การระบุแบคทีเรียเป็นกระบวนการที่ใช้ในการระบุตัวตนของแบคทีเรียที่เฉพาะเจาะจง มันเป็นส่วนสำคัญของการรักษาทางการแพทย์เนื่องจากการรักษาจำนวนมากขึ้นอยู่กับเอกลักษณ์ของสิ่งมีชีวิตเฉพาะที่ก่อให้เกิดปัญหาทางการแพทย์และเป็นส่วนสำคัญของการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ มีการใช้เทคนิคหลายอย่างในการระบุแบคทีเรียและเทคนิคใหม่ ๆ ถูกคิดค้นขึ้นอย่างต่อเนื่องเนื่องจากผู้คนเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับแบคทีเรียและพัฒนาเครื่องมือทางการแพทย์ใหม่ ๆ
ขั้นตอนแรกในการระบุแบคทีเรียเกี่ยวข้องกับการสร้างไอโซเลตซึ่งเป็นตัวอย่างการทำงานของแบคทีเรียที่เป็นปัญหา ตัวแยกเริ่มต้นด้วยไม้กวาดเล็ก ๆ ของแบคทีเรียที่สงสัยว่านำมาจากผู้ป่วยหรือวัตถุ ตัวแยกถูกสร้างขึ้นโดยการหาสื่อการเจริญเติบโตซึ่งจะสนับสนุนแบคทีเรียและประสบความสำเร็จในการเลี้ยงเชื้อแบคทีเรียที่เพียงพอสำหรับการศึกษา นี่อาจเป็นความท้าทายอย่างแท้จริงเนื่องจากแบคทีเรียนั้นค่อนข้างพิถีพิถันและพวกมันจะไม่เติบโตในระดับปานกลาง สิ่งสำคัญเช่นกันคือการหลีกเลี่ยงการปนเปื้อนของสื่อการเจริญเติบโตหรือตัวอย่างเนื่องจากอาจทำให้เกิดผลลัพธ์ที่สับสน
เมื่อเพาะเชื้อแบคทีเรียแล้วเครื่องมือที่หลากหลายสามารถนำมาใช้เพื่อระบุเงื่อนงำในตัวตนของมัน หนึ่งในขั้นพื้นฐานที่สุดคือคราบแกรมซึ่งแบ่งแบคทีเรียออกเป็นแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบด้วยการใช้คราบเคมี คราบอื่น ๆ สามารถนำมาใช้เพื่อเพิ่มความคมชัดทำให้แบคทีเรียมองเห็นได้ง่ายขึ้นภายใต้กล้องจุลทรรศน์ การระบุภาพด้วยกล้องจุลทรรศน์สามารถทำได้โดยใช้แบคทีเรียที่คุ้นเคยโดยเฉพาะที่มีรูปร่างที่โดดเด่น
มีเครื่องมือเพิ่มเติมในคลังแสงประจำตัวของแบคทีเรีย นักวิจัยสามารถใช้วิธีการทางเซรุ่มวิทยาซึ่งเกี่ยวข้องกับการเปิดเผยตัวอย่างของแบคทีเรียที่ไม่รู้จักกับแอนติบอดีต่างๆเพื่อดูว่ามีปฏิกิริยาหรือการเรียงลำดับของยีนซึ่งรหัสทางพันธุกรรมของแบคทีเรียจะถูกเปิดเผย การเรียงลำดับยีนสามารถใช้เพื่อแยกความแตกต่างระหว่างแบคทีเรียสองสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดโดยให้ข้อมูลว่าทำไมสายพันธุ์หนึ่งตอบสนองต่อการใช้ยาโดยเฉพาะในขณะที่อีกสายพันธุ์หนึ่งไม่ได้ อาจมีการศึกษาการตอบสนองต่อสารเคมีและสิ่งเร้าต่าง ๆ เช่นรังสีอัลตราไวโอเลต
การระบุแบคทีเรียดำเนินการแบบคลาสสิกในห้องปฏิบัติการเนื่องจากห้องปฏิบัติการมีอุปกรณ์ทางการแพทย์สารเคมีและเครื่องมือที่สามารถใช้ในการติดตามตัวตนของแบคทีเรีย ห้องปฏิบัติการบางแห่งมีความเชี่ยวชาญในการเพาะเลี้ยงและแยกแยะตัวอย่างจากโรงพยาบาลและคลินิกการแพทย์ในขณะที่ห้องอื่น ๆ มุ่งเน้นไปที่การวิจัยการระบุตัวอย่างของแบคทีเรียใหม่และไม่รู้จักเพื่อให้สามารถจำแนกได้ สภาพแวดล้อมในห้องปฏิบัติการได้รับการควบคุมอย่างเข้มงวดเพื่อป้องกันการปนเปื้อนและการติดเชื้อโดยไม่ตั้งใจของคนงานในห้องปฏิบัติการโดยเฉพาะอย่างยิ่งสิ่งมีชีวิตที่มีความรุนแรงที่ถูกศึกษาในห้องปฏิบัติการที่มีความปลอดภัยสูงซึ่งรวมถึงการป้องกันหลายชั้นสำหรับนักวิทยาศาสตร์
