การวิเคราะห์ DNA microarray ใช้ในอณูชีววิทยาและเวชภัณฑ์วินิจฉัยเพื่อตรวจสอบว่ายีนใดในเซลล์ที่เปิดอยู่ ณ เวลาใดเวลาหนึ่ง เทคนิคนี้เรียกว่าการทดสอบมัลติเพล็กซ์เพราะสามารถวัดตัวอย่างหลายพันตัวอย่างในการทดสอบครั้งเดียว เทคนิค microanalysis ดีเอ็นเอใช้ในการตีความข้อมูลจากการตรวจสอบที่ดำเนินการใน RNA เช่นเดียวกับ DNA ขึ้นอยู่กับข้อกำหนดเฉพาะของการทดลอง
พื้นฐานของการวิเคราะห์ DNA microarray คือความจำเพาะสูงของโมเลกุล DNA และความสามารถในการเลือกลำดับที่ไม่ซ้ำของ DNA เพื่อแสดงถึงยีนที่เฉพาะเจาะจง การทดลองวิเคราะห์แบบ microarray ดำเนินการบนพื้นผิวของแข็งที่ทำจากชิปแก้วหรือซิลิโคนซึ่งวางเมทริกซ์ทางเคมี บนพื้นผิวของเมทริกซ์ DNA หรือโพรบอาร์เอ็นเอจะเรียงกันเป็นแถวอย่างเป็นระเบียบ
เมื่อชิปถูกตั้งค่าด้วยโพรบที่จำเป็นแล้วเซลล์ที่กำลังศึกษาจะถูกเตรียมไว้ ในการจัดเตรียมเซลล์พวกมันจะต้องถูกเปิดทิ้งเพื่อให้สามารถแยกกรดนิวคลีอิกที่มีอยู่ออกมาได้ ชุดสารรีเอเจนต์ถูกเพิ่มเข้ามาเพื่อสกัดและรวมกรดนิวคลีอิกที่มีอยู่ภายในเซลล์ ถัดไปสารสกัดกรดนิวคลีอิกจะถูกเพิ่มเข้าไปในชิปซึ่งเหลือเวลาอีกหลายชั่วโมงเพื่อให้เวลาสำหรับโพรบในการโต้ตอบและผูกกับกรดนิวคลีอิกของเซลล์ ในที่สุดชุดรีเอเจนต์ต่อไปจะถูกเพิ่มเข้าไปในชิปเพื่อระบุตำแหน่งที่กรดนิวคลีอิกของเซลล์ยึดติดกับโพรบ
การวิเคราะห์ Microarray นั้นใช้เพื่อพิจารณาว่าโพรบชนิดใดที่สามารถตรวจจับกรดนิวคลีอิกของเซลล์ นี่คือการวิเคราะห์ที่ซับซ้อนเนื่องจากชิปเดียวอาจมีโพรบที่ไม่ซ้ำกันหลายหมื่นรายการ ลำดับของโพรบบนชิปจะถูกเก็บไว้ในฐานข้อมูลคอมพิวเตอร์เพื่อให้ได้ผลลัพธ์ที่ง่ายดาย การใช้ชิปและฐานข้อมูลนักวิทยาศาสตร์สามารถพัฒนารายการของยีนที่ผูกติดกับโพรบดังนั้นจึงมีอยู่ในสารสกัดเซลล์ดั้งเดิม
เทคนิคการวิเคราะห์แบบ microarray มักใช้ในการทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีน ในการทดลองประเภทนี้ไมโครเรย์ได้รับการจัดตั้งขึ้นเพื่อตรวจสอบรูปแบบการแสดงออกของยีนในเซลล์ โพรบสำหรับยีนที่น่าสนใจจะรวมอยู่ใน microarray และเมื่อการทดลองเสร็จสิ้นการวิเคราะห์ข้อมูล microarray สามารถกำหนดได้ว่าจะเปิดยีนใดของยีนที่ทำการศึกษาในเวลาใดเวลาหนึ่ง
การใช้งานอื่น ๆ สำหรับเทคนิคนี้รวมถึงการเปรียบเทียบจีโนมิกไฮบริดและการตรวจสอบ SNP การเปรียบเทียบจีโนมลูกผสมคือการทดสอบที่ตรวจสอบเนื้อหาจีโนมในเซลล์ของสิ่งมีชีวิตที่เกี่ยวข้อง การทดสอบประเภทนี้ให้ข้อมูลเกี่ยวกับความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างสปีชีส์ต่าง ๆ
การตรวจหา SNP เป็นเทคนิคที่สามารถใช้ในการวิเคราะห์ทางนิติเวชการวิเคราะห์การเชื่อมโยงทางพันธุกรรมและการประเมินความเสี่ยงของโรคทางพันธุกรรม SNPs เป็น polymorphisms แบบนิวคลีโอไทด์เดี่ยวซึ่งตั้งอยู่บนจีโนมซึ่งมีสองลำดับเบสคู่ที่เป็นไปได้ SNP สามารถให้ข้อมูลทางพันธุกรรมที่มีประโยชน์มากมายเนื่องจากข้อเท็จจริงที่ว่ารูปแบบ SNP ที่แตกต่างกันนั้นมีอยู่ในประชากรชาติพันธุ์และภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน
