วิทยาศาสตร์การแพทย์หมายถึงยาประเภทหนึ่งที่พัฒนาขึ้นในช่วงไม่กี่ศตวรรษที่ผ่านมาและกลายเป็นสิ่งที่เรารู้จักกันในปัจจุบันว่าเป็นยารักษาโรคทั่วไปตั้งแต่ศตวรรษที่ 19 เป็นต้นไป ยาแผนปัจจุบันที่เรียกว่าขึ้นอยู่กับการสังเกตทางวิทยาศาสตร์สำหรับการรักษาและความเข้าใจในร่างกายมนุษย์ การค้นพบทฤษฎีของเชื้อโรคและสาเหตุของโรคติดเชื้อเป็นความก้าวหน้าครั้งสำคัญสำหรับยาวิทยาศาสตร์ ก่อนที่จะมีการจัดตั้งวิทยาศาสตร์การแพทย์ความหลากหลายของวิธีการแพทย์อยู่ในสมัยนิยมเช่นเลือดออกและการชำระล้าง แต่ด้วยการปรากฎตัวของการรักษาด้วยหลักฐานเชิงประจักษ์ ศูนย์กลางการแพทย์ทางวิทยาศาสตร์คือการศึกษาและคุณสมบัติของแพทย์ตามมาตรฐานทางวิทยาศาสตร์
ความก้าวหน้าทางเทคโนโลยีในด้านการแพทย์ในศตวรรษที่ 19 มีส่วนช่วยอย่างมากต่อความเข้าใจของโรคในร่างกายมนุษย์ กล้องจุลทรรศน์ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถระบุและอธิบายเซลล์และค้นหาว่าเซลล์ใดผิดปกติในโรค อุปกรณ์ที่ยังคงใช้อยู่ในปัจจุบันในบางรูปแบบเช่นเครื่องฟังเสียงและเครื่องเอ็กซเรย์ถูกคิดค้น เภสัชวิทยาการศึกษาและการผลิตยาได้กลายเป็นเชิงพาณิชย์มากขึ้นกว่าเดิมเนื่องจากการสังเคราะห์สารเคมีและกระบวนการปรับแต่งใหม่ในช่วงการปฏิวัติอุตสาหกรรม
เทคนิคห้องปฏิบัติการเช่นการวิเคราะห์ด้วยกล้องจุลทรรศน์และการทดสอบทางเคมีของสารเช่นปัสสาวะก็เป็นประโยชน์สำหรับแพทย์ในช่วงเวลานี้ สรีรวิทยาซึ่งเป็นการศึกษาว่าร่างกายทำงานอย่างไรได้ช่วยกระบวนการนี้เช่นกัน ทฤษฎีของเชื้อโรคซึ่งยอมรับว่าสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กที่ก่อให้เกิดโรคติดเชื้อนั้นเป็นอีกส่วนหนึ่งที่สำคัญของวิธีการทางการแพทย์ทางวิทยาศาสตร์ แพทย์ก็เริ่มให้ความสนใจในการทดลองทางการแพทย์มากขึ้นและบันทึกความพยายามและผลลัพธ์สำหรับผู้เชี่ยวชาญทางการแพทย์คนอื่น ๆ
ระบบการตรวจสอบประสิทธิภาพของการรักษาโดยเฉพาะที่เรียกว่าวิธีการเชิงตัวเลขได้รับการพัฒนาในช่วงศตวรรษที่ 19 ด้วยเช่นกัน ผลลัพธ์ของการรักษาเฉพาะสามารถวิเคราะห์ได้จากสถิติและจากนั้นแพทย์จะเห็นว่าการรักษานั้นมีประโยชน์ไร้ประโยชน์หรือเป็นอันตรายหรือไม่ วิธีการตรวจสอบหลักฐานนี้ซึ่งมีความสำคัญต่อการวิจัยทางคลินิกที่ทันสมัยหมายความว่าก่อนหน้านี้ตัวเลือกการรักษาทั่วไปเช่นการปล่อยให้เลือดถูกทิ้งและแทนที่ด้วยการรักษาที่แพทย์สามารถแสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพสำหรับ
แม้ว่าความก้าวหน้าเหล่านี้ต่อยาวิทยาศาสตร์ยังคงดำเนินต่อไปในช่วงศตวรรษที่ 19 แต่ก็ยังไม่มีวุฒิการศึกษาเดียวในแต่ละประเทศที่สามารถผลิตแพทย์ที่ทำงานตามการแพทย์แบบใช้หลักฐานเชิงประจักษ์ องค์กรระดับมืออาชีพของแพทย์ที่เชื่อในวิทยาศาสตร์การแพทย์มากกว่ายาประเภทอื่น ๆ ชักชวนให้คนที่ฝึกฝนเป็นหมอให้มีคุณสมบัติ หน่วยงานของรัฐในประเทศที่สมัครใช้วิธีการทางวิทยาศาสตร์ได้สร้างกระดานออกใบอนุญาตทางการแพทย์และอนุมัติเฉพาะสถาบันการศึกษาที่สามารถให้การศึกษาและการสอบที่จำเป็นแก่นักเรียนเท่านั้น
การทำให้เป็นมาตรฐานหมายความว่าผู้ที่ใช้ยาที่มีหลักฐานเชิงประจักษ์น้อยไม่สามารถเรียกตัวเองว่าหมอหรือเป็นแพทย์ ในยุคปัจจุบันยาวิทยาศาสตร์เป็นที่รู้จักกันว่ายาทั่วไป อุตสาหกรรมการดูแลสุขภาพแบบครบวงจรและการแพทย์ทางเลือก (CAM) ไม่จำเป็นต้องใช้กฎเดียวกับวิธีการทางวิทยาศาสตร์และอาจไม่มีวิธีการที่ใช้หลักฐานเชิงประจักษ์เหมือนกับยา
