อณูวิทยาภูมิคุ้มกันวิทยาเป็นสาขาย่อยของภูมิคุ้มกันวิทยาที่มีวัตถุประสงค์เพื่อตรวจสอบกระบวนการภูมิคุ้มกันในระดับโมเลกุล ระบบภูมิคุ้มกันเป็นระบบของร่างกายที่ตอบสนองต่อสิ่งแปลกปลอมเช่นแบคทีเรียหรือสารติดเชื้ออื่น ๆ ในร่างกาย การตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่หน่วยงานต่างประเทศเรียกนั้นมีแนวโน้มที่จะมีความเฉพาะเจาะจงสูง ร่างกายผลิตแอนติบอดีที่ออกแบบมาโดยเฉพาะเพื่อกำหนดเป้าหมายแอนติเจนเฉพาะหรือสิ่งแปลกปลอมที่กระตุ้นการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันเช่นเดียวกับล็อคเดียวมีแนวโน้มที่จะจับคู่กับคีย์เดียว สาขาวิชาภูมิคุ้มกันวิทยาโมเลกุลมีอยู่เพื่อตรวจสอบเรื่องนี้และด้านอื่น ๆ ของการตอบสนองของภูมิคุ้มกันที่ถูกควบคุมในระดับโมเลกุล
เป้าหมายของการตรวจทางอณูชีววิทยานั้นแตกต่างกันไปและเทคนิคต่าง ๆ ในสนามก็ถูกนำมาใช้ทั้งในห้องปฏิบัติการและทางคลินิก ความเข้าใจที่มากขึ้นเกี่ยวกับระดับโมเลกุลของการทำงานของระบบภูมิคุ้มกันช่วยให้การวินิจฉัยและการรักษาที่ตรงเป้าหมายและมีประสิทธิภาพยิ่งขึ้นสำหรับโรคบางชนิด มันยังให้วิธีการทดลองใหม่ ๆ มากมายที่จะใช้ในห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยาและอณูวิทยาภูมิคุ้มกัน ระดับสูงของความจำเพาะของแอนติบอดีเป็นสิ่งสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากแอนติบอดีสามารถผลิตเพื่อกำหนดเป้าหมายเกือบทุกองค์ประกอบทางชีวภาพที่น่าสนใจ ดังนั้นจึงสามารถใช้เพื่อ "แท็ก" ส่วนประกอบโทรศัพท์มือถือบางอย่างหรือเพื่อตรวจสอบว่ามีสารเฉพาะอยู่ในตัวอย่างหรือไม่เพราะพวกมันจะจับกับแอนติเจนที่น่าสนใจโดยเฉพาะ
ปฏิกิริยาระหว่างแอนติบอดีและแอนติเจนนั้นเป็นหัวใจสำคัญของภูมิคุ้มกันในระดับโมเลกุลและภูมิคุ้มกันโดยรวม เซลล์ของระบบภูมิคุ้มกันต่าง ๆ มีตัวรับที่จับกับแอนติเจนในร่างกายและกระตุ้นการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน แอนติบอดีมีการผลิตด้วยขอบเขตการยึดเหนี่ยวของโมเลกุลที่ปรับให้เหมาะกับแอนติเจนที่น่าสนใจ พวกเขามักจะไม่ผูกกับสิ่งที่นอกเหนือจากแอนติเจนที่พวกเขาทำเพื่อเป้าหมาย ส่วนประกอบของระบบภูมิคุ้มกันยังสามารถระบุและโจมตีเซลล์ที่ถูกบุกรุกเช่นในกรณีของไวรัส
นอกจากโรคที่ระบบภูมิคุ้มกันต่อสู้แล้วสาขาวิชาภูมิคุ้มกันวิทยาโมเลกุลยังสนใจในโรคและความผิดปกติที่ส่งผลกระทบต่อระบบภูมิคุ้มกันด้วยเช่นกัน ในกรณีของโรคแพ้ภูมิตัวเองระบบภูมิคุ้มกันจะกำหนดเป้าหมายเซลล์ "ตัวเอง" แทนแอนติเจน ในความผิดปกติอื่น ๆ และโรคบางอย่างประสิทธิภาพของระบบภูมิคุ้มกันจะลดลงจึงทำให้เกิดภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่อง การรับรู้ของแอนติเจนถูกขับเคลื่อนด้วยกลไกระดับโมเลกุลที่เฉพาะเจาะจงและแม้แต่การเปลี่ยนแปลงเล็กน้อยในความสอดคล้องของโครงสร้างของแอนติเจนสามารถมีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญต่อการตอบสนองของภูมิคุ้มกัน นักวิทยาศาสตร์ที่ทำงานเกี่ยวกับอณูวิทยาภูมิคุ้มกันหวังว่าความเข้าใจที่ดีขึ้นเกี่ยวกับพื้นฐานของอณูวิทยาของภูมิคุ้มกันจะช่วยให้พวกเขาต่อสู้กับโรคและความผิดปกติอื่น ๆ ได้ดีขึ้น
