การทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนเป็นวิธีการวัดระดับกิจกรรมของยีนนับพันในเวลาเดียวกัน การระบุรูปแบบการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตเป็นขั้นตอนต่อไปหลังจากลำดับจีโนมของสิ่งมีชีวิต การทดลองทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนนั้นมักทำกับจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตในคราวเดียว การวัดระดับการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตให้ภาพของการทำงานของเซลล์ของสิ่งมีชีวิตในช่วงวัฏจักรของเซลล์หรือเพื่อตอบสนองต่อสิ่งเร้าที่เฉพาะเจาะจง
ยีนของสิ่งมีชีวิตสามารถอยู่ในสถานะหนึ่งในสองสถานะ: เปิดหรือปิด เมื่อเปิดใช้งานยีนมันจะถูกถ่ายลงใน messenger RNA ซึ่งให้คำแนะนำในการสร้างโปรตีนที่ถูกเข้ารหัสโดยยีน เมื่อเปิดสวิตช์ยีนจะถูกแสดงออกมา เมื่อยีนถูกปิดมันจะไม่ถูกคัดลอกไปยัง mRNA และจะไม่ถูกแสดงออกมา
DNA ของสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวที่มียีนนับพัน แต่มีเพียงส่วนของยีนเหล่านั้นที่เปิดอยู่ตลอดเวลา รูปแบบของการแสดงออกของยีนภายในเซลล์ ณ เวลาใดเวลาหนึ่งเรียกว่าโปรไฟล์ของยีน การดูประเภทของยีนที่เปิดอยู่ในเซลล์สามารถให้ข้อมูลจำนวนมากเกี่ยวกับเซลล์และสิ่งมีชีวิต
ในการทดสอบการทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนเทคโนโลยี DNA microarray ถูกนำมาใช้เพื่อให้ได้การวัดกิจกรรมสัมพัทธ์ของยีนที่มีลำดับก่อนหน้านี้ การทดลองเหล่านี้มักจะเกี่ยวข้องกับการวัดปริมาณของ mRNA ในการตั้งค่าการควบคุมและในการตั้งค่าการทดลองเพื่อกำหนดผลกระทบของหนึ่งหรือหลายตัวแปรที่มีต่อการแสดงออกของยีน การใช้ตัวควบคุมมีความสำคัญเนื่องจากมันกำหนดระดับ mRNA พื้นฐานสำหรับเงื่อนไขเซลล์ปกติ
ดูว่าระดับ mRNA เปลี่ยนแปลงอย่างไรในการตอบสนองต่อสิ่งเร้าแสดงให้เห็นว่าความต้องการเซลล์สำหรับโปรตีนเปลี่ยนแปลงอย่างไรเพื่อตอบสนองต่อสภาพแวดล้อมใหม่ ข้อมูลนี้มีประโยชน์สำหรับวัตถุประสงค์ในการวิจัยล้วนๆ แต่ก็มีความสำคัญในทางการแพทย์เช่นกัน ตัวอย่างเช่นหากมีการใช้เซลล์มะเร็งเต้านมใน DNA microanalysis โปรไฟล์อาจแสดงให้เห็นว่าในเซลล์มะเร็งเต้านมตัวรับบางประเภททำงานอยู่ซึ่งปกติแล้วจะไม่ทำงาน หากผู้รับแสดงว่าเป็นมะเร็งโดยเฉพาะมันอาจพิสูจน์ว่าเป็นเป้าหมายยาที่มีประสิทธิภาพ
ในความเป็นจริงแล้วการจัดทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนได้ถูกนำมาใช้เป็นมาตรการในการพยากรณ์โรคมะเร็งเต้านม สิ่งนี้มีประโยชน์เพราะผู้หญิงในระยะเดียวกันของโรคสามารถตอบสนองต่อการรักษาแตกต่างกันมากและมีการพยากรณ์โรคที่แตกต่างกันมาก การใช้ DNA microanalysis เพื่อสร้างโปรไฟล์การแสดงออกของยีนแสดงให้เห็นอย่างน้อยหนึ่งการศึกษาว่าโปรไฟล์การแสดงออกของยีนบางอย่างในเซลล์มะเร็งเต้านมมีความสัมพันธ์กับการพยากรณ์โรคที่ไม่ดี การประยุกต์ใช้เทคโนโลยีการทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนนี้ช่วยระบุผู้หญิงที่อาจได้รับประโยชน์จากการรักษาที่ก้าวร้าวมากขึ้น
