ากระบวนการนี้เกิดขึ้นภายในเซลล์มากน้อยเพียงใด การทดสอบสามารถนำมาใช้เพื่อกำหนดว่าเงื่อนไขที่แตกต่างกันมีผลต่อการจับโปรตีนขั้นตอนและโครงสร้างที่สำคัญในเส้นทางการแพร่เชื้อและปริมาณโปรตีนในเซลล์อย่างไร ปริมาณที่ไม่เพียงพอหรือมากเกินไปนั้นเชื่อมโยงกับการพัฒนาของโรคต่างๆ

โปรตีนที่พบในเซลล์หน้าที่ของ ubiquitin คือการจับกับโปรตีนในขณะที่ทำงานเป็น "แท็ก" หรือส่งสัญญาณไปยังโครงสร้างอื่น ๆ "แท็ก" นี้จะส่งสัญญาณให้เอนไซม์รู้ว่าโปรตีนสามารถถูกทำลายนำกลับมาใช้ใหม่หรือเคลื่อนย้ายได้ ผลที่ได้คือการทำลายหรือการขนส่งของโปรตีน

โปรตีนที่ติดแท็กเหล่านี้มีความสำคัญต่อการซ่อมแซม DNA การติดเชื้อไวรัสและการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน ฟังก์ชั่นที่สำคัญอื่น ๆ รวมถึงบทบาทในการตายของเซลล์การแบ่งเซลล์และการพัฒนาเซลล์ ubiquitin มากเกินไปหรือขาดมันอาจมีบทบาทในการก่อตัวของโรคต่างๆเช่นโรคมะเร็งโรคทางพันธุกรรมและโรคของระบบภูมิคุ้มกัน

นักวิจัยจะใช้วิธีการตรวจวิเคราะห์ ubiquitination เพื่อตรวจสอบว่าเงื่อนไขใดเปลี่ยนแปลงความเข้มข้นของโปรตีนในเซลล์และเปรียบเทียบเซลล์ที่เป็นโรคกับเซลล์ที่มีสุขภาพ นักวิทยาศาสตร์ยังใช้มันเพื่อตรวจสอบเงื่อนไขที่จะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงในการผูก นอกจากนี้พวกเขาอาจพยายามเชื่อมโยงรหัสดีเอ็นเอเฉพาะกับปริมาณของเอนไซม์ในเซลล์

มีการทดสอบการแพร่หลายมากกว่าหนึ่งประเภทที่นักวิทยาศาสตร์การวิจัยใช้เป็นพิเศษ หนึ่งจะกำหนดเปอร์เซ็นต์ของโปรตีนที่ถูกผูกไว้กับ ubiquintin อีกคนหนึ่งตรวจสอบกิจกรรมของเอนไซม์หรือการปรากฏตัวของตัวกลางอื่น ๆ ที่พบในเส้นทางการแพร่เชื้อ ชุดตรวจที่แตกต่างกันได้รับการพัฒนาขึ้นอยู่กับโปรตีนเป้าหมายที่ ubiquitin จะจับกับ

พื้นฐานของการทดสอบการแพร่หลายคือการรวมสารประกอบที่มีข้อความกำกับด้วยสารเคมีอื่นที่วัดได้ง่าย ในการทดสอบด้านเนื้องอกวิทยา ubiquitin สามารถติดฉลากด้วย cryptate ซึ่งเป็นสารประกอบที่มีไนโตรเจนสองอะตอม สิ่งนี้สามารถนำมาใช้เพื่อตรวจสอบว่าเอนไซม์ใดที่ใช้งานได้มากที่สุดในเซลล์

การทดสอบการแพร่หลายจะมีสองขั้นตอน ขั้นแรกคือขั้นตอนของเอนไซม์โดยที่เอนไซม์จะจับ ubiquitin ที่มีป้ายกำกับไว้กับโปรตีนเป้าหมาย ขั้นตอนที่สองคือขั้นตอนการตรวจจับที่การตรวจจับโปรตีนเป้าหมายโดยใช้คอนจูเกตเช่นแอนติบอดี้ แอนติบอดีจะเรืองแสงหรือเปลี่ยนสีซึ่งจะช่วยให้นักวิจัยเพื่อตรวจสอบกิจกรรมของเอนไซม์