ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนเป็นกระบวนการทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับพันธะของโปรตีนสองตัวหรือมากกว่า พันธะโปรตีนเหล่านี้เป็นส่วนสำคัญของการทำงานของเซลล์ของสิ่งมีชีวิตทุกชนิดและมักจำเป็นสำหรับโปรตีนในการทำหน้าที่เฉพาะของพวกเขา การทำงานของเซลล์เหล่านี้รวมถึงกระบวนการที่สำคัญเช่นการจำลองดีเอ็นเอซึ่งอำนวยความสะดวกโดยโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนซึ่งเป็นผลมาจากการมีปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน กระบวนการนี้ยังเป็นแกนหลักของการไกล่เกลี่ยเซลลูลาร์จำนวนมากและฟังก์ชั่นการส่งสัญญาณ พันธบัตรโปรตีนอาจมีหลายรูปแบบรวมถึงพันธบัตรที่ซับซ้อนในระยะยาวและการขนส่งโปรตีนระยะสั้นหรือความสัมพันธ์ในการปรับเปลี่ยนโปรตีน
โปรตีนเป็นสารประกอบที่เกิดขึ้นตามธรรมชาติซึ่งประกอบด้วยการจัดเรียงเชิงเส้นของกรดอะมิโน สารประกอบเหล่านี้เป็นส่วนหนึ่งของโครงสร้างพื้นฐานทางชีวภาพที่จำเป็นที่สุดสำหรับสิ่งมีชีวิตทุกชนิด กลุ่มอาคารเหล่านี้มีฟังก์ชั่นที่สำคัญมากมายในระดับเซลลูล่าร์ด้วยตนเองหรือเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มโปรตีนขนาดใหญ่ที่ถูกผูกมัด คอมเพล็กซ์ที่รู้จักกันทั่วไปในนามของสารประกอบที่ถูกพันธะโดยการปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนนี้มีหน้าที่รับผิดชอบการทำงานของเซลล์ที่สำคัญเช่นการจำลองดีเอ็นเอการส่งสัญญาณระหว่างเซลล์การดัดแปลงโปรตีนและการขนส่ง การศึกษากลไกของพันธะโปรตีนยังช่วยปรับปรุงความสามารถของนักวิจัยในการทำความเข้าใจและต่อสู้กับโรคต่าง ๆ ที่ยังคงก่อให้เกิดภัยพิบัติต่อมนุษยชาติ
หนึ่งในฟังก์ชั่นการโต้ตอบของโปรตีนที่สำคัญที่สุดอย่างหนึ่งคือการส่งสัญญาณ สัญญาณทางเคมีที่เกิดจากภายนอกเซลล์มักจะถูกสื่อกลางหรือถ่ายโอนไปยังด้านในผ่านกลไกของโปรตีน / โปรตีนเชิงซ้อน การถ่ายโอนสัญญาณเหล่านี้มีความสำคัญต่อกระบวนการเซลล์มากมายและมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของโรคเช่นมะเร็ง พันธะปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนบางตัวมีบทบาทในการขนส่งโดยมีโปรตีนตัวหนึ่งที่เอื้อต่อการเคลื่อนที่ของโปรตีนจากนอกเซลล์สู่นิวเคลียส สิ่งที่ตรงกันข้ามก็เป็นจริงเช่นกันในกรณีของรูขุมขนนิวเคลียร์เช่นคอมเพล็กซ์โปรตีนขนาดใหญ่ซึ่งย้ายจากจุดศูนย์กลางของเซลล์ไปสู่ด้านนอกผ่านผลกระทบของการมีปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน
หน้าที่สำคัญอีกอย่างหนึ่งของการทำงานร่วมกันของโปรตีนคือกระบวนการดัดแปลงโปรตีนไคเนส กระบวนการนี้เกี่ยวข้องกับการเติมฟอสเฟตหลายกลุ่มเข้ากับโปรตีนหนึ่งโดยอีกกลุ่มหนึ่งในคอมเพล็กซ์ สารประกอบที่ได้รับการดัดแปลงเหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการไกล่เกลี่ยสัญญาณระหว่างเซลล์ด้วยประมาณ 30 เปอร์เซ็นต์ของโปรตีนมนุษย์ทั้งหมดที่ถูกแก้ไขโดยไคเนสที่ทำปฏิกิริยากับโปรตีน การโต้ตอบระยะสั้นเหล่านี้บางครั้งใช้เวลาเพียงนาโนวินาทีในการทำให้เสร็จ กระบวนการพันธะโปรตีนอื่น ๆ นั้นเป็นธรรมชาติในระยะยาวโดยบางคนใช้เวลาหลายชั่วโมงหรือหลายวันกว่าจะเสร็จสมบูรณ์
