การคัดแยกอสุจิเป็นวิธีการโต้เถียงของการเลือกเพศก่อนปฏิสนธิ มันแยกตัวอสุจิ Y ตัวผู้ออกจากตัวอสุจิ X ตัวเมียเพื่อเพิ่มโอกาสในการตั้งครรภ์เพศใด ๆ มันมักจะถูกจับคู่กับวิธีการเลือกเพศอื่น ๆ เช่นการวินิจฉัยทางพันธุกรรมก่อนการฝัง (PGD) ก่อนที่จะฝังในแม่ มันถูกใช้ครั้งแรกในสัตว์เพื่อวัตถุประสงค์ในการผลิตและมันถูกใช้อย่างแพร่หลายเพื่อเพิ่มจำนวนวัว ไม่นานหลังจากนั้นศักยภาพในการสืบพันธุ์ของมนุษย์ได้รับการยอมรับ
ปัจจุบันมีวิธีการคัดแยกอสุจิหลายวิธี หนึ่งในวิธีการแบบเก่าที่ยังคงใช้ในปี 2011 คือเทคโนโลยี Beltfield Sperm Sexing ซึ่งใช้การผสมผสานของสีย้อมเรืองแสงและค่าไฟฟ้าเพื่อแยกเพศทั้งสอง อีกวิธีหนึ่งที่ในปี 2011 แสดงให้เห็นผลลัพธ์การเรียงลำดับตัวอสุจิที่แม่นยำที่สุดคือด้วยเทคโนโลยีMicrosort®ซึ่งใช้สีย้อมเรืองแสงและเทคโนโลยีเลเซอร์ แม้ว่าจะมีวิธีการเพิ่มเติม แต่ทั้งสองวิธีดังกล่าวแสดงให้เห็นว่ามีประสิทธิภาพมากที่สุดในปี 2554
ไม่มีวิธีใดที่รับประกันได้ว่าการเรียงลำดับจะเป็น 100% ของอสุจิเพศใดเพศหนึ่งโดยเฉพาะ ค่าเฉลี่ยของวิธี Beltfield นั้นมีอัตราความเข้มข้น 90% พร้อม X-sperm และ 75% กับ Y-sperm วิธีการMicrosort®มีอัตราความสำเร็จ 91% สำหรับผู้หญิงและ 76% สำหรับผู้ชาย ในปี 2011 วิธีการอื่น ๆ เช่นวิธี Ericsson ที่ได้รับความนิยมยังคงไม่มีหลักฐานที่แท้จริงว่าอัตราความเข้มข้นมีการเปลี่ยนแปลงเกินกว่า 50%
แม้ว่าการคัดแยกอสุจิจะดำเนินการก่อนการปฏิสนธิและการปฏิสนธิ แต่มีหลายคนที่กังวลเกี่ยวกับความหมายของการเลือกเพศ หลายคนกลัวว่าอาจใช้เพื่อตั้งครรภ์เฉพาะเพศที่ชื่นชอบเช่นในประเทศจีนและอินเดียซึ่งเป็นที่ต้องการของเด็กผู้ชาย นอกจากนี้บางคนกังวลว่ามันจะสร้างการรับรู้ที่สูงขึ้นให้กับเพศของเด็กในพื้นที่ที่ไม่ต้องการเพศที่โดดเด่น คนอื่น ๆ ก็ยังคิดว่าการจัดเรียงตัวอสุจิเป็นรูปแบบของการจัดการกับธรรมชาติและปัญหาทางศีลธรรม
มีเหตุผลในการจัดเรียงตัวอสุจิที่อาจพิจารณาว่าถูกต้องและมีการระบุไว้ในระเบียบการคัดแยกตัวอสุจิโดยองค์การอาหารและยา (FDA) ในสหรัฐอเมริกา เหตุผลหลักคือเพื่อป้องกันปัญหาทางพันธุกรรมที่เชื่อมโยงกับเพศเช่นโรครังไข่ polycystic ในเพศหญิง เหตุผลรองที่ได้รับอนุญาตจากองค์การอาหารและยาคือการรักษาครอบครัวที่สมดุลหมายความว่าครอบครัวต้องการมีเพศชายและเพศหญิงจำนวนเท่ากัน
