แบคทีเรียในลำไส้เป็นแบคทีเรียในตระกูล Enterobacteriaceae แบคทีเรียเหล่านี้อาศัยอยู่ตามปกติในความกล้าของสัตว์หลายชนิดรวมถึงมนุษย์และบางชนิดเป็นเชื้อโรคทำให้เกิดโรคในสัตว์บางชนิด หลายกรณีของอาหารเป็นพิษเกิดจากการติดเชื้อแบคทีเรียในลำไส้เช่นเดียวกับเงื่อนไขที่รุนแรงมากขึ้นเช่นโรคระบาด หนึ่งในสมาชิกที่โด่งดังที่สุดของครอบครัวคือ Escherichia coli แบคทีเรียที่ได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางในห้องทดลองทั่วโลก
แบคทีเรียเหล่านี้มีรูปร่างเป็นแท่งตามกำลังขยายและเป็นแกรมลบ หลายคนเป็นแบบไม่ใช้ออกซิเจนซึ่งเป็นลักษณะที่ช่วยให้พวกเขาเจริญเติบโตในสภาพแวดล้อมของลำไส้และส่วนใหญ่ผลิตพลังงานโดยการกินน้ำตาลและเปลี่ยนเป็นกรดแลกติก สมาชิกของครอบครัวนี้บางคนสามารถอาศัยอยู่ในลำไส้โดยไม่ก่อให้เกิดปัญหาสุขภาพในบุคคลที่มีสุขภาพดีในขณะที่คนอื่น ๆ มักจะทำให้เกิดสัญญาณของการติดเชื้อรวมถึงอาเจียนท้องเสียและอาการที่เกี่ยวข้อง
มีการระบุอย่างน้อย 40 สกุลในตระกูลนี้ ได้แก่ Salmonella, Proteus, Serratia, Enterobacter, Citrobacter, Pseudomonas และ Klebsiella ผู้คนมักติดเชื้อแบคทีเรียในลำไส้เนื่องจากสุขอนามัยที่ไม่ดีและการติดต่อกับผู้ที่มีเชื้ออยู่ การปรุงอาหารอย่างละเอียดมักจะสามารถป้องกันการติดเชื้อได้เช่นสามารถสังเกตโปรโตคอลการล้างมือขั้นพื้นฐานและรักษาสภาพแวดล้อมที่สะอาดในห้องครัวและรอบห้องน้ำ
นอกจากจะพบได้ในลำไส้ของมนุษย์แบคทีเรียในลำไส้ก็ยังมีชีวิตอยู่ในสัตว์รวมถึงสัตว์ที่มนุษย์เลี้ยงไว้เพื่อเป็นเนื้อสัตว์และผลิตภัณฑ์เช่นไข่และนม การปนเปื้อนข้ามของผลิตภัณฑ์จากสัตว์สามารถเกิดขึ้นได้ทำให้แบคทีเรียเหล่านี้เข้าสู่แหล่งอาหาร ต้องขอบคุณวิธีการจัดจำหน่ายที่กว้างขวางซึ่งใช้โดย บริษัท หลายแห่งในอุตสาหกรรมจึงเป็นไปได้ที่แบคทีเรียในลำไส้จะแพร่กระจายไปทั่วภูมิภาคเนื่องจากผลิตภัณฑ์ถูกส่งไปยังร้านขายของชำร้านอาหารและสถานที่บรรจุอาหารหลายแห่ง สิ่งนี้สามารถทำให้การแพร่ระบาดยากที่จะระบุและควบคุม
แบคทีเรียในลำไส้บางตัวสามารถควบคุมได้ด้วยการใช้ยาปฏิชีวนะและยาอื่น ๆ ที่โจมตีแบคทีเรียในลำไส้ การใช้ยาปฏิชีวนะอย่างแพร่หลายทั้งในคนและสัตว์ที่ใช้เป็นอาหารนำไปสู่การพัฒนาความต้านทานยาปฏิชีวนะอย่างไรก็ตามแบคทีเรียที่ได้รับอนุญาตให้พัฒนาความสามารถในการอยู่รอดแม้ยาปฏิชีวนะในปริมาณที่สูง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง E. coli ได้พัฒนาสายพันธุ์ที่มีความรุนแรงจำนวนมากซึ่งทำให้เกิดความกังวลในวงการแพทย์เนื่องจากบางสายพันธุ์เหล่านี้ไม่สามารถรักษาด้วยยาที่มีขายในตลาด
